Job Description P36837 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:53:54 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 414 % Identity 10% Template d1pw4a_ SCOP info MFS general substrate transporter MFS general substrate transporter Glycerol-3-phosphate transporter Resolution 3.30

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.				.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.
Query Sequence		N	T	T	T	P	M	G	M	L	Q	Q	P	R	P	F	F	M	I	F	F	V	E	L	W	E	R	F	G	Y	Y	G	V	.	.	.	Q	G	V	L	A	V	F	F	V	K	Q	L	G	F	S	Q	E	Q	A	F	V	T	F	G	A	F	A	A	L	V	Y	G	L	I	S	I	G	G	Y	V	G	D	H	L	L
Query Conservation																																		.	.	.
Alig confidence																																		.	.	.										.																																			.
Template Conservation																																														.																																			.
Template Sequence		R	L	P	A	A	E	I	D	P	T	Y	R	R	L	R	W	Q	I	F	L	G	I	F	F	G	Y	A	A	Y	Y	L	V	R	K	N	F	A	L	A	M	P	Y	L	V	.	E	Q	G	F	S	R	G	D	L	G	F	A	L	S	G	I	S	I	A	Y	G	F	S	K	F	I	M	G	S	V	S	D	R	S	.
Template Known Secondary structure						S																													T	S								T	T	.	S	S	T	T		S	S																											S	.
Template Predicted Secondary structure																																														.																																			.
Template SS confidence
		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.		.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.					.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.
Query Sequence		G	T	K	R	T	I	V	L	G	A	L	V	L	A	I	G	Y	F	M	T	.	.	.	.	G	M	S	L	L	K	P	D	L	I	F	I	A	L	G	T	I	A	V	G	N	G	L	F	K	A	N	P	A	S	L	L	S	K	C	Y	P	P	K	D	P	R	L	D	G	A	F	T	L	F	Y	M	S	I	N	I
Query Conservation																						.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.																																				.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.
Template Sequence		N	P	R	V	F	L	P	A	G	L	I	L	A	A	A	V	M	L	F	M	G	F	V	P	W	A	T	S	S	I	A	V	M	F	V	L	L	F	L	C	G	W	F	Q	G	M	G	W	P	P	C	G	R	T	M	V	H	W	W	.	.	.	S	Q	K	E	R	G	G	I	V	S	V	W	N	C	A	H	N	V
Template Known Secondary structure																													S	S	S	S																T										T	T		.	.	.	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.
Template SS confidence
		91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.				150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.		.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.
Predicted Secondary structure																.
Query SS confidence																.
Query Sequence		G	S	L	I	A	L	S	L	A	P	V	I	A	D	.	R	F	G	Y	S	V	T	Y	N	L	C	G	A	G	L	I	I	A	L	L	V	Y	I	A	C	R	G	M	V	K	D	I	G	S	E	P	D	F	R	P	M	S	F	S	K	L	L	Y	V	L	L	G	S	V	V	M	I	F	V	C	A	W	L	M	H
Query Conservation																.
Alig confidence																.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	G	G	I	P	P	L	L	F	L	L	G	M	A	W	F	N	D	W	H	A	A	L	Y	M	P	A	F	C	A	I	L	V	A	L	F	A	F	A	M	M	R	D	T	P	Q	S	C	G	L	P	P	I	E	E	Y	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	S												T			S	T	T		T																					S	S	T	T	T				S		T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
		234	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	V	E	V	A	N	L	V	L	I	V	L	S	I	V	V	T	I	I	F	F	R	Q	A	F	K	L	D	K	T	G	R	N	K	M	F	V	A	F	V	L	M	L	E	A	V	V	F	Y	I	L	Y	A	Q	M	P	T	S	L	N	F	F	A	I	N	N	V	H	H	E	I	L	G	F	S	I	N	P	V	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	D	T	A	K	Q	I	F	M	Q	Y	V	L	P	N	K	L	L	W	Y	I	A	I	A	N	V	F	V	Y	L	L	R	Y	G	I	L	D	W	S	P	T	Y	L	K	E	V	K	H	F	A	L	D	K	S	S	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T							T	S	S																													B	T	T	B	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																										225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
		314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	Q	A	L	N	P	F	W	V	V	L	A	S	P	I	L	A	G	I	Y	T	H	L	G	N	K	G	K	D	L	S	M	P	M	K	F	T	L	G	M	F	M	C	S	L	G	F	L	T	A	A	A	A	G	M	W	F	A	D	A	Q	G	L	T	S	P	W	F	I	V	L	V	Y	L	F	Q	S	L	G	E
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	Y	F	L	Y	E	Y	A	G	I	P	G	T	L	L	C	G	W	M	S	D	K	V	F	R	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	G	A	T	G	V	F	F	M	T	L	V	T	I	A	T	I	V	Y	W	M	N	P	A	G	N	P	T	V	D	M	I	C	M	I	V	I	G	F	L	I
Template Known Secondary structure																								T	S	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			T	T	S			T	T
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320													.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.		.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Predicted Secondary structure																																			.
Query SS confidence																																			.
Query Sequence		L	F	I	S	A	L	G	L	A	M	I	A	A	L	V	P	Q	H	L	M	G	F	I	L	G	M	W	F	L	T	Q	A	A	.	A	F	L	L	G	G	Y	V	A	T	F	T	A	V	P	D	N	I	T	D	P	L	E	T	L	P	V	Y	T	N	V	F	G	K	I	G	L	V	T	L	G	V	A	V	V	M
Query Conservation																																			.
Alig confidence																																			.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	G	P	V	M	L	I	G	L	H	A	L	E	L	A	P	K	K	A	A	G	T	A	A	G	F	T	G	L	F	G	Y	L	G	G	S	V	A	A	S	A	I	V	G	Y	T	V	D	F	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	D	G	G	F	M	V	M	I	G	G	S	I	L	A	V	I	L	L
Template Known Secondary structure		T													T	S		T	T																															S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.											.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
		473	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	M	V	P	W	L	K	R	M	I	A	T	P	E	S	H
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		I	V	V	M	I	G	E	K	R	R	H	E	Q	L	L	Q	E
Template Known Secondary structure														G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		432	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.