Job Description P55138 Confidence 96.44% Date Thu Jan 5 12:06:08 GMT 2012 Rank 83 Aligned Residues 310 % Identity 18% Template c1tuuA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:acetate kinase; PDBTitle: acetate kinase crystallized with atpgs Resolution 2.50 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.		.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.										.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70
Predicted Secondary structure																								.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	S	K	K	Y	I	I	G	I	D	G	G	S	Q	S	T	K	V	V	M	Y	D	.	L	E	G	N	V	V	C	E	G	K	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	Q	P	M	H	T	P	D	A	D	T	A	E	H	P	D	D	D	L	W	A	S	L	C	F	A	G	H	D	L	M	S	Q	F	A	G
Query Conservation																								.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.																		.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.
Template Sequence		M	K	.	.	.	V	L	V	I	N	A	G	S	S	S	L	K	Y	Q	L	I	D	M	T	N	E	S	A	L	A	V	G	L	C	E	R	I	G	I	D	N	S	I	I	T	Q	K	K	F	D	G	K	K	L	E	K	L	T	D	L	P	T	H	K	D	A	L	E	E	V	V	K	A	L	T	D	D	E	F	G
Template Known Secondary structure				.	.	.								S	S									T	T	T	T											T	T	S	S	S								T	T	S											S													T		T	T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.
Template SS confidence
		1	.				.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
					71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.						.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.								.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.												.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.												.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	N	K	E	D	I	V	G	I	G	L	G	.	.	.	.	.	S	I	R	C	C	R	A	L	L	K	A	.	.	.	.	.	.	.	D	G	T	P	A	A	P	L	I	S	W	Q	D	A	R	V	T	R	P	Y	E	H	T	N	P	D	V	A	Y	V	T	S	F	S	G	Y	L	T	H	R	L	T	G
Query Conservation		.	.	.												.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.												.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	I	K	D	M	G	E	I	N	A	V	G	H	R	V	V	H	G	G	E	K	F	T	T	S	A	L	Y	D	E	G	V	E	K	A	I	K	D	C	F	E	L	A	P	L	H	N	P	P	N	M	M	G	I	S	A	C	A	E	I	M	P	G	T	P	M	V	I	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S		S	S	G	G	G									S			T	T	T			S															T	G	G	G	S	T	T	T																T	T	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.
		136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.			.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.
Query SS confidence																																											.	.
Query Sequence		E	F	K	D	N	I	A	N	Y	F	G	Q	W	P	V	D	Y	K	S	W	A	W	S	E	D	A	A	V	M	D	K	F	N	I	P	R	H	M	L	F	D	.	.	V	Q	M	P	G	T	V	L	G	H	I	T	P	Q	A	A	L	A	T	H	F	P	A	G	L	P	V	V	C	T	T	S	D	K	P	V	E
Query Conservation																																											.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.															.	.						.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																						.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	T	A	F	H	Q	T	M	P	P	.	.	Y	A	Y	M	Y	A	L	P	Y	D	L	Y	E	K	H	G	V	R	K	Y	G	.	F	H	G	T	S	H	K	Y	V	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	A	A	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	G	G	G	G	G				.	.						S	S															.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																						.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																147	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.			.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.		.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	190	.	.	.
		214	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.										.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	G	A	G	L	L	D	D	E	T	A	V	I	S	L	G	T	Y	I	A	L	M	M	N	G	K	A	L	P	K	D	P	V	A	Y	W	P	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	S	S	I	P	Q	T	L	L	Y	E	G	Y	G	I	R	K	G	M	W	T	V	S	W	L	R	D	M	L	G	E	S
Query Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.
Template Conservation																																																														.	.
Template Sequence		M	L	G	K	P	A	E	E	T	K	I	I	T	C	H	L	G	N	G	S	S	I	T	A	V	E	G	G	K	S	V	E	T	S	M	G	F	T	P	L	E	G	L	A	M	G	T	R	C	G	S	I	D	P	A	I	V	P	F	L	.	.	M	E	K	E	G	L	T	T	R	E	I	D	T	L	M	N	K	K
Template Known Secondary structure				T	S		G	G	G									S	S	S								T	T						S			S	S	T	T	S	S	S			S	S				S			T	T						.	.					T													S
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.
Template SS confidence
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.			.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
		285	.	.	.	.	290	.	.		.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
Predicted Secondary structure										.
Query SS confidence										.
Query Sequence		L	I	Q	D	A	R	A	Q	.	D	L	S	P	E	D	L	L	N	K	K	A	S	C	V	P	P	G	C	N	G	L	M	T	V	L	D	W	L	T	N	P	W	E	P	Y	K	R	G	I	M	I	G	F	D	S	S	M	D	Y	A	W	I	Y	R	S	I	L	E	S	V	A	L	T	L	K	N	N	Y	D	N
Query Conservation										.
Alig confidence										.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	G	V	L	G	V	S	G	L	S	N	D	F	R	D	L	D	E	A	A	S	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	R	K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	A	L	E	I	F	A	Y	K	V	K	K	F	I	G	E
Template Known Secondary structure									S	S		S											T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.																				.	.	.	.																		.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
		364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.		.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.
Query SS confidence																					.
Query Sequence		M	C	N	E	M	N	H	F	A	K	H	V	I	I	T	G	G	G	S	.	N	S	D	L	F	M	Q	I	F	A	D	V	F	N
Query Conservation																					.
Alig confidence									.												.
Template Conservation									.
Template Sequence		Y	S	A	V	L	N	G	.	A	D	A	V	V	F	T	A	G	I	G	E	N	S	A	S	I	R	K	R	I	L	T	G	L	D
Template Known Secondary structure						T	T	S	.		S																					T	T		G
Template Predicted Secondary structure									.
Template SS confidence
		316	.	.	.	320	.	.		.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low