Job Description P0ABC9 Confidence 98.52% Date Thu Jan 5 11:15:11 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 392 % Identity 15% Template c2xq2A_ PDB info PDB header:transport protein Chain: A: PDB Molecule:sodium/glucose cotransporter; PDBTitle: structure of the k294a mutant of vsglt Resolution 2.73 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		55	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.			.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.
Query SS confidence																																																		.	.
Query Sequence		G	W	Y	Y	L	L	A	A	T	L	Y	I	V	F	V	V	C	I	A	C	S	R	F	G	S	V	K	L	G	P	E	Q	S	K	P	E	F	S	L	L	S	W	A	A	M	L	F	A	.	.	A	G	I	G	I	D	L	M	F	F	S	V	A	E	P	V	T	Q	Y	M	Q	P	P	E	G	A	G	Q	T	I
Query Conservation																																																		.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	F	I	D	I	M	V	F	A	I	Y	V	A	I	I	I	G	V	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	V	S	L	P	W	W	A	V	G	A	S	L	I	A	A	N	I	S	A	E	Q	F	I	G	M	S	G	S	G	Y	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T														G	G	G	S	S														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
		133	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	A	A	R	Q	A	M	V	W	T	L	F	H	Y	G	L	T	G	W	S	M	Y	A	L	M	G	M	A	L	G	Y	F	S	Y	R	Y	N	L	P	L	T	I	R	S	A	L	Y	P	I	F	G	K	R	I	N	G	P	I	G	H	S	V	D	I	A	A	V	I	G	T	I	F	G	I	A	T	T	L	G	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																										.													.	.	.	.										.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																										.													.	.	.	.										.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	I	G	L	A	I	A	S	Y	E	W	M	S	A	I	T	L	I	I	V	G	K	Y	F	L	P	.	I	F	I	E	K	G	I	Y	T	I	P	E	.	.	.	.	F	V	E	K	R	F	N	K	K	.	.	.	L	K	T	I	L	A	V	F	W	I	S	L	Y	I	F	V	N	L	T	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	T		G	G	G	G																T				.					T	T			S				.	.	.	.						T				.	.	.																T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																										.													.	.	.	.										.	.	.
Template SS confidence
								80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.		.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.					.	.	.	120	.	.	.	.	.				.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.			.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
Predicted Secondary structure																																																																				.	.
Query SS confidence																																																																				.	.
Query Sequence		G	V	V	Q	L	N	Y	G	L	S	V	L	F	D	I	P	D	S	M	A	A	K	A	A	L	I	A	L	S	V	I	I	A	T	I	S	V	T	S	G	V	D	K	G	I	R	V	L	S	E	L	N	V	A	L	A	L	G	L	I	L	F	V	L	F	M	.	.	G	D	T	S	F	L	L	N	A	L	V	L
Query Conservation																																																																				.	.
Alig confidence																		.	.	.	.																						.																									.	.
Template Conservation																		.	.	.	.																						.
Template Sequence		V	L	Y	L	G	G	L	A	L	E	T	I	L	G	I	P	.	.	.	.	L	M	Y	S	I	L	G	L	A	L	F	A	L	V	Y	S	I	Y	G	G	V	.	V	W	T	D	V	I	Q	V	F	F	L	V	L	G	G	F	M	T	T	Y	M	A	V	S	F	I	G	G	T	D	G	W	F	A	G	V	S	K
Template Known Secondary structure																		.	.	.	.																		T	T			.																												G	G	G
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.																						.
Template SS confidence
		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.					.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.		.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		N	V	G	D	Y	V	N	R	F	M	G	M	T	L	N	S	F	A	F	D	R	P	V	E	W	M	N	N	W	T	L	F	F	W	A	W	W	V	A	W	S	P	F	V	G	L	F	L	A	R	I	S	R	G	R	T	I	R	Q	F	V	L	G	T	L	I	I	P	F	T	F	T	L	L	W	L	S	V	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence																																																																																.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	V	D	A	A	P	G	H	F	E	M	I	L	D	Q	S	N	P	Q	Y	M	N	L	P	G	I	A	V	L	I	G	G	L	W	V	A	N	L	Y	Y	W	G	F	N	Q	Y	I	I	Q	R	T	L	A	A	K	S	V	S	E	A	Q	K	G	I	V	F	A	A	F	L	A	L	I	V	P	F	L	V	V	L
Template Known Secondary structure							G	G	G	S		S	S			S	S	S	G	G	G	G	T	S		T	T					S	T										T	T	T		S							T	T	S																T	T	T						T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
				369	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440						.
Predicted Secondary structure		.	.																																																																									.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																																																																									.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	F	G	N	S	A	L	Y	E	I	I	H	G	G	A	A	F	A	E	E	A	M	V	H	P	E	R	G	F	Y	S	L	L	A	Q	Y	P	A	F	T	F	S	A	S	V	A	T	I	T	G	L	L	F	Y	V	T	S	A	D	S	G	A	L	V	L	G	N	F	T	S	Q	L	K	.	.	.	.	.	D
Query Conservation		.	.																																																																									.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																																				.																																					.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.
Template Sequence		P	G	I	A	A	Y	V	I	T	S	D	P	Q	L	M	A	S	L	G	N	L	P	S	A	A	N	A	D	K	A	Y	P	W	L	T	Q	F	.	L	P	V	G	V	K	G	V	V	F	A	A	L	A	A	A	I	V	S	S	L	A	S	M	L	N	S	T	A	T	I	F	T	M	D	I	Y	K	E	Y	I	S
Template Known Secondary structure											T														S	T	B	G	G	G								T	.	S																																			T					T
Template Predicted Secondary structure																																							.
Template SS confidence
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340		.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
		442	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.							.	470		.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.			.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.			.
Query Sequence		I	N	S	D	A	P	G	W	L	R	V	F	W	S	V	A	I	G	L	L	T	L	G	M	L	M	T	.	.	.	.	.	.	N	G	.	I	S	A	L	Q	N	T	T	V	I	M	G	L	P	F	S	F	V	I	F	F	V	M	A
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.			.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.			.
Template Conservation
Template Sequence		P	D	S	G	D	H	K	L	V	N	V	G	R	T	A	A	V	V	A	L	I	I	A	A	L	I	A	P	M	L	G	G	I	G	Q	C	F	Q	Y	I	Q	E	Y	T	G	L	V	S	P	G	I	L	A	V	F	L	L	G	L	F
Template Known Secondary structure		S																										G	G	G	G	G	G		B											T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.