Job Description P62601 Confidence 98.73% Date Thu Jan 5 12:07:39 GMT 2012 Rank 14 Aligned Residues 289 % Identity 16% Template c2vn4A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:glucoamylase; PDBTitle: glycoside hydrolase family 15 glucoamylase from hypocrea2 jecorina Resolution 1.85 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210						.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	S	E	T	Y	Y	W	D	S	Y	F	T	M	L	G	L	A	E	S	G	R	E	D	L	L	K	C	M	A	D	N	F	A	W	M	I	E	N	Y	G	H	I	.	.	.	.	.	P	N	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	T	Y	Y	L
Query Conservation																																												.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																												.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		Y	Y	Y	M	W	T	R	D	S	A	L	V	F	K	N	L	I	D	R	F	T	E	T	Y	D	A	G	L	Q	R	R	I	E	Q	Y	I	T	A	Q	V	T	L	Q	G	L	S	N	P	S	G	S	L	A	D	G	S	G	L	G	E	P	K	F	E	L	T	L	K	P	F	T	G	N	W	G	R	P	Q	.	.
Template Known Secondary structure				S																				S	B																							B	T	T	B		S	T	T	S	G	G	G	G						T	T	S		B			S			S				.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		47	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.
		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.						.	.	.	240	.	.	.	.		.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.									.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.									.
Query Sequence		S	R	S	Q	P	P	V	F	A	L	M	V	E	L	F	E	E	.	.	.	.	.	D	G	V	R	G	A	R	R	.	Y	L	D	H	L	K	M	E	Y	A	F	W	M	D	G	A	E	S	L	I	P	N	Q	A	Y	R	H	V	V	R	M	P	D	G	S	L	L	N	R	Y	W	D	D	R	D	T	P	R	D
Query Conservation																			.	.	.	.	.									.
Alig confidence		.																	.	.	.	.	.									.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Conservation		.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Sequence		.	R	D	G	P	A	L	R	A	I	A	L	I	G	Y	S	K	W	L	I	N	N	N	Y	Q	S	T	V	S	N	V	I	W	P	I	V	R	N	D	L	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	A	Q	Y	W	N	Q	T	G	F	D	L	.
Template Known Secondary structure		.	T																				T	T									T											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	S					T	.
Template Predicted Secondary structure		.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template SS confidence
			125	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	S	W	L	E	D	V	E	T	A	K	H	S	G	R	P	P	N	E	V	Y	R	D	L	R	A	G	A	A	S	G	W	D	Y	S	S	R	W	L	R	D	T	G	R	L	A	S	I	R	T	T	Q	F	I	P	I	D	L	N	A	F	L	F	K	L	E	S	A	I	A	N	I	S	A	L	K	G	E	K	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	E	E	V	N	G	S	S	F	F	T	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	Q	H	R	A	L	V	E	G	A	T	L	A	A	T	L	G	Q	S	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		T			.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template SS confidence
																											178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.											.	.	.	.	.			430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Query Sequence		T	E	A	L	F	R	Q	K	A	S	A	R	R	D	A	V	N	R	Y	L	W	D	D	E	N	G	I	Y	R	D	Y	D	W	R	R	E	Q	L	A	L	F	S	A	A	A	I	V	P	L	Y	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	M	A	N	H	.	.	E	Q	A	D	R	L	A	N	A	V	R	S
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Alig confidence		.																		.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Template Conservation		.																		.
Template Sequence		.	G	S	A	Y	S	S	V	A	P	Q	V	L	C	F	L	Q	R	.	F	W	V	S	S	G	G	Y	V	D	S	N	I	N	T	N	E	G	R	T	G	K	D	V	N	S	V	L	T	S	I	H	T	F	D	P	N	L	G	C	D	A	G	T	F	Q	P	C	S	D	K	A	L	S	N	L	K	V	V	V	D
Template Known Secondary structure		.																G	G	.	G			T	T	T	T				S			S	S								B	T									S			G	G	G	T	T		T	T	T	T		T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.																		.
Template SS confidence
			210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.		.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
		442	.	.	.	.	.	.	.											450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	L	L	T	P	G	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	S	E	Y	E	T	G	E	Q	W	D	K	P	N	G	W	A	P	L	Q	W	M	A	I	Q	G	F	K	M	Y	G	D	D	L	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.
Template Sequence		S	F	R	S	I	Y	G	V	N	K	G	I	P	A	G	A	A	V	A	I	G	R	Y	A	E	D	V	Y	Y	N	G	.	N	P	W	Y	L	A	T	F	A	A	A	E	Q	L	Y	D	A	I	Y	V	W	K	K	T	G	S	I	T	V	T	A	T	S	L	A	F	F	Q	E	L	V	P	G	V	T	A	G	T
Template Known Secondary structure					T	T		G	G	G	T	T			T	T	S						S	B	T	T			G	G	G		.			B																						T						T	T	T								S	T	T			S
Template Predicted Secondary structure																																	.
Template SS confidence
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.		.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
																	487	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	I	A	R	S	W	L	K	T	V	N	Q	F	Y	L	E	Q	H	K	L	I	E	K	Y	H	I	A	D	G	V	P	R	E	G	G	G	G	E	Y	P	L	Q	D	G	F	G	W	T	N	G	V	V	R	R	L	I	G	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	S	S	S	S	S	T	F	T	N	I	I	N	A	V	S	T	Y	A	D	G	F	L	S	E	A	A	K	Y	V	P	A	D	G	S	L	A	E	Q	F	D	R	N	S	G	T	P	L	S	A	L	H	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	W	S	Y	A	S	F	L	T	A	T	A	R
Template Known Secondary structure				T	T	S																							T	T	S		T	T					S				T	T	T					S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.									.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.