Job Description P55138 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:06:08 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 465 % Identity 22% Template c3jvpA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:ribulokinase; PDBTitle: crystal structure of ribulokinase from bacillus halodurans Resolution 2.31 Å

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.		.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.											.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.
Predicted Secondary structure																					.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	Y	I	I	G	I	D	G	G	S	Q	S	T	K	V	V	M	Y	D	.	L	E	G	N	V	V	C	E	G	K	G	L	L	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	M	H	T	P	D	A	D	T	A	E	H	P	D	D	D	L	W	A	S	L	C	F	A	G	H	D	L	M	S	Q	F	A	G	N	K
Query Conservation																					.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		K	Y	T	I	G	V	D	Y	G	T	E	S	G	R	A	V	L	I	D	L	S	N	G	Q	E	L	A	D	H	V	T	P	Y	R	H	G	V	I	D	Q	Y	L	P	N	T	N	I	K	L	G	H	E	W	A	L	Q	H	P	L	D	Y	V	E	V	L	T	T	S	V	P	A	V	M	K	E	D	A	.	.	.
Template Known Secondary structure											S	S									T	T	T												T	T			B	S	S	B	S	T	T	S			B			T	T														T	T											.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
		73	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	D	I	V	G	I	G	L	G	S	I	R	C	C	R	A	L	L	K	A	D	G	T	P	A	A	P	L	I	S	W	Q	D	A	R	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	D	V	I	G	I	G	V	D	F	T	A	C	T	M	L	P	V	D	E	E	G	Q	P	L	C	L	L	A	Q	Y	K	D	N	P	H	S	W	V	K	L	W	K	H	H	A	A	Q	D	K	A	N	A	I	N	E	M	A	E	K	R	G	E	A	F	L	P	R	Y	G	G	K	I	S	S	E	W	M	I	A
Template Known Secondary structure		S											S	S							T	T	S		B	G	G	G	S	S	S	T	T	S	S	G	G	G	S				T	T			T	T															T		T	T	G	G	G	G	T	T				S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
			109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.					120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.							.	.
Predicted Secondary structure		.												.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.												.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	T	R	P	Y	E	H	T	N	P	D	V	.	.	.	.	A	Y	V	T	S	F	S	G	Y	L	T	H	R	L	T	G	E	F	K	D	N	I	A	N	Y	F	G	Q	W	P	V	D	Y	K	S	W	A	W	S	E	D	A	A	V	M	D	K	F	N	I	P	R	H	M	L	F	.	.	.	.	.	.	D	V
Query Conservation		.												.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.												.	.	.	.																																										.	.														.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.
Template Sequence		K	V	W	Q	I	L	D	E	A	E	D	V	Y	N	R	T	D	Q	F	L	E	A	T	D	W	I	V	S	Q	M	T	G	K	I	V	K	N	S	C	T	A	G	Y	K	A	I	W	H	K	R	E	G	Y	P	S	N	E	.	.	F	F	K	A	L	D	P	R	L	E	H	L	T	T	T	K	L	R	G	D	I
Template Known Secondary structure																		S															S	S												S			B	T	T	T	B	S					.	.				T	T		G	G	G	T	T	S	T	T	T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.			.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
		178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	M	P	G	T	V	L	G	H	I	T	P	Q	A	A	L	A	T	H	F	P	A	G	L	P	V	V	C	T	T	S	D	K	P	V	E	A	L	G	A	G	L	L	D	D	E	T	A	V	I	S	L	G	T	Y	I	A	L	M	M	N	G	K	A	L	P	K	D	P	V	A	Y	W	P	I	M	S	S	I	P
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	P	L	G	E	R	A	G	G	L	L	P	E	M	A	E	K	M	G	L	N	P	G	I	A	V	A	V	G	N	V	D	A	H	A	A	V	P	A	V	G	V	T	T	P	G	K	L	V	M	A	M	G	T	S	I	C	H	M	L	L	G	E	K	E	Q	E	V	E	G	M	C	G	V	V	E	D	G	I	I
Template Known Secondary structure				T	T	S														T	S		T	T									T	T	T	T					T	T			S	S								S	S	S								S	S					T	T		S					T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
		258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.		.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.				.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.																																				.	.	.
Query SS confidence																												.																																				.	.	.
Query Sequence		Q	T	L	L	Y	E	G	Y	G	I	R	K	G	M	W	T	V	S	W	L	R	D	M	L	G	E	.	S	L	I	Q	D	A	R	A	Q	D	L	S	P	E	D	L	L	N	K	K	A	S	C	V	P	P	G	C	N	G	L	M	T	V	L	.	.	.	D	W	L	T	N	P	W	E	P	Y	K	R	G	I	M
Query Conservation																												.																																				.	.	.
Alig confidence																												.																																				.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	G	Y	L	G	Y	E	A	G	Q	S	A	V	G	D	I	F	A	W	F	V	K	H	G	V	S	A	A	T	F	D	E	A	Q	E	K	G	V	N	V	H	A	L	L	E	E	K	A	S	Q	L	R	P	G	E	S	G	L	L	A	L	D	W	W	N	G	N	R	S	I	L	V	D	T	E	L	S	G	M	L
Template Known Secondary structure		T	T	S								S		S											T	S											T	T												T	S	S		T	T	S	S								T	T				T	T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380		.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.
Query SS confidence																																																	.
Query Sequence		I	G	F	D	S	S	M	D	Y	A	W	I	Y	R	S	I	L	E	S	V	A	L	T	L	K	N	N	Y	D	N	M	C	N	E	M	N	H	F	A	K	H	V	I	I	T	G	G	.	G	S	N	S	D	L	F	M	Q	I	F	A	D	V	F	N	L	P	A	R	R	N	A	I	N	G	C	A	S	L	G	A
Query Conservation																																																	.
Alig confidence																																			.														.
Template Conservation																																			.
Template Sequence		L	G	Y	T	L	Q	T	K	P	E	E	I	Y	R	A	L	L	E	A	T	A	F	G	T	R	A	I	V	D	A	F	H	G	.	R	G	V	E	V	H	E	L	Y	A	C	G	G	L	P	Q	K	N	H	L	L	M	Q	I	F	A	D	V	T	N	R	E	I	K	V	A	A	S	K	Q	T	P	A	L	G	A
Template Known Secondary structure						T	T																											T	.	T	T										S	S																	T	S					B			S	S
Template Predicted Secondary structure																																			.
Template SS confidence
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.		.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
		413	.	.	.	.	.	.	420	.	.					.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.		.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.					.	.	.	470	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.															.																															.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.															.																															.	.	.	.
Query Sequence		A	I	N	T	A	V	G	L	G	L	.	.	.	.	Y	P	D	Y	A	T	A	V	D	N	M	V	R	V	.	K	D	I	F	I	P	I	E	S	N	A	K	R	Y	D	A	M	N	K	G	I	F	K	D	L	T	K	H	T	D	.	.	.	.	V	I	L	K	K	S	Y	E	V
Query Conservation												.	.	.	.															.																															.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.															.																				.											.	.	.	.
Template Conservation																																																		.
Template Sequence		A	M	F	A	S	V	A	A	G	S	E	V	G	G	Y	D	S	I	E	E	A	A	K	K	M	G	R	V	K	D	E	T	F	K	P	I	P	E	H	V	A	I	Y	E	K	L	Y	Q	.	E	Y	V	T	L	H	D	Y	F	G	R	G	A	N	D	V	M	K	R	L	K	A	L
Template Known Secondary structure											S	S	S	S	S		S												B		S			B																.											S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																		.
Template SS confidence
		482	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.		530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.