![]() |
|
![]() |
  | Insertion relative to template |
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
  | |
Detailed help on interpreting your alignment |
  |   | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 |
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | M | F | Q | Q | E | V | T | I | T | A | P | N | G | L | H | T | R | P | A | A | Q | F | V | K | E | A | K | G | F | T | S | E | I | T | V | T | S | N | G | K | S | A | S | A | K | S | L | F | K | L | Q | T | L | G | L | T | Q | G | T | V | V | T | I | S | A | E | G | E | D | E | Q | K | A | V | E | H | L | V | K | L |
Template Sequence |   | X | V | Q | K | R | V | Q | V | S | L | K | N | G | L | Q | A | R | P | A | A | L | F | V | Q | E | A | N | R | F | H | A | D | I | F | I | E | K | D | G | K | T | V | N | A | K | S | I | X | G | I | X | S | L | A | I | G | T | G | S | X | I | T | I | T | T | E | G | S | D | A | E | E | A | L | E | A | L | A | A | Y |
Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | B | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | B | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||
  |   | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 |
  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 81 | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | M | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | V | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 81 | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Download: | Text version | FASTA pairwise alignment | 3D Model in PDB format |
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
  | ||||||||
|
|