Job Description P33940 Confidence 99.72% Date Thu Jan 5 11:52:57 GMT 2012 Rank 49 Aligned Residues 334 % Identity 16% Template c1c0iA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:d-amino acid oxidase; PDBTitle: crystal structure of d-amino acid oxidase in complex with2 two anthranylate molecules Resolution 1.90 Å

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		29	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Q	E	T	D	V	L	L	I	G	G	G	I	M	S	A	T	L	G	T	Y	L	R	E	L	E	P	E	W	S	M	T	M	V	E	R	L	E	G	V	A	Q	E	S	S	N	G	W	N	N	A	G	T	G	H	S	A	L	M	E	L	N	Y	T	P	Q	N	A	D	G	S	I	S	I	E	K	A	V	A	I
Query Conservation
Alig confidence																										.	.													.								.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.													.								.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	S	Q	K	R	V	V	V	L	G	S	G	V	I	G	L	S	S	A	L	I	L	A	R	.	.	K	G	Y	S	V	H	I	L	A	R	D	L	.	P	E	D	V	S	S	Q	.	.	T	F	A	S	P	W	A	G	A	N	W	T	P	F	M	T	L	T	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	R	Q
Template Known Secondary structure				S									S													.	.	T	T								S	S		.	T	T		T	T		T	.	.	T	S	S	G	G	G				B					S		T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																										.	.													.								.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1002	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.			.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.		.	.	1040	.	.	.	.			.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.										.	.	.
		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	E	A	F	Q	I	S	R	Q	F	W	A	H	Q	V	E	R	G	V	L	R	T	P	R	S	F	I	N	T	V	P	H	M	S	F	V	W	G	E	D	N	V	N	F	L	R	A	R	Y	A	A	L	Q	Q	S	S	L	F	R	G	M	R	Y	S	E	D	H	A	Q	I	K	E	W	A	P	L	V	M	E	G
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	K	W	E	E	S	T	F	K	K	W	V	E	L	V	P	T	G	H	A	.	.	.	.	.	.	M	W	L	K	G	T	R	R	F	A	Q	N	E	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	G	H	W	Y	K	D	I	T	P	N	Y	R	P	L	P	S	S	E	C	P	P	G	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																T	T	T	T	S	S	.	.	.	.	.	.											S	S	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	G	T	T	T	T	T	S	T	T						G	G	G	S		T	T	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1068	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.							.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.									.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.
		189	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	D	P	Q	Q	K	V	A	A	T	R	T	E	I	G	T	D	V	N	Y	G	E	I	T	R	Q	L	I	A	S	L	Q	K	K	S	N	F	S	L	Q	L	S	S	E	V	R	A	L	K	R	N	D	D	N	T	W	T	V	T	V	A	D	L	K	N	G	T	A	Q	N	I	R	A	K	F	V	F	I	G	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																												.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																												.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	A	I	G	V	T	Y	D	T	L	S	V	H	A	P	K	Y	C	Q	Y	L	A	R	E	L	Q	K	L	.	G	A	T	F	E	R	R	T	V	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	Q	A	F	D	G	A	D	L	V	V	N	A	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																											T	.	T									S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	T		S	S		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																												.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									1127	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.		.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	G	A	A	L	K	L	L	Q	E	S	G	I	P	E	A	K	D	Y	A	G	F	P	V	G	G	Q	F	L	V	S	E	N	P	D	V	V	N	H	H	L	A	K	V	Y	G	K	A	S	V	G	A	P	P	M	S	V	P	H	I	D	T	R	V	L	D	G	K	R	V	V	L	F	G	P	F	A	T	F	S
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	L	G	A	K	S	I	A	G	I	D	D	Q	A	.	.	.	.	.	.	A	E	P	I	R	G	Q	T	V	L	V	K	.	.	.	.	.	S	P	C	K	R	C	T	M	D	S	S	D	P	A	S	P	A	Y	I	I	P	R	P	G	G	E	V	I	C	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	G	T	S	B	T	T			T	T	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.											S		T	T									T	T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.							.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.						.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		T	K	F	L	K	N	G	S	L	W	D	L	M	S	S	T	T	T	S	N	V	M	P	M	M	H	V	G	L	D	N	F	D	L	V	K	Y	L	V	S	Q	V	M	L	S	E	E	D	R	F	E	A	L	K	E	Y	Y	P	Q	A	K	K	E	D	W	R	L	W	Q	A	G	Q	R	V	Q	I	I	K	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	G	T	Y	G	V	G	D	W	D	L	S	V	N	P	E	T	V	Q	R	I	L	K	H	C	L	R	L	D	P	T	I	S	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	I	E	G	I	E	V	L	R	H	N	V	G	L	R	P	A	R	R	G	G	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.						T					S																		G	G	G	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	G	G	G															T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						1236	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.
											427	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.					.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	A	E	K	G	G	V	L	R	L	G	T	E	V	V	S	D	Q	Q	G	T	I	A	A	L	L	G	A	.	.	.	.	S	P	G	A	S	T	A	A	P	I	M	L	N	L	L	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	V	E	A	E	R	I	V	L	P	L	D	R	T	K	S	P	L	S	L	G	R	G	S	A	R	A	A	K	E	K	E	V	T	L	V	H	A	Y	G	F	S	S	A	G	Y	Q	Q	S	W	G	A	A	E	D	V	A	Q
Template Known Secondary structure											S			T	T	T		T	T		S	S		S					S														G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1293	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350