Job Description P55138 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:06:08 GMT 2012 Rank 17 Aligned Residues 424 % Identity 18% Template c3i8bA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:xylulose kinase; PDBTitle: the crystal structure of xylulose kinase from2 bifidobacterium adolescentis Resolution 2.00 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	K	K	Y	I	I	G	I	D	G	G	S	Q	S	T	K	V	V	M	Y	D	L	E	G	N	V	V	C	E	G	K	G	L	L	Q	P	M	H	T	P	D	A	D	T	A	E	H	P	D	D	D	L	W	A	S	L	C	F	A	G	H	D	L	M	S	Q	F	A	G	N	K	E	D	I	V	G	I	G	L	G
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Template Sequence		L	R	T	L	V	A	G	V	D	T	S	T	Q	S	C	K	V	R	V	T	D	A	E	T	G	E	L	V	R	F	G	Q	A	.	.	.	.	.	.	K	H	P	N	G	T	S	V	D	P	S	Y	W	W	S	A	F	Q	E	A	A	E	Q	A	.	.	.	.	.	G	G	L	D	D	V	S	A	L	A	V	G
Template Known Secondary structure			S										S	S									T	T	T										.	.	.	.	.	.				S	S	S				T														T	.	.	.	.	.	T		S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.							.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.						.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110																																																	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	I	R	C	C	R	A	L	L	K	A	D	G	T	P	A	A	P	L	I	S	W	Q	D	A	R	V	T	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Y	E
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	Q	Q	H	G	X	V	I	L	D	N	Q	G	N	V	I	R	D	A	X	L	W	N	D	T	S	S	A	P	Q	A	A	A	L	I	E	K	L	G	A	A	P	A	Q	D	G	E	P	E	D	P	I	A	R	G	K	Q	R	W	V	K	A	V	G	S	S	P	V	A	S	Y	T	L	T	K	V	A	W	V	A
Template Known Secondary structure				S	S		B					T	T	S		B		S					T	T			T	T														S				T	T			S	S														S	S				T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
		114	.	.	.	.	.	120					.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.														.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	T	N	P	D	V	A	.	.	.	.	Y	V	T	S	F	S	G	Y	L	T	H	R	L	T	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	K	D	N	I	A	N	Y	F	G	Q	W	P	V	D	Y	K	S	W	A	W	S	E	D	A	A	V	M	D	K	F	N	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation									.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																		.	.
Template Sequence		E	N	E	P	E	N	V	K	K	I	A	A	I	C	L	P	H	D	W	L	S	W	R	I	A	G	Y	G	P	V	A	E	G	E	D	A	H	L	E	A	L	F	T	D	R	S	D	A	S	G	T	I	Y	Y	D	A	A	S	N	E	Y	R	R	D	.	.	L	I	A	X	V	L	E	A	A	E	G	A	K	A
Template Known Secondary structure									T	T		S														T	T						T	T	S				G	G	G									T	T	S	S	S			T	T	T	T						.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.
Template SS confidence
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.			.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
						169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	I	P	R	H	M	L	F	D	V	Q	M	P	G	T	V	L	G	H	I	T	P	Q	A	A	L	A	T	H	F	P	A	G	L	P	V	V	C	T	T	S	D	K	P	V	E	A	L	G	A	G	L	L	D	D	E	T	A	V	I	S	L	G	T	Y	I	A	L	M	M	N	G	K	A	L	P	K
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																																					.
Template Conservation																																																										.
Template Sequence		A	Q	S	H	A	E	A	I	V	L	P	T	V	L	G	P	R	D	A	A	P	V	K	A	D	P	A	I	A	G	K	N	V	E	G	G	C	L	L	A	P	G	G	G	D	N	A	X	A	S	L	G	L	G	X	A	.	V	G	D	V	S	I	S	L	G	T	S	G	V	A	A	A	I	S	E	N	P	T	Y
Template Known Secondary structure									S	B							T	T				S	S				T	T	T	T	T	T	T	S	T	T																		T	T			.	T	T							S	S	S							B	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																										.
Template SS confidence
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.		.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.				.	320	.
Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.
Query SS confidence																																																																												.	.	.
Query Sequence		D	P	V	A	Y	W	P	I	M	S	S	I	P	Q	T	L	L	Y	E	G	Y	G	I	R	K	G	M	W	T	V	S	W	L	R	D	M	L	G	E	S	L	I	Q	D	A	R	A	Q	D	L	S	P	E	D	L	L	N	K	K	A	S	C	V	P	P	G	C	N	G	L	M	T	V	L	.	.	.	D	W	L
Query Conservation																																																																												.	.	.
Alig confidence																							.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template Conservation																							.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	L	T	G	A	V	S	G	F	A	D	C	T	G	H	Y	L	P	L	A	C	.	T	I	N	G	S	R	I	L	D	A	G	R	A	A	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	D	Y	D	E	L	A	K	L	A	F	A	S	K	P	G	A	N	G	I	T	L	V	P	Y	F	D	G	E	R
Template Known Secondary structure			T	T	S		S						S	S	S	S							.		S		S	T											T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													S		T	T	G	G	G							T	T		B	T
Template Predicted Secondary structure																							.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.		.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.													.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	N	P	W	E	P	Y	K	R	G	I	M	I	G	F	D	S	S	M	D	Y	A	W	I	Y	R	S	I	L	E	S	V	A	L	T	L	K	N	N	Y	D	N	M	C	N	E	M	N	H	F	A	K	H	V	I	I	T	G	G	G	S	N	S	D	L	F	M	Q	I	F	A	D	V	F	N	L	P	A	R	R
Query Conservation
Alig confidence																																															.
Template Conservation																																															.
Template Sequence		T	P	N	R	P	N	A	T	A	T	F	S	G	X	T	L	A	N	T	T	R	E	N	L	A	R	A	F	V	E	G	L	L	C	S	Q	R	D	C	L	E	L	I	R	S	.	L	G	A	S	I	T	R	I	L	L	I	G	G	G	A	K	S	E	A	I	R	T	L	A	P	S	I	L	G	X	D	V	T	R
Template Known Secondary structure		T	T	T	B	T	T							S			T	T	T		S																										.	T	T										S	G	G	G	G													T	S
Template Predicted Secondary structure																																															.
Template SS confidence
		375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	A	I	N	G	C	A	S	L	G	A	A	I	N	T	A	V	G	L	G	L	Y	P	D	Y	A	T	A	V	D	N	M	V	R	V	K	D	I	F	I	P	I	E	S	N	A	K	R	Y	D	A	M	N
Query Conservation
Alig confidence																														.
Template Conservation																														.
Template Sequence		P	A	T	D	E	Y	V	A	I	G	A	A	R	Q	A	A	W	V	L	S	G	E	T	E	P	P	A	W	.	Q	L	T	I	D	G	V	E	T	G	E	P	T	E	A	V	Y	E	A	Y	A	K	A	R
Template Known Secondary structure																								S	S					.
Template Predicted Secondary structure																														.
Template SS confidence
		454	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.		.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.