Job Description P62601 Confidence 97.30% Date Thu Jan 5 12:07:39 GMT 2012 Rank 22 Aligned Residues 285 % Identity 18% Template c2eacB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:alpha-fucosidase; PDBTitle: crystal structure of 1,2-a-l-fucosidase from2 bifidobacterium bifidum in complex with3 deoxyfuconojirimycin Resolution 2.10 Å

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		171	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	210	.	.													.	.	.	.	.	.	.	220	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	T	Y	Y	W	D	S	Y	F	T	M	L	G	L	A	E	S	G	R	E	D	L	L	K	C	M	A	D	N	F	A	W	M	I	E	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	H	I	P	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	R	T	Y	Y	L	S	R
Query Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	M	N	Y	W	P	T	Y	S	A	N	M	G	E	L	A	E	P	L	I	E	Y	V	E	G	L	V	K	P	G	R	V	T	A	K	V	Y	A	G	A	E	T	T	N	P	E	T	T	P	I	G	E	G	E	G	Y	M	A	H	T	E	N	T	A	Y	G	W	T	A	P	G	Q	S	F	S	W	G	W	S	P
Template Known Secondary structure					T	S	S	T	T	T	T	T		G	G	G	G										T																	S	S	T	T	T			T	T	S	S	S						S				S	S				S			S	S							T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.			.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.
Query SS confidence																.	.
Query Sequence		S	Q	P	P	V	F	A	L	M	V	E	L	F	E	.	.	E	D	G	V	R	G	A	R	R	Y	L	D	H	L	K	M	E	Y	A	F	W	M	D	G	A	E	S	L	I	P	N	Q	A	Y	R	H	V	V	R	M	P	D	G	S	L	L	N	R	Y	W	D	D	R	D	T	P	R	D	E	S	W	L	E	D
Query Conservation																.	.
Alig confidence																.	.																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	A	V	P	W	I	L	Q	N	V	Y	E	A	Y	E	Y	S	G	D	P	A	L	L	D	R	V	Y	A	L	L	K	E	E	S	H	F	Y	V	N	Y	M	L	H	K	A	G	S	S	S	G	D	R	L	T	T	G	V	A	Y	S	P	E	Q	G	P	L	G	T	D	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T																																								T						G	G	G		S	S									T	T										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		505	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	E	T	A	K	H	S	G	R	P	P	N	E	V	Y	R	D	L	R	A	G	A	A	S	G	W	D	Y	S	S	R	W	L	R	D	T	G	R	L	A	S	I	R	T	T	Q	F	I	P	I	D	L	N	A	F	L	F	K	L	E	S	A	I	A	N	I	S	A	L	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	Y	E	S	S	L	V	W	Q	M	L	N	D	A	I	E	A	A	K	A	K	G	D	P	D	G	L	V	G	N	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					T	T		T	T						S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																			576	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.
																			371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.								.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.							.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	K	E	T	E	A	L	F	R	Q	K	A	S	A	R	R	D	.	.	.	.	.	.	.	A	V	N	R	Y	L	W	D	D	E	N	G	I	Y	R	D	Y	.	.	.	.	.	.	D	W	R	R	E	Q	L	A	L	F	S	A	A	A	I	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	D	C	S	A	D	N	W	A	K	N	D	S	G	N	F	T	D	A	N	A	N	R	S	W	S	C	A	K	S	L	L	K	P	I	E	V	G	D	S	G	Q	I	K	E	W	Y	F	E	G	A	L	G	K	K	K	D	G	S	T	I	S	G	Y	Q	A	D	N	Q	H	R	H	M	S	H	L	L	G	L	F
Template Known Secondary structure		T	T			G	G	G	G		B		T	T	S		B	S		T	T	S																B		T	T	S	S	B		S	S	T	T	B		S	T	T	B	B	T	T	S		B		T	T			S	S	S			S			G	G	G	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		607	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.
		421	.	.	.		.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.
Query SS confidence						.
Query Sequence		P	L	Y	V	.	G	M	A	N	H	E	Q	A	D	R	L	A	N	A	V	R	S	R	L	L	T	P	G	G	I	L	A	S	E	Y	E	T	G	E	Q	W	D	K	P	N	G	W	A	P	L	Q	W	M	A	I	Q	G	F	K	M	Y	G	D	D	L	L	G	D	E	I	A	R	S	W	L	K	T	V	N	Q
Query Conservation						.
Alig confidence						.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																			.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																			.	.	.
Template Sequence		P	G	D	L	I	T	I	D	N	S	E	Y	M	D	A	A	K	T	S	L	R	Y	R	C	F	K	G	N	V	L	Q	S	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	W	A	I	G	Q	R	I	N	S	W	A	.	.	R	T	G	D	G	N	T	T	Y	Q	L	V	E	L	Q	L	K	N	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	S	S	S	S		S	S	S		T	T															T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.			T																.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																			.	.	.
Template SS confidence
		687	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.												720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.			.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750
		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	Y	L	E	Q	H	K	L	I	E	K	Y	H	I	A	D	G	V	P	R	E	G	G	G	G	E	Y	P	L	Q	D	G	F	G	W	T	N	G	V	V	R	R	L	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	A	M	Y	A	N	L	F	D	Y	H	A	P	F	Q	I	D	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	F	G	N	T	S	G	V	D	E	M	L	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	S	B		T	T			B	B	S	S	S	B		T				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								751	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.									.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780

No model constructed - rank, confidence too low