Job Description P62601 Confidence 97.70% Date Thu Jan 5 12:07:39 GMT 2012 Rank 17 Aligned Residues 300 % Identity 18% Template d2nvpa1 SCOP info alpha/alpha toroid Six-hairpin glycosidases CPF0428-like Resolution 2.20

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		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.						.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.							.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.																							.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.																							.
Query Sequence		P	Q	S	Y	I	V	P	G	G	R	F	S	E	T	Y	Y	W	D	S	Y	F	T	M	L	G	L	A	E	.	.	.	.	.	S	G	R	E	D	L	L	K	C	M	A	D	N	F	A	W	M	I	.	.	.	.	.	.	E	N	Y	G	H	I	P	N	G	N	R	T	Y	Y	L	S	R	S	Q	P	P	V	.
Query Conservation																														.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.																							.
Alig confidence											.																			.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation											.
Template Sequence		G	D	A	F	V	I	T	G	D	.	I	P	A	X	W	L	R	D	S	T	S	Q	V	E	H	Y	L	P	F	V	K	E	Y	P	E	L	K	A	I	F	T	G	L	I	N	R	Q	V	K	C	I	F	I	D	P	Y	A	N	A	F	N	K	E	P	N	G	Q	K	W	D	N	D	I	T	K	D	S	P	W	V
Template Known Secondary structure		T							S	S	.	S		S												T	T	G	G	G	T	T	T		G	G	G																			T	T		S				S	S	S	S				S	S			B	S				T	T
Template Predicted Secondary structure											.
Template SS confidence
		49	50	.	.	.	.	.	.	.		.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.
														227	.	.	230	.	.	.	.	.			.	.	.	.	240	.	.		.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.																												.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.								.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.								.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	A	L	M	V	E	L	F	E	.	.	E	D	G	V	R	G	A	.	R	R	Y	L	D	H	L	K	M	E	Y	A	F	W	M	D	G	A	E	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.								.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.								.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	E	R	K	Y	E	I	D	S	L	C	Y	P	V	R	L	I	H	K	Y	W	K	E	S	G	D	E	T	F	F	N	D	D	I	K	K	A	F	N	X	I	I	D	L	W	R	V	E	Q	Y	H	R	E	K	S	D	Y	S	F	Q	R	L	N	C	S	V	T	D	T	L	S	H	E	G	L	G	T	P	V	T
Template Known Secondary structure																													S	S																			G	G	G										B			S		S	S	S				S	S	S	S	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	N	Q	A	Y	R	H	V	V	R	M	P	D	G	S	L	L	N	R	Y	W	D	D	R	D	T	P	R	D	E	S	W	L	E	D	V	E	T	A	K	H	S	G	R	P	P	N	E	V	Y	R	D	L	R	A	G	A	A	S	G	W	D	Y	S	S	R	W	L	R	D	T	G	R	L	A	S	I	R	T	T
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	T	G	X	T	W	S	G	F	R	P	S	D	D	A	C	E	Y	G	Y	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	S	S				S	B		T	T	S		B		S	S	S		B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
		345	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.			.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.								.	410	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.																										.	.															.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.																										.	.															.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	F	I	P	I	D	L	N	A	F	L	F	K	L	E	S	A	I	A	N	I	S	A	L	K	.	G	E	K	E	T	E	A	L	F	R	Q	K	A	S	A	R	R	D	A	V	N	R	Y	L	W	.	.	D	D	E	N	G	I	Y	R	D	Y	D	W	R	R	.	.	.	.	.	.	.	E	Q	L	A	L	F
Query Conservation																											.																										.	.															.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																						.																										.	.															.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	I	P	A	N	X	F	A	V	V	A	L	R	Y	I	S	E	I	A	E	K	V	Y	K	D	E	E	L	K	E	K	A	D	S	L	R	E	E	I	D	N	A	I	E	K	H	G	K	V	Y	K	E	G	F	G	E	V	Y	A	Y	E	T	D	G	X	G	N	Y	N	F	X	D	D	A	N	V	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.																					T	S																						T	T	S					T	T	T						S	B			S	S	S								S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Template SS confidence
						229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
		415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.				.	.	.	.	.					.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.						.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.						.	.	.	.
Query Sequence		S	A	A	A	I	V	P	L	Y	V	G	M	A	N	H	E	Q	A	D	R	L	A	N	A	V	R	S	R	.	.	.	L	L	T	P	G	.	.	.	.	G	I	L	A	S	E	Y	E	T	G	E	Q	W	D	K	P	N	G	W	A	P	L	Q	W	M	A	I	Q	G	F	K	M	Y	G	D	D	L	L	G	D
Query Conservation																														.	.	.						.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.						.	.	.	.											.	.	.	.	.	.					.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.					.	.
Template Sequence		S	L	L	S	I	P	Y	L	E	Y	K	G	I	E	D	E	V	Y	Q	N	T	R	K	F	I	L	S	K	N	N	R	F	F	F	E	G	K	A	A	K	G	I	G	S	P	H	T	P	D	Q	.	.	.	.	.	.	Y	I	W	H	.	.	I	A	L	S	X	Q	G	L	T	T	N	N	Q	E	E	I	D	Q
Template Known Secondary structure			G	G	G					T	S	S		S	S												T	S	T	T	S	T	T					S	S							T	T	S		T	T	.	.	.	.	.	.					.	.									S
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.					.	.
Template SS confidence
		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.							.	.	.	.			.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
		488	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	I	A	R	S	W	L	K	T	V	N	Q	F	Y	L	E	Q	H	K	L	I	E	K	Y	H	I	A	D	G	V	P	R	E	G	G	G	G	E	Y	P	L	Q	D	G	F	G	W	T	N	G	V	V	R	R	L	I
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	.	.	.	.	.	I	K	L	L	K	E	T	D	A	G	T	G	Y	X	H	E	G	F	H	V	D	D	P	T	K	F	T	R	D	W	.	.	.	.	.	.	.	.	F	A	W	S	N	S	L	F	S	H	F	I
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.							T	S	T	T	S	S	S			S				T	T						S		S		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		377						.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.									.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.