Job Description P33222 Confidence 99.29% Date Thu Jan 5 11:51:22 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 319 % Identity 14% Template c2wyoC_ PDB info PDB header:ligase Chain: C: PDB Molecule:glutathione synthetase; PDBTitle: trypanosoma brucei glutathione synthetase Resolution 3.15 Å

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		42	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.		.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100			.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.				.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.																														.	.												.	.	.
Query SS confidence																																.																														.	.												.	.	.
Query Sequence		L	R	Q	I	E	E	Q	I	E	K	P	T	A	E	L	H	Q	M	C	L	E	V	V	D	R	A	V	K	D	E	.	E	I	L	T	Q	L	A	I	P	P	L	Y	W	D	V	I	A	E	S	W	R	A	R	D	P	S	L	Y	G	.	.	R	M	D	F	A	W	C	G	N	A	P	.	.	.	V	K	L	L
Query Conservation																																.																														.	.												.	.	.
Alig confidence																																.							.	.	.																					.	.												.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.
Template Sequence		M	Q	P	L	W	N	E	A	V	D	N	T	A	R	N	F	T	F	L	R	D	A	L	Q	E	T	A	A	S	D	V	N	F	T	G	K	L	.	.	.	L	N	M	L	Q	E	V	Y	L	S	G	G	P	F	Q	Q	L	M	L	G	I	F	R	T	D	Y	M	R	E	G	V	T	T	A	S	R	W	K	N	V
Template Known Secondary structure															T								T	T							S	T	T	T					.	.	.									T	S	S																		B							S
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.
Template SS confidence
		60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.				.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.
		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	Y	N	A	D	T	P	T	S	L	Y	E	S	A	Y	F	Q	W	L	W	L	E	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	S	G	I	I	P	R	D	A	D	Q	Y	N	A	I	Q	E	R	L	I	S	R	F	S	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	I	N	T	I	S	C	S	F	A	G	L	S	P	L	I	T	E	F	H	Q	H	I	A	A	Y	L	Q	V	L	Q	K	A	R	G	K	E	D	E	N	M	S	W	I	W	G	K	G	N	C	R	L	E	R	S	V	S	G	D	V	V	P	K	A	I	A	D	A	V	R	A	W	V	E	Q	Q	K	F	A	S
Template Known Secondary structure						S	S				T	T	T																					T	T	S							T	T	S	S		S	S	S							T																					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		143	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
																167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.		.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.										210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	S	R	E	P	F	Y	F	C	C	C	Q	D	T	D	E	D	R	S	T	V	L	Y	L	Q	D	C	A	.	Q	Q	A	G	Q	E	S	R	F	I	Y	I	E	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	G	V	G	G	V	L	T	D	L	D	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	R	A	S	W	E	Q	F	Q	Q	N	L	G	V	L	D	T	A	P	V	V	L	V	V	V	Q	E	N	E	R	N	T	A	D	Q	Y	A	L	L	M	R	V	L	E	E	H	R	I	R	F	I	F	R	T	L	Q	E	L	H	L	S	L	K	L	H	S	I	S	P	E	Q	P	P	L	A	V	V	D	G	H
Template Known Secondary structure										T								S	S									S	S																	T	T																					S	S	T	T	S							T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.
		223	.	.	.	.	.	.	230	.			.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.				.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.															.	.	.																																																				.
Query SS confidence											.	.															.	.	.																																																				.
Query Sequence		N	V	I	Q	R	A	F	K	L	.	.	Y	P	L	E	W	M	M	R	D	D	N	G	P	L	.	.	.	L	R	K	R	R	E	Q	W	V	E	P	L	W	K	S	I	L	S	N	K	G	L	M	P	L	L	W	R	F	F	P	G	H	P	N	L	L	A	S	W	F	D	G	E	K	P	Q	I	A	A	G	.
Query Conservation											.	.															.	.	.																																																				.
Alig confidence											.	.															.	.	.																													.	.																						.
Template Conservation																																																										.	.
Template Sequence		Y	P	I	A	V	A	Y	F	R	S	T	Y	V	P	E	D	F	P	T	D	A	T	W	A	A	R	L	S	L	E	R	S	S	A	I	K	C	P	S	I	P	Y	H	L	L	T	F	K	K	L	Q	Q	L	L	C	D	.	.	V	D	R	V	L	V	P	V	A	F	C	G	D	S	D	K	A	G	L	L	Q	R
Template Known Secondary structure											S		S	S	G	G	G			S													S	S	S				T							T	T	S							T	T		.	.	T	T	T	T	T	T	T	T	S	S	T	T										T
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.
Template SS confidence
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.			.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
																				297	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	S	Y	V	R	K	P	I	Y	S	R	E	G	G	N	V	T	I	F	D	G	K	N	N	V	V	D	H	A	D	G	D	Y	A	D	E	P	M	I	Y	Q	A	F	Q	P	L	P	R	F	G	D	S	Y	T	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	F	V	P	Q	Y	S	L	N	P	K	E	V	G	E	E	A	V	E	K	D	V	L	Q	R	P	L	E	G	G	G	N	L	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	Y	V	V	M	S	R	I	Q	F	H	V	S	T	G	S	L	L	A	R	G	D	V	V	Q	L
Template Known Secondary structure		T								S	S	S	S	T	T	S								S								S	S	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T										B										T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
											351	.	.	.	.	.	.	.																.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	I	G	S	W	I	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	A	C	G	M	G	I	R	E	D	N	T	L	I	T	K	D	T	S	R	F	V	P	H	Y	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template Conservation																																													.	.
Template Sequence		E	R	N	M	C	S	E	V	G	I	F	G	V	I	L	S	A	A	K	G	S	S	V	G	T	N	G	S	S	V	L	F	N	T	F	A	G	Y	T	V	R	S	K	.	.	P	A	D	G	V	A	A	L	D	S	L	A	V	V
Template Known Secondary structure																				T	T				S	T	T	T	T	S															.	.
Template Predicted Secondary structure																																													.	.
Template SS confidence
		490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.			.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.