Job Description P62601 Confidence 98.68% Date Thu Jan 5 12:07:39 GMT 2012 Rank 15 Aligned Residues 295 % Identity 18% Template c1ug9A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:glucodextranase; PDBTitle: crystal structure of glucodextranase from arthrobacter globiformis i42 Resolution 2.50 Å

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		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.		.	.	.	210	.	.					.	.	.	.	.	.	.	220			.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.							.	.	.	.									.	.
Query SS confidence																																													.							.	.	.	.									.	.
Query Sequence		V	P	G	G	R	F	S	E	T	Y	Y	W	D	S	Y	F	T	M	L	G	L	A	E	S	G	R	E	D	L	L	K	C	M	A	D	N	F	A	W	M	I	E	N	.	Y	G	H	I	P	N	.	.	.	.	G	N	R	T	Y	Y	L	S	.	.	R	S	Q	P	P	V	F	A	L	M	V	E	L	F	E	E
Query Conservation																																													.							.	.	.	.									.	.
Alig confidence																																													.							.	.	.	.									.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	H	R	E	G	Y	H	A	V	W	A	R	D	M	Y	Q	S	V	T	A	L	L	A	A	G	D	E	E	A	A	A	R	G	V	E	W	L	F	T	Y	Q	Q	Q	P	D	G	H	F	P	Q	T	S	R	V	D	G	T	I	G	Q	N	G	I	Q	L	D	E	T	A	F	P	I	L	L	A	N	Q	I	G	R
Template Known Secondary structure		S				T	T		S	B																T																T			T	T	S				S		B		T	T			B							T														T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	G	V	R	G	A	R	R	Y	L	D	H	L	K	M	E	Y	A	F	W	M	D	G	A	E	S	L	I	P	N	Q	A	Y	R	H	V	V	R	M	P	D	G	S	L	L	N	R	Y	W	D	D	R	D	T	P	R	D	E	S	W	L	E	D	V	E	T	A	K	H	S	G	R	P	P	N	E	V	Y	R	D
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	D	A	G	F	Y	R	N	E	.	.	.	L	K	P	A	A	D	Y	L	V	A	A	G	P	K	T	P	Q	E	R	W	E	E	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										T	.	.	.													S		B	S	S		T	T	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		401	.	.	.	.	.	.	.	.				410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		L	R	A	G	A	A	S	G	W	D	Y	S	S	R	W	L	R	D	T	G	R	L	A	S	I	R	T	T	Q	F	I	P	I	D	L	N	A	F	L	F	K	L	E	S	A	I	A	N	I	S	A	L	K	G	E	K	E	T	E	A	L	F	R	Q	K	A	S	A	R	R	D	A	V	N	R	Y	L	W	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	G	G	Y	S	T	S	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	Q	I	A	A	L	A	A	A	A	D	I	A	G	K	N	G	D	A	G	S	A	A	V	Y	R	A	T	A	D	E	W	Q	R	S	T	E	K	W	M	F	T	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.		B							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	T	T																	T	T								S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								433	.	.	.	.	.	.	440																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.
					395	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.			.	.	.	.	450
Predicted Secondary structure		.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.
Query SS confidence		.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.
Query Sequence		.	.	.	D	D	E	N	G	I	Y	R	D	Y	D	W	R	R	E	Q	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	F	S	A	A	A	I	V	P	L	Y	V	G	M	A	N	H	E	Q	A	D	R	L	A	N	A	V	R	S	R	L	L	T	.	.	P	G	G	I	L
Query Conservation		.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.
Alig confidence		.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	G	P	V	G	D	G	K	Y	Y	L	R	I	S	A	T	G	N	P	N	D	G	A	T	R	D	W	G	N	G	A	G	V	H	P	E	N	A	V	L	D	G	G	F	L	E	F	V	R	L	G	V	K	A	P	A	D	P	Y	V	A	D	S	L	A	E	T	D	A	S	I	S	Q	E	T	P	G	G	R	M
Template Known Secondary structure		S		S	S	T	T	S					S			S	S	S		T	T	S							S	T	T						G	G	G			B	G	G	G	G					T	T	S	S		T	T																				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		485	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.
		451	.	.	.	.	.	.	.	.									460	.	.	.				.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510		.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.																																																.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.																																																.
Query Sequence		A	S	E	Y	E	T	G	E	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	W	D	K	P	.	.	.	N	G	W	A	P	L	Q	W	M	A	I	Q	G	F	K	M	Y	G	D	D	L	L	G	D	E	I	A	R	S	W	L	K	T	V	N	Q	F	Y	L	E	Q	H	K	L	I	E	K	.	Y	H	I	A	D	G	V	P
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.																																																.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.																					.	.	.	.	.	.																						.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	H	R	Y	T	Y	D	G	Y	G	E	K	A	D	G	S	P	W	D	G	T	G	I	G	R	L	W	P	L	L	S	G	E	R	G	E	Y	A	L	A	N	G	Q	D	.	.	.	.	.	.	A	L	P	Y	L	E	T	M	H	S	A	A	N	A	G	Y	M	I	P	E	Q	V	W	D	R	D	E	P	T	S
Template Known Secondary structure				S	B	T	T				S			T	T	S				S	S						B		T													T	T			.	.	.	.	.	.											T			T	T					S		B				S	S			S
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		565	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.							.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.
							519	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	R	E	G	G	G	G	E	Y	P	L	Q	D	G	F	G	W	T	N	G	V	V	R	R	L	I	G
Query Conservation		.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.										.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.
Template Sequence		Y	G	H	E	L	G	R	S	T	G	S	A	S	P	.	.	.	.	L	S	W	A	M	A	Q	Y	V	R	L	A	A
Template Known Secondary structure		S				T	T	S	B		S	S		B		.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.
Template SS confidence
		639	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.					.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.