Job Description P0A705 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:04:22 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 418 % Identity 23% Template c2ywfA_ PDB info PDB header:translation Chain: A: PDB Molecule:gtp-binding protein lepa; PDBTitle: crystal structure of gmppnp-bound lepa from aquifex aeolicus Resolution 2.24 Å

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		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.						.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.
Query Sequence		V	T	I	M	G	H	V	D	H	G	K	T	S	L	L	D	Y	I	R	S	T	K	V	A	S	G	E	A	G	G	I	T	Q	H	I	G	A	Y	H	V	E	T	.	.	.	.	.	E	N	G	M	I	T	F	L	D	T	P	G	H	A	A	F	T	S	M	R	A	R	G	A	Q	A	T	D	I	V	V	L	V
Query Conservation																																												.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.
Template Sequence		F	C	I	I	A	H	V	D	H	G	K	S	T	L	A	D	R	L	L	E	.	.	.	.	Y	T	G	A	I	G	I	T	V	K	M	Q	A	V	R	M	F	Y	K	A	K	D	G	N	T	Y	K	L	H	L	I	D	T	P	G	H	V	D	F	S	Y	E	V	S	R	A	L	A	A	C	E	G	A	L	L	L
Template Known Secondary structure								T	T	S	S											.	.	.	.			T								S		S								T	T	S													S	G	G	G										T		S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.					.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		469	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.		530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.
Query SS confidence																																																															.
Query Sequence		V	A	A	D	D	G	V	M	P	Q	T	I	E	A	I	Q	H	A	K	A	A	Q	V	P	V	V	V	A	V	N	K	I	D	K	P	E	A	D	P	D	R	V	K	N	E	L	S	Q	Y	G	I	L	P	E	E	W	G	G	E	S	Q	.	F	V	H	V	S	A	K	A	G	T	G	I	D	E	L	L	D	A
Query Conservation																																																															.
Alig confidence																																																			.	.	.	.	.	.							.
Template Conservation																																																			.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	D	A	S	Q	G	I	E	A	Q	T	V	A	N	F	W	K	A	V	E	Q	D	L	V	I	I	P	V	I	N	K	I	D	L	P	S	A	D	V	D	R	V	K	K	Q	I	E	E	V	.	.	.	.	.	.	L	G	L	D	P	E	E	A	I	L	A	S	A	K	E	G	I	G	I	E	E	I	L	E	A
Template Known Secondary structure				T	T	T		S														T	T										T	T	S	T	T														.	.	.	.	.	.	T				G	G	G					B	T	T	T	T	B	S
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		104	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.							.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
		548	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.					.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.
Query SS confidence																																																														.	.	.	.
Query Sequence		I	L	L	Q	A	E	V	L	E	L	K	A	V	R	K	G	M	A	S	G	A	V	I	E	S	F	L	D	K	G	R	G	P	V	A	T	V	L	V	R	E	G	T	L	H	K	G	D	I	V	L	C	G	F	E	Y	G	R	V	R	.	.	.	.	A	M	R	N	E	L	G	Q	E	V	L	E	A	G	P	S
Query Conservation																																																														.	.	.	.
Alig confidence					.	.																																																								.	.	.	.
Template Conservation					.	.
Template Sequence		I	V	N	.	.	R	I	P	P	P	K	G	D	P	Q	K	P	L	K	A	L	I	F	D	S	Y	Y	D	P	Y	R	G	A	V	A	F	V	R	I	F	D	G	E	V	K	P	G	D	K	I	M	L	M	S	T	G	K	E	Y	E	V	T	E	V	G	A	Q	T	P	K	M	T	K	F	D	K	L	S	A	G
Template Known Secondary structure					.	.		S							T	T	S													T	T	T											S				T	T						T	T	T	T												S	S	S					S				T	T
Template Predicted Secondary structure					.	.
Template SS confidence
		178	.	180			.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
		624	.	.	.	.	.					630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.			.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.																																																									.	.
Query SS confidence								.	.	.	.																																																									.	.
Query Sequence		I	P	V	E	I	L	.	.	.	.	G	L	S	G	V	P	A	A	G	D	E	V	T	V	V	R	D	E	K	K	A	R	E	V	A	L	Y	R	Q	G	K	F	R	E	V	K	L	A	R	Q	Q	K	S	K	L	E	N	M	F	A	N	M	T	E	G	E	.	.	V	H	E	V	N	I	V	L	K	A	D	V
Query Conservation								.	.	.	.																																																									.	.
Alig confidence								.	.	.	.						.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Conservation																	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	V	G	Y	I	A	A	S	I	K	D	V	R	D	I	.	R	I	G	D	T	I	T	H	A	K	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	T	K	E	P	V	P	G	F	Q	P	A	K	P	M	V	Y	A	G	I	Y	P	A	E
Template Known Secondary structure								S					G	G	G	S	.		T	T						S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S			S																	T
Template Predicted Secondary structure																	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270		.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
		698	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.			.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.			.	.	770	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.																					.	.
Query SS confidence																																																				.	.																					.	.
Query Sequence		Q	G	S	V	E	A	I	S	D	S	L	L	K	L	S	T	D	E	V	K	V	K	I	I	G	S	G	V	G	G	I	T	E	T	D	A	T	L	A	A	A	S	N	A	I	L	V	G	F	N	.	.	V	R	A	D	A	S	A	R	K	V	I	E	A	E	S	L	D	L	R	Y	.	.	Y	S	V	I	Y	N
Query Conservation																																																				.	.																					.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.																					.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	T	T	Y	E	E	L	R	D	A	L	E	K	Y	A	I	N	D	A	A	I	V	Y	E	P	E	S	S	P	A	L	G	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	R	V	G	F	L	G	L	L	H	M	E	I	V	Q	E	R	L	E	R	E	Y	G	V	K	I	I	T	T	A	P	N	V	I	Y	R
Template Known Secondary structure		T															T	T		S	S									T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S															S
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.											.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
		774	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.											790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.										.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	I	D	E	V	K	A	A	M	S	G	M	L	S	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	Q	Q	I	I	G	L	A	E	V	R	D	V	F	K	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	F	G	A	I	A	G	C	M	V	T	E	G	V	V	K	R	H	N	P	I	R	V	L	R	D	N
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	K	K	K	F	T	D	E	V	I	E	V	R	N	P	M	D	F	P	D	N	A	G	L	I	E	Y	V	E	E	P	F	V	L	V	T	I	I	T	P	K	E	Y	V	G	P	I	I	Q	L	C	Q	E	K	R	G	I	Q	K	N	M	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	D	P	N
Template Known Secondary structure					T	T		S	S					S	S	G	G	G	S		S		G	G	G																	G	G	G											T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.														.	.	440	.	.
		835	.	.	.	.	840	.	.				.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.		.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.																									.
Query SS confidence										.	.	.																									.
Query Sequence		V	V	I	Y	E	G	E	L	.	.	.	E	S	L	R	R	F	K	D	D	V	N	E	V	R	N	G	M	E	C	G	I	G	V	K	.	N	Y	N	D	V	R	T	G	D	V	I	E	V
Query Conservation										.	.	.																									.
Alig confidence										.	.	.																			.	.	.				.
Template Conservation																															.	.	.
Template Sequence		T	V	Y	L	E	Y	E	M	P	L	S	E	I	I	V	D	F	H	D	K	I	K	S	I	S	R	G	F	A	.	.	.	S	Y	D	Y	E	F	I	G	Y	R	P	S	D	L	I	K	L
Template Known Secondary structure																										T	T	T			.	.	.
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.
Template SS confidence
		443	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.				.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.