Job Description P62601 Confidence 97.54% Date Thu Jan 5 12:07:39 GMT 2012 Rank 20 Aligned Residues 303 % Identity 16% Template c2p0vA_ PDB info PDB header:structural genomics, unknown function Chain: A: PDB Molecule:hypothetical protein bt3781; PDBTitle: crystal structure of bt3781 protein from bacteroides2 thetaiotaomicron, northeast structural genomics target3 btr58 Resolution 2.10 Å

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		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.						.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210							.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.																.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.																.	.
Query Sequence		P	Q	S	Y	I	V	P	G	G	R	F	S	E	T	Y	Y	W	D	S	Y	F	T	M	L	G	L	A	E	S	.	.	.	.	.	G	R	E	D	L	L	K	C	M	A	D	N	F	A	W	M	I	E	N	Y	G	H	I	.	.	.	.	.	.	P	N	G	N	R	T	Y	Y	L	S	R	S	Q	P	P	.	.
Query Conservation																															.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.																.	.
Alig confidence											.																				.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.																.	.
Template Conservation											.
Template Sequence		E	D	T	F	V	Y	T	G	D	.	I	H	A	X	W	L	R	D	S	G	A	Q	V	W	P	Y	V	Q	L	A	N	K	D	P	E	L	K	K	X	L	A	G	V	I	N	R	Q	F	K	C	I	N	I	D	P	Y	A	N	A	F	N	X	N	S	E	G	G	E	W	X	S	D	L	T	D	X	K	P	E	L
Template Known Secondary structure		S							B	S	.	S	S	S										S	G	G	G	G	G	G	G	G	G																							T	T		S				S	S	S				G	G	G	G	S	S	S				T	T
Template Predicted Secondary structure											.
Template SS confidence
		94	.	.	.	.	.	100	.	.		.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.
														226	.	.	.	230	.	.	.	.		.	.	.	.	.	240	.	.		.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.									.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.									.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	F	A	L	M	V	E	L	F	.	E	E	D	G	V	R	G	A	.	R	R	Y	L	D	H	L	K	M	E	Y	A	F	W	M	D	G	A	E	S	L	I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.									.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.									.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	E	R	K	W	E	I	D	S	L	C	Y	P	I	R	L	A	Y	H	Y	W	K	T	T	G	D	A	S	V	F	S	D	E	W	L	Q	A	I	A	N	V	L	K	T	F	K	E	Q	Q	R	K	D	D	A	K	G	P	Y	R	F	Q	R	K	T	E	R	A	L	D	T	X	T	N	D	G	W	G	N	P	V
Template Known Secondary structure																													T	T	S	S																	T	T		S	S		S	S		S								S		G	G	G	S						T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		173	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
				266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.
Query SS confidence		.	.
Query Sequence		.	.	N	Q	A	Y	R	H	V	V	R	M	P	D	G	S	L	L	N	R	Y	W	D	D	R	D	T	P	R	D	E	S	W	L	E	D	V	E	T	A	K	H	S	G	R	P	P	N	E	V	Y	R	D	L	R	A	G	A	A	S	G	W	D	Y	S	S	R	W	L	R	D	T	G	R	L	A	S	I	R	T
Query Conservation		.	.
Alig confidence		.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	P	V	G	L	I	A	S	A	F	R	P	S	D	D	A	T	T	F	Q	F	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				S	S					S	B		T	T	S		B		S	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.		.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.			.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.								.	410	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.																						.	.														.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.																						.	.														.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	Q	F	I	P	I	D	L	N	A	F	L	F	K	L	E	S	A	I	A	N	I	S	A	L	K	G	E	K	E	T	.	E	A	L	F	R	Q	K	A	S	A	R	R	D	A	V	N	R	Y	L	W	D	.	.	D	E	N	G	I	Y	R	D	Y	D	W	R	R	.	.	.	.	.	.	.	E	Q	L	A	L
Query Conservation																																	.																						.	.														.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																											.																						.	.														.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	V	P	S	N	F	F	A	V	T	S	L	R	K	A	A	E	I	L	N	T	V	N	R	K	P	A	L	A	K	E	C	T	A	L	A	D	E	V	E	K	A	L	K	K	Y	A	V	C	N	H	P	K	Y	G	K	I	Y	A	F	E	V	D	G	F	G	N	Q	L	L	X	D	D	A	N	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.																					T	S																								S					T	T	T						S				S	S	S								S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Template SS confidence
							275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.				.	.	.	.	.					.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.						.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.						.	.	.	.
Query Sequence		F	S	A	A	A	I	V	P	L	Y	V	G	M	A	N	H	E	Q	A	D	R	L	A	N	A	V	R	S	R	.	.	.	L	L	T	P	G	.	.	.	.	G	I	L	A	S	E	Y	E	T	G	E	Q	W	D	K	P	N	G	W	A	P	L	Q	W	M	A	I	Q	G	F	K	M	Y	G	D	D	L	L	G
Query Conservation																															.	.	.						.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.						.	.	.	.											.	.	.	.	.	.					.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.					.	.
Template Sequence		P	S	L	I	A	L	P	Y	L	G	D	V	K	V	T	D	P	I	Y	Q	N	T	R	K	F	V	W	S	E	D	N	P	Y	F	F	K	G	S	A	G	E	G	I	G	G	P	H	I	G	Y	D	.	.	.	.	.	.	X	I	W	P	.	.	X	S	I	X	X	K	A	F	T	S	Q	N	D	A	E	I	K
Template Known Secondary structure		S		S	T	T					T	S	S		T	T												T	S	T	T	S	T	T					S	S							T	T	T		T	T	.	.	.	.	.	.					.	.									T
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.					.	.
Template SS confidence
		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400							.	.	.	.			.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.
		487	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	E	I	A	R	S	W	L	K	T	V	N	Q	F	Y	L	E	Q	H	K	L	I	E	K	Y	H	I	A	D	G	V	P	R	E	G	G	G	G	E	Y	P	L	Q	D	G	F	G	W	T	N	G	V	V	R	R	L	I	G	L	Y
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	C	.	.	.	.	.	I	K	X	L	X	D	T	D	A	G	T	G	F	X	H	E	S	F	N	K	N	D	P	K	N	F	T	R	A	W	.	.	.	.	.	.	.	.	F	A	W	Q	N	T	L	F	G	E	L	I	L	K	L
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.							T	S	T	T	S		S			S				T	T								S		.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		422	.						.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.									.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.