Job Description P00803 Confidence 97.40% Date Thu Jan 5 10:56:51 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 84 % Identity 29% Template d1f39a_ SCOP info LexA/Signal peptidase LexA/Signal peptidase LexA-related Resolution 1.90

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		84	.	.	.	.	.	90	.	.							.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	F	Q	I	P	S	G	S	M	.	.	.	.	.	.	M	P	T	L	L	I	G	D	F	I	L	V	E	K	F	A	Y	G	I	K	D	P	I	Y	Q	K	T	L	I	E	T	G	H	P	K	R	G	D	I	V	V	F	K	Y	P	E	D	P	K	L	D	Y	I	K	R	A	V	G	L	P	G	D	K	V	T
Query Conservation											.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	L	E	V	E	G	N	S	M	T	A	P	T	G	S	K	P	S	F	P	D	G	M	L	I	L	V	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Q	A	V	E	P	G	D	F	C	I	A	R	.	.	L	G	G	D	E	F	T	F	K	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							S	S	T	T				T	T		S	S				T	T							T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S				T	T							.	.		T	T	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.			.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	D	P	V	S	K	E	L	T	I	Q	P	G	C	S	S	G	Q	A	C	E	N	A	L	P	V	T	Y	S	N	V	E	P	S	D	F	V	Q	T	F	S	R	R	N	G	G	E	A	T	S	G	F	F	E	V	P	K	N	E	T	K	E	N	G	I	R	L	S	E	R	K	E	T	L	G	D	V	T	H	R
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	L	T	V	P	I	A	Q	D	Q	V	G	M	Y	Y	Q	Q	P	G	Q	Q	L	A	T	W	I	V	P	P	G	Q	Y	F	M	M	G	D	N	R	D	N	S	A	D	S	R	Y	W	G	F	V	P	E	A	N	L	V	G	R	A	T	A	I	W	M	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	I	R	D	S	G	Q	V	F	L	Q	P	L	N	P	Q	Y	P	M	I	P	C	N	.	.	.	.	E	S	C	S	V	V	G	K	V	I	A	S	Q	W	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T							S	S	T	T	S						S	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Template SS confidence
																										194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.					.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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