Job Description Q46829 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 439 % Identity 33% Template d2j78a1 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 1.65

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	K	K	L	T	L	P	K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E
Query Conservation
Alig confidence				.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	K	.	.	K	F	P	E	G	F	L	W	G	V	A	T	A	S	Y	Q	I	E	G	S	P	L	A	D	G	A	G	M	S	I	W	H	T	F	S	H	T	P	G	N	V	K	N	G	D	T	G	D	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	C	D	H	Y	N	R	W	K	E	D	I	E	I	I	E	K
Template Known Secondary structure				.	.				T	T																T	T	G	G	G				B							T	S	T	T	S	S	G	G	G			S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.			.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.											.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	G	F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E
Query Conservation
Alig confidence																					.																																											.
Template Conservation																					.																																											.
Template Sequence		L	G	V	K	A	Y	R	F	S	I	S	W	P	R	I	L	P	E	G	.	T	G	R	V	N	Q	K	G	L	D	F	Y	N	R	I	I	D	T	L	L	E	K	G	I	T	P	F	V	T	I	Y	H	W	D	L	P	F	A	L	Q	L	K	.	G	G	W	A	N	R	E	I	A	D	W	F	A	E	Y	S	R
Template Known Secondary structure		T	T														S	T	T	S	.	S	S																				T	T									S	S			B					T	T	.	T	G	G	G	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																					.																																											.
Template SS confidence
		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.		.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	V	F	E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	L	F	E	N	F	G	D	R	V	K	N	W	I	T	L	N	E	P	W	V	V	A	I	V	G	H	L	Y	G	V	H	A	.	.	.	.	.	.	.	P	G	M	R	D	I	Y	V	A	F	R	A	V	H	N	L	L	R	A	H	A	R	A	V	K	V	F	R	E	T	V	K	D	G	K	I	G	I	V	F
Template Known Secondary structure								T	T	T																			T	S		S	S	T	.	.	.	.	.	.	.	T																															T	T
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		149	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.								.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.		.	.		.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure																										.			.
Query SS confidence																										.			.
Query Sequence		A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	.	R	Y	.	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N
Query Conservation																										.			.
Alig confidence																										.			.																								.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.
Template Sequence		N	N	G	Y	F	E	P	A	S	E	K	E	E	D	I	R	A	V	R	F	M	H	Q	F	N	N	Y	P	L	F	L	N	P	I	Y	R	G	D	Y	P	E	L	V	L	E	F	A	R	E	Y	L	.	.	.	P	E	N	Y	K	D	D	M	S	E	I	Q	E	K	I	D	F	V	G	L	N	Y	Y	S	G	H
Template Known Secondary structure									S	S	S																S	T										S	S										G	G	G	S	.	.	.		T	T	G	G	G	G					T				S
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.
Template SS confidence
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.				.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.		.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.
Query SS confidence																																																						.
Query Sequence		A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	.	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D
Query Conservation																																																						.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.																																	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	V	K	F	D	P	D	A	A	K	V	S	F	V	.	.	.	.	.	.	E	R	D	L	P	K	T	A	M	G	W	E	I	V	P	E	G	I	Y	W	I	L	K	K	V	K	E	E	Y	N	P	P	E	V	Y	I	T	E	N	G	A	A	F	D	D	V	V	S	E	D	G	R	V	H	D	Q	N	R	I	D
Template Known Secondary structure							T	T								.	.	.	.	.	.			S	S		B		T	T			B			T																	S															B		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.							.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V	I	A	S	N	G	E	K
Query Conservation
Alig confidence																.																							.														.	.	.	.	.
Template Conservation																.																							.														.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	L	K	A	H	I	G	Q	A	W	K	A	I	Q	.	E	G	V	P	L	K	G	Y	F	V	W	S	L	L	D	N	F	E	W	A	E	G	.	Y	S	K	R	F	G	I	V	Y	V	D	Y	S	.	.	.	.	.	T	Q	K	R	I	V	K	D	S	G	Y	W	Y	S	N	V	V	K	N	N	G	L	E
Template Known Secondary structure																.	T	T											S	B					G	G	G	G	.	G	G					S					T	T	.	.	.	.	.	T	T																		T
Template Predicted Secondary structure																.																							.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.		.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.						.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.