Job Description P36837 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:53:54 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 401 % Identity 13% Template d1pv7a_ SCOP info MFS general substrate transporter MFS general substrate transporter LacY-like proton/sugar symporter Resolution 3.60

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		14	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	P	F	F	M	I	F	F	V	E	L	W	E	R	F	G	Y	Y	G	V	Q	G	V	L	A	V	F	F	V	K	Q	L	G	F	S	Q	E	Q	A	F	V	T	F	G	A	F	A	A	L	V	Y	G	L	I	S	I	G	G	Y	V	G	D	H	L	L	G	T	K	R	T	I	V	L	G	A	L	V	L	A	I
Query Conservation
Alig confidence																																																																		.
Template Conservation																																																																		.
Template Sequence		T	N	F	W	M	F	G	L	F	F	F	F	Y	F	F	I	M	G	A	Y	F	P	F	F	P	I	W	L	H	D	I	N	H	I	S	K	S	D	T	G	I	I	F	A	A	I	S	L	F	S	L	L	F	Q	P	L	F	G	L	L	S	D	K	L	.	G	L	R	K	Y	L	L	W	I	I	T	G	M	L	V
Template Known Secondary structure																																																						T												.	T	T		T
Template Predicted Secondary structure																																																																		.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70		.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
		94	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.				.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170
Predicted Secondary structure																	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.
Query Sequence		G	Y	F	M	T	G	M	S	L	L	K	P	D	L	I	.	.	.	F	I	A	L	G	T	I	A	V	G	N	G	L	F	K	A	N	P	A	S	L	L	S	K	C	Y	P	P	K	D	P	R	L	D	G	A	F	T	L	F	Y	M	S	I	N	I	G	S	L	I	A	L	S	L	A	P	V	I	A	D	R	F
Query Conservation																	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	F	A	P	F	F	I	F	I	F	G	P	L	L	Q	Y	N	I	L	V	G	S	I	V	G	G	I	Y	L	G	F	C	F	N	A	G	A	P	A	V	E	A	F	I	E	K	V	S	R	R	S	N	F	E	F	G	R	A	R	M	F	G	C	V	G	W	A	L	G	A	S	I	V	G	I	M	F	T	I	N
Template Known Secondary structure		T								T							T	T								T	T	T	T	G	G	G	G	G	T	T																	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
		171	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	Y	S	V	T	Y	N	L	C	G	A	G	L	I	I	A	L	L	V	Y	I	A	C	R	G	M	V	K	D	I	G	S	E	P	D	F	R	P	M	S	F	S	K	L	L	Y	V	L	L	G	S	V	V	M	I	F	V	C	A	W	L	M	H	N	V	E	V	A	N	L	V	L	I	V	L	S	I	V	V	T
Query Conservation
Alig confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	Q	F	V	F	W	L	G	S	G	C	A	L	I	L	A	V	L	L	F	F	A	K	T	D	A	P	S	S	A	T	V	A	N	A	V	G	A	N	H	S	A	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																						S	S				S		S	S	S		S	S					S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	I	F	F	R	Q	A	F	K	L	D	K	T	G	R	N	K	M	F	V	A	F	V	L	M	L	E	A	V	V	F	Y	I	L	Y	A	Q	M	P	T	S	L	N	F	F	A	I	N	N	V	H	H	E	I	L	G	F	S	I	N	P	V	S	F	Q	A	L	N	P	F	W	V	V	L	A	S	P	I	L	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	K	L	A	L	E	L	F	R	Q	P	K	L	W	F	L	S	L	Y	V	I	G	V	S	C	T	Y	D	V	F	D	Q	Q	F	A	N	F	F	T	S	F	F	A	T	G	E	Q	G	T	R	V	F	G	Y	V	T	T	M	G	E	L	L	N	A	S	I	M	F	F	A	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.									T	T	S	S																												T	T	S	S	S																									T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										209	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	I	Y	T	H	L	G	N	K	G	K	D	L	S	M	P	M	K	F	T	L	G	M	F	M	C	S	L	G	F	L	T	A	A	A	A	G	M	W	F	A	D	A	Q	G	L	T	S	P	W	F	I	V	L	V	Y	L	F	Q	S	L	G	E	L	F	I	S	A	L	G	L	A	M	I	A	A	L	V	P	Q
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	I	I	N	R	I	G	G	K	N	A	L	L	L	A	G	T	I	M	S	V	R	I	I	G	S	S	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	T	S	A	L	E	V	V	I	L	K	T	L	H	M	F	E	V	P	F	L	L	V	G	C	F	K	Y	I	T	S	Q	F	E	V
Template Known Secondary structure																													T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	S		G
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
		411	.	.	.	.	.	.	.	.		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.
Query SS confidence											.
Query Sequence		H	L	M	G	F	I	L	G	M	.	W	F	L	T	Q	A	A	A	F	L	L	G	G	Y	V	A	T	F	T	A	V	P	D	N	I	T	D	P	L	E	T	L	P	V	Y	T	N	V	F	G	K	I	G	L	V	T	L	G	V	A	V	V	M	L	L	M	V	P	W	L	K	R	M	I	A	T	P	E
Query Conservation											.
Alig confidence											.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	F	S	A	T	I	Y	L	V	C	F	C	F	F	K	Q	L	A	M	I	F	M	S	V	L	A	G	N	M	Y	E	S	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	Q	G	A	Y	L	V	L	G	L	V	A	L	G	F	T	L	I	S	V	F	T	L	S	G	P	G	P	L	S	L	L	R	R
Template Known Secondary structure		G	G										T	T	T																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							S			S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.											.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.