Job Description P62601 Confidence 96.92% Date Thu Jan 5 12:07:39 GMT 2012 Rank 24 Aligned Residues 289 % Identity 13% Template d1h54a1 SCOP info alpha/alpha toroid Six-hairpin glycosidases Glycosyltransferase family 36 C-terminal domain Resolution 2.15

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		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.		.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure													.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	G	R	F	S	E	T	Y	Y	W	D	.	S	Y	F	T	M	L	G	L	A	E	S	G	R	E	D	L	L	K	C	M	A	D	N	F	A	W	M	I	E	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	H	I	P	N	G	N	R	T	Y	Y	L	S	R	S	Q
Query Conservation													.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	E	K	Y	G	G	A	T	Y	W	D	T	E	A	F	A	F	P	V	Y	L	G	I	T	D	P	K	V	T	R	N	L	L	M	Y	R	Y	K	Q	L	D	G	A	Y	I	N	A	Q	E	Q	G	L	K	G	A	L	F	P	M	V	T	F	D	G	I	E	C	H	N	E	W	E	I	T	F	E	E	I	H	R
Template Known Secondary structure				T	T		S	S	B		T					T									S														T	T										T	T	T			S					S	S	B	S	S	S	S	B									T	T		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.			.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.		.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Predicted Secondary structure													.	.												.
Query SS confidence													.	.												.
Query Sequence		P	P	V	F	A	L	M	V	E	L	F	.	.	E	E	D	G	V	R	G	A	R	R	Y	.	L	D	H	L	K	M	E	Y	A	F	W	M	D	G	A	E	S	L	I	P	N	Q	A	Y	R	H	V	V	R	M	P	D	G	S	L	L	N	R	Y	W	D	D	R	D	T	P	R	D	E	S	W	L	E	D	V
Query Conservation													.	.												.
Alig confidence													.	.												.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	G	D	I	A	F	A	I	Y	N	Y	T	R	Y	T	G	D	D	S	Y	V	L	H	E	G	A	K	V	L	T	E	I	S	R	F	W	A	D	R	V	H	F	S	K	R	N	N	Q	Y	M	I	H	G	V	T	G	A	D	E	Y	E	N	N	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																				T	T	T	T	T																					T	T	T	T						S	B			S	S	T	T	S		S	B	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.
Query SS confidence																																																																								.
Query Sequence		E	T	A	K	H	S	G	R	P	P	N	E	V	Y	R	D	L	R	A	G	A	A	S	G	W	D	Y	S	S	R	W	L	R	D	T	G	R	L	A	S	I	R	T	T	Q	F	I	P	I	D	L	N	A	F	L	F	K	L	E	S	A	I	A	N	I	S	A	L	K	G	.	E	K	E	T	E	A	L	F	R
Query Conservation																																																																								.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	N	W	D	T	N	M	L	A	Q	W	T	L	K	Y	T	L	E	I	L	G	K	V	D	Q	D	T	A	K	Q	L	D	V	S	D	E	E	K	T	K	W	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																								494	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.
		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.										.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410																.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	K	A	S	A	R	R	D	A	V	N	R	Y	L	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	E	N	G	I	Y	R	D	Y	D	W	R	R	E	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	L	F	S	A	A	A	I	V	P	L	Y	V	G	M	A	N	H	E	Q	A	D	R	L
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	I	V	D	R	M	Y	L	P	Y	D	K	D	L	N	I	F	V	Q	H	D	G	F	L	D	K	D	I	E	P	V	S	S	I	P	A	D	Q	R	P	I	N	Q	N	W	S	W	D	K	I	L	R	S	P	Y	I	K	Q	G	D	V	L	Q	G	I	W	D	F	I	D	D	Y	T	P	E	Q	K	K	A	N
Template Known Secondary structure						T	B						T	T	T	T				S	S	T	T	G	G	G	S					G	G	G	S		G	G	G		S	G	G	G	T	S								S	S		B	S	S		S								T	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		536	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.
		436	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	N	A	V	R	S	R	L	L	T	P	G	G	I	L	A	S	E	Y	E	T	G	E	Q	W	D	K	P	N	G	W	A	P	L	Q	W	M	A	I	Q	G	F	K	M	Y	G	D	D	L	L	G	D	E	I	A	R	S	W	L	K	T	V	N	Q	F	Y	L	E	Q	H	K	L	I	E	K	Y	H	I	A	D
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	D	F	Y	E	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	V	H	E	S	S	L	S	P	A	I	H	S	V	L	A	A	D	L	H	Y	E	D	K	A	V	E	L	Y	S	R	T	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	L	D	L	D	N
Template Known Secondary structure						G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	B				S	T	T												T	T										T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		616	.	.	.	620	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.																.	.	.	.	660	.
		516	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	V	P	R	E	G	G	G	G	E	Y	P	L	Q	D	G	F	G	W	T	N	G	V	V	R	R	L	I	G	L	Y	G
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	N	N	D	T	T	D	G	.	.	.	.	.	.	L	H	I	T	S	M	T	G	A	W	I	A	V	V	Q	G	F	A
Template Known Secondary structure		T	T	S		G	G	G		.	.	.	.	.	.			G	G	G	G	G								T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		662	.	.	.	.	.	.	.							670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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