Job Description Q9JMS5 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:21:16 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 259 % Identity 15% Template d1uynx_ SCOP info Transmembrane beta-barrels Autotransporter Autotransporter Resolution 2.60

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		1451	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.			.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1520	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.
Query SS confidence																																				.	.
Query Sequence		R	Y	D	I	P	G	Q	H	R	Y	P	T	L	F	E	N	L	Y	N	N	G	M	W	I	Q	F	N	N	N	S	G	S	N	S	.	.	E	V	Y	D	N	L	K	T	S	Y	S	L	N	T	M	M	I	G	G	D	I	Y	N	W	T	D	G	Y	N	Y	S	H	I	G	I	M	G	G	M	G	S	A	A	N
Query Conservation																																				.	.
Alig confidence																																				.	.																											.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.
Template Sequence		A	H	A	D	M	Q	G	R	R	L	K	A	V	S	D	G	L	D	H	N	G	T	G	L	R	V	I	A	Q	T	Q	Q	D	G	G	T	W	E	Q	G	G	V	E	G	K	M	R	G	S	T	Q	T	V	G	I	A	A	K	T	G	E	N	.	.	.	.	T	T	A	A	A	T	L	G	M	G	R	S	T	W
Template Known Secondary structure																	T	T	T	S			S	S																	S	S																				T	T	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.
Template SS confidence
		796	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.					.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.
		1529	1530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1580	.	.	.	.					.	.	.	.	.	1590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1600	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.
Query SS confidence																																																										.	.	.	.
Query Sequence		K	T	T	S	T	N	N	K	R	A	T	G	N	V	D	G	Y	T	L	G	L	Y	H	V	F	Q	Q	N	I	S	D	G	L	N	E	S	E	R	Q	G	L	W	T	Y	S	S	I	Q	Y	M	D	Y	D	N	S	V	.	.	.	.	S	S	T	N	N	F	K	A	N	Y	G	V	N	G	F	R	L	T	G	E
Query Conservation																																																										.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	.	.	.	.	.	E	N	S	A	N	A	K	T	D	S	I	S	L	F	A	G	I	R	H	D	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	G	Y	L	K	G	L	F	S	Y	G	R	Y	K	N	S	I	S	R	S	T	G	A	D	E	H	A	E	G	S	V	N	G	T	L	M	Q	L	G	A	L
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.		T	T																			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T																					S	S	S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		872						.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.											.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.
		1605	.	.	.	.	1610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1640	.	.	.				.	.	.	.	.	.	1650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1680	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.
Query Sequence		V	G	Y	L	K	N	I	G	G	I	Q	P	S	D	F	Y	V	E	P	K	L	Y	L	S	H	T	E	L	S	G	G	V	V	E	D	L	Q	G	G	.	.	.	K	I	T	Y	P	N	S	L	T	I	I	E	P	G	V	F	F	S	Y	R	K	T	H	E	S	T	S	N	D	E	A	M	F	K	D	Y	I	K
Query Conservation																																									.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	G	V	N	V	P	T	.	.	.	.	.	.	.	G	D	L	T	V	E	G	G	L	R	Y	D	L	L	K	Q	D	A	F	A	E	K	G	S	A	L	G	W	S	G	N	S	L	T	E	G	T	L	V	G	L	A	G	L	K	L	S	Q	P	L	S	D	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.																							S		T	T																									S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		937	.	.	940	.	.	.								.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.
		1682	.	.	.	.	.	.	.	1690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1740	.	.	.	.	.		.	.	.	.	1750	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.
Query SS confidence																																																																		.
Query Sequence		Q	S	V	V	D	A	W	F	G	G	G	Y	S	F	K	T	G	N	Y	S	R	T	N	F	D	S	D	M	V	E	Y	N	T	S	D	N	F	A	L	K	S	G	V	E	F	E	F	L	K	D	A	R	L	L	L	T	S	S	Y	S	I	N	N	D	.	R	N	L	S	F	I	L	G	G	N	Y	Y	F
Query Conservation																																																																		.
Alig confidence		.	.	.														.	.	.	.	.	.	.																																										.
Template Conservation		.	.	.														.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	A	V	L	F	A	T	A	G	V	E	R	D	L	.	.	.	.	.	.	.	N	G	R	D	Y	T	V	T	G	P	H	T	R	L	V	A	G	L	G	A	D	V	E	F	G	N	G	W	N	G	L	A	R	Y	S	Y	A	G	S	K	Q	Y	G	N	H	S	G	R	V	G	V	G	Y	R	F
Template Known Secondary structure		.	.	.													S	.	.	.	.	.	.	.	S																									T	T													T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.														.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.								.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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