Job Description Q46904 Confidence 99.53% Date Thu Jan 5 12:35:41 GMT 2012 Rank 61 Aligned Residues 318 % Identity 15% Template c1s3bB_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: B: PDB Molecule:amine oxidase [flavin-containing] b; PDBTitle: crystal structure of maob in complex with n-methyl-n-2 propargyl-1(r)-aminoindan Resolution 1.65 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.																.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	D	C	D	I	I	I	I	G	A	G	I	A	G	T	A	C	A	L	R	C	A	R	A	G	L	S	V	L	L	L	E	R	A	E	I	P	G	S	K	N	L	S	G	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	Y	T	H	A	L	A	E	L	L	P	Q	F	H	L	T	A	P	L
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	K	C	D	V	V	V	V	G	G	G	I	S	G	M	A	A	A	K	L	L	H	D	S	G	L	N	V	V	V	L	E	A	R	D	R	V	G	G	R	T	Y	T	L	R	N	Q	K	V	K	Y	V	D	L	G	G	S	Y	V	G	P	T	Q	N	R	I	L	R	L	A	K	E	L	G	L	E	T	Y	K	V
Template Known Secondary structure			B		S							B													T	T								S	S	S	S	S	B	T	T							T	T	T					S	S						T	T											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
		68	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	R	R	I	T	H	E	S	L	S	L	L	T	P	D	G	V	T	T	F	S	S	L	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.
Template Sequence		N	.	.	E	V	E	R	L	I	H	H	V	K	G	K	S	Y	P	F	R	G	P	F	P	P	V	W	N	P	I	T	Y	L	D	H	N	N	F	W	R	T	M	D	D	M	G	R	E	I	P	S	D	A	P	W	K	A	P	L	A	E	E	W	D	N	M	T	M	K	E	L	L	D	K	L	C	W	T	E	S
Template Known Secondary structure			.	.		S	S							T	T							S	S	S					S																			T	T	S		T	T		G	G	G	S	T	T						T	S	B										S	S
Template Predicted Secondary structure			.	.
Template SS confidence
		83			.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
																																											92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	G	E	S	W	S	V	L	R	A	R	F	D	P	W	L	V	A	E	A	E	K	E	G	V	E	C	I	P	G	A	T	V	D	A	L	Y	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	K	Q	L	A	T	L	F	V	N	L	C	V	T	A	E	T	H	E	V	S	A	L	W	F	L	W	Y	V	K	Q	C	G	G	T	T	R	I	I	S	T	T	N	G	G	Q	E	R	K	F	V	G	G	S	G	Q	V	S	E	R	I	M	D	L	L	G	D	R	V	K	L	E	R	P	V	I	Y	I	D	Q
Template Known Secondary structure															S	S		T	T	T	S	B										T	T	T								S	T	T	S	T	T	S				T	T		T												G	G	G			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
		131	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.											160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	N	G	R	V	C	G	V	I	C	G	D	D	I	L	R	A	R	Y	V	V	L	A	E	G	A	N	S	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	E	R	H	G	L	V	T	R	P	A	G	E	A	M	A	L	G	I	K	E	V	L	S	L	E	T	S	A	I	E	E	R	F	H	L	E	N	N	E
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	R	E	N	V	L	V	E	T	L	N	H	E	M	Y	E	A	K	Y	V	I	S	A	I	P	P	T	L	G	M	K	I	H	F	N	P	P	L	P	M	M	R	N	Q	M	I	T	R	V	P	L	G	S	V	I	K	C	I	V	Y	Y	K	E	P	F	W	R	K	K	D	Y	C	G	T	M	I	I	D	G	E
Template Known Secondary structure		S	S	S	S						T	T	S						S						S		G	G	G	G	G	G	S				S										T	T	S			B											S	S		G	G	G	G	G	T									S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		G	A	A	L	L	F	S	G	R	I	C	D	D	L	P	G	G	A	F	L	Y	T	N	Q	Q	T	L	S	L	G	I	V	C	P	L	S	S	L	T	Q	S	R	V	P	A	S	E	L	L	T	R	F	K	A	H	P	A	V	R	P	L	I	K	N	T	E	S	L	E	Y	G	A	H	L	V	P	E	G	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.																							.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Template Sequence		E	A	P	V	A	Y	T	L	D	D	T	K	P	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	N	Y	A	A	I	M	G	F	I	L	A	H	K	A	R	K	L	A	R	L	T	K	E	E	R	L	K	K	L	C	E	.	.	L	Y	A	K	V	L	G	S	L	E	A	L	E	P	V	H	Y	E	E	K	N	W	C	E
Template Known Secondary structure		S		S		S								T	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S		S									T							T	T	S												.	.							T		G	G	G	G			S							G	G	G
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.									.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.			.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
																			279	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	H	S	M	P	V	Q	Y	A	G	N	G	W	L	L	V	G	D	A	L	R	S	C	V	N	T	G	I	S	V	R	G	M	D	M	A	L	T	G	A	Q	A	A	A	Q	T	L	I	S	A	C	Q	H	R	E	P	Q	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.
Template Sequence		E	Q	Y	S	G	G	C	Y	T	T	Y	F	P	P	G	I	L	T	Q	Y	G	R	V	L	R	Q	P	V	D	R	I	Y	F	A	G	T	E	T	A	.	.	.	.	.	T	H	W	S	G	Y	M	E	G	A	V	E	A	G	E	R	A	A	R	E	I	L	H	A	M	G	K	I	P	E	D	E
Template Known Secondary structure			T	T	T		S	S	S		B				T	T						G	G	G	T	T			B	T	T					S	G	G	G		.	.	.	.	.	S	S	S	T	T	S																			T	T	S	S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.						430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.