Job Description P55138 Confidence 88.35% Date Thu Jan 5 12:06:08 GMT 2012 Rank 129 Aligned Residues 308 % Identity 20% Template c2iirJ_ PDB info PDB header:transferase Chain: J: PDB Molecule:acetate kinase; PDBTitle: acetate kinase from a hypothermophile thermotoga maritima Resolution 3.30 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.		.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.									.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70
Predicted Secondary structure																								.												.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Query SS confidence																								.												.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Query Sequence		M	S	K	K	Y	I	I	G	I	D	G	G	S	Q	S	T	K	V	V	M	Y	D	.	L	E	G	N	V	V	C	E	G	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	Q	P	M	H	T	P	D	A	D	T	A	E	H	P	D	D	D	L	W	A	S	L	C	F	A	G	H	D	L	M	S	Q	F	A	G	.
Query Conservation																								.												.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Alig confidence				.	.	.																		.												.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Template Conservation				.	.	.
Template Sequence		M	R	.	.	.	V	L	V	I	N	S	G	S	S	S	I	K	Y	Q	L	I	E	M	E	G	E	K	V	L	C	K	G	I	A	E	R	I	G	I	E	G	S	R	L	V	H	R	V	G	D	E	K	H	V	I	E	R	E	L	P	D	H	E	E	A	L	K	L	I	L	N	T	L	V	D	E	K	L	G	V
Template Known Secondary structure				.	.	.								T	T									T	T	T	T											T	T	S	T	T								T	T											S															T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.
Template SS confidence
		1	.				.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
				71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.						.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																																																.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																																																.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	N	K	E	D	I	V	G	I	G	L	G	S	I	R	C	C	R	A	L	L	K	A	D	G	T	P	A	A	P	L	I	S	W	Q	D	A	R	V	T	R	P	Y	E	H	T	N	P	.	.	.	.	.	D	V	A	Y	V	T	S	F	S	G	Y	L	T	H	R	L	T	G	E	F	K	D	N	I	A	N
Query Conservation		.	.																																																.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	K	D	L	K	E	I	D	A	V	G	H	R	V	V	H	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	R	F	K	E	S	V	L	V	D	E	E	V	L	K	A	I	E	E	V	S	P	L	A	P	L	H	N	P	A	N	L	M	G	I	K	A	A	M	K	L	L	P	G	V	P	N	V	A	V	F	D	T
Template Known Secondary structure			S		S	T	T									S			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T		S	S																G	G	G	S	T	T	T															S	T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.										.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.
		144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.			.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
Predicted Secondary structure																																			.	.
Query SS confidence																																			.	.
Query Sequence		Y	F	G	Q	W	P	V	D	Y	K	S	W	A	W	S	E	D	A	A	V	M	D	K	F	N	I	P	R	H	M	L	F	D	.	.	V	Q	M	P	G	T	V	L	G	H	I	T	P	Q	A	A	L	A	T	H	F	P	A	G	L	P	V	V	C	T	T	S	D	K	P	V	E	A	L	G	A	G	L	L	D
Query Conservation																																			.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.						.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	F	H	Q	T	I	P	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	Y	L	Y	A	I	P	Y	E	Y	Y	E	K	Y	K	I	R	R	Y	G	.	F	H	G	T	S	H	R	Y	V	S	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	A	A	E	I	L	G	K	K	L	E	E
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	G				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	S		T									S				.	S											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T	S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		149	150	.	.	.	.	.	.												.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.		.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.									.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	E	T	A	V	I	S	L	G	T	Y	I	A	L	M	M	N	G	K	A	L	P	K	D	.	.	.	.	.	.	.	.	P	V	A	Y	W	P	I	M	S	S	I	P	Q	T	L	L	Y	E	G	Y	G	I	R	K	G	M	W	T	V	S	W	L	R	D	M	L	G	E	S	L	I	Q	D	A	R	A	Q	D
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.																					.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	K	I	I	T	C	H	I	G	N	G	A	S	V	A	A	V	K	Y	G	K	C	V	D	T	S	M	G	F	T	P	L	E	G	L	V	M	G	T	R	S	G	D	L	D	P	A	I	P	F	F	I	.	M	E	K	E	G	I	S	P	Q	E	M	Y	D	I	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										S	S	S								T	T						S			S	S	T	T	S	S	S			S	S				S			T	T						.					T											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																						.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.		.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.			.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.											350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
Predicted Secondary structure																																															.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	S	P	E	D	L	L	N	K	K	A	S	C	V	P	P	G	C	N	G	L	M	T	V	L	D	W	L	T	N	P	W	E	P	Y	K	R	G	I	M	I	G	F	D	S	.	.	S	M	D	Y	A	W	I	Y	R	S	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	S	V	A	L	T	L	K	N	N	Y
Query Conservation																																															.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	K	K	S	G	V	Y	G	L	S	K	G	F	S	S	D	M	R	D	I	E	E	A	A	L	K	G	D	E	W	C	K	L	V	L	E	I	Y	D	Y	R	I	A	K	Y	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S							T	T	T	S		S											T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																				268	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.		.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.
Query SS confidence																							.
Query Sequence		D	N	M	C	N	E	M	N	H	F	A	K	H	V	I	I	T	G	G	G	S	.	N	S	D	L	F	M	Q	I	F	A	D	V	F	N
Query Conservation																							.
Alig confidence											.												.
Template Conservation											.
Template Sequence		G	A	Y	A	A	A	M	N	G	.	V	D	A	I	V	F	T	A	G	V	G	E	N	S	P	I	T	R	E	D	V	C	S	Y	L	E
Template Known Secondary structure									T		.		S										T	T											T	T	G
Template Predicted Secondary structure											.
Template SS confidence
		314	.	.	.	.	.	320	.	.		.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low