Job Description Q46829 Confidence 98.76% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 113 Aligned Residues 281 % Identity 14% Template d2je8a5 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.7

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		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.		.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.
Query SS confidence																																																																.
Query Sequence		G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	.	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T
Query Conservation																																																																.
Alig confidence																						.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	R	Y	Q	T	L	F	R	D	M	K	E	A	N	M	N	M	V	R	I	.	.	.	W	G	G	G	T	Y	E	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	F	Y	D	L	A	D	E	N	G	I	L	V	W	Q	D	F	M	F	A	C	T	P	Y	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Known Secondary structure														T	T							.	.	.		T	T	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T								S		B	S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.				.	.	.	.	.	400	.	.														.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.										.
		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.			.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.
Query SS confidence																								.	.
Query Sequence		N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	K	.	.	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K
Query Conservation																								.	.
Alig confidence																								.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	P	T	F	L	K	R	V	E	A	E	A	V	Y	N	I	R	R	L	R	N	H	A	S	L	A	M	W	C	G	N	N	E	I	L	E	A	L	K	Y	W	G	F	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	K	F	T	P	E	V	Y	Q	G	L	M	H	G	Y	D	K	L	F	R	E	L	L	P	S
Template Known Secondary structure																					T	T		T	T						S		B	S								S		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S																	T	T
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.												.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	V	K	E	F	D	S	D	R	F	Y	V	H	S	S	P	Y	L	A	N	W	G	R	P	E	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	G
Template Known Secondary structure								T	T	S				S	S	B	S	S	S			T	T		G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		499	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.																																																					.	.
		308	.	310	.	.	.	.	.		.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.								.	.	.	.	.	.	350	.									.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.
Predicted Secondary structure										.																													.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.																													.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	C	D	Y	L	G	F	S	.	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	.	.	.	.	.	.	.	V	K	A	S	D	W	G	W	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R
Query Conservation										.																													.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.																													.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	G	D	S	H	N	W	G	V	W	Y	G	K	K	P	F	E	S	L	D	T	D	L	P	R	F	M	S	E	F	G	F	Q	S	F	P	E	M	K	T	I	A	A	F	A	A	P	E	D	Y	Q	I	E	S	E	V	M	N	A	H	Q	K	S	S	I	G	N	S	L	I	R	T	Y	M	E	R	D	Y	I	I
Template Known Secondary structure		B	S						T	T	T	T	T				G	G	G	G	G	T	S			S	S								B													G	G	G		S	T	T	S						T	B		S	S	S		T											S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		527	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.
		372	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	E	S	F	E	D	F	V	Y	V	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	L	Q	G	Q	G	M	R	H	G	L	E	A	H	R	R	N	R	P	Y	C	M	G	T	L	Y	W	Q	L	N	D	S	W	P	.	.	.	.	.	.	V	V	S	W	S	S	I	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	S										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	T	T	T	T							S		S			S	S	S	.	.	.	.	.	.		B	B	S		S	B	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		607	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.																.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.							.	.	.	.	.	.	.
		452	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	D	Y	Y	G	N	W	K	A	L	H	Y	Q	A	K	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Template SS confidence
						660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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