Job Description Q46829 Confidence 97.89% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 127 Aligned Residues 200 % Identity 18% Template d2c7fa2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 2.7

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		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F	K	C	F	R	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	D	V	I	E	L	V	K	E	L	N	V	P	I	I	R	Y	P	G	G	N	F	V	S	N	Y	F	W	E	D	G	V	G	P	V	E	D	R	P	R	R	L	D	L	A	W	K	S	I	E	P	N	Q	.	V	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	E	F	A	K	W	C	K	K	V	N	A	E	I
Template Known Secondary structure														S					S		S	T	T	G	G	G			G	G	G	G	S	S		G	G	G							T	T	T	T						S	.	S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	T
Template Predicted Secondary structure																																																							.				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.		.	.	.										.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.																170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R	Y	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G
Query Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	M	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	G	T	R	G	I	S	D	A	C	N	L	L	E	Y	C	N	H	P	G	G	S	K	Y	S	D	M	R	I	K	H	G	V	K	E	P	H	N	I	K	V	W	C	L	G	N	A	M	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S																	S	S	S									T	T			S										S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		122	.	.	.																.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	G	P	W	Q	V	G	H	K	T	M	D	E	Y	G	R	I	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	A	R	A	M	K	M	I	D	P	S	I	E	L	V	A	C	G	S	S	S	K	D	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.		T	T	S	T	T													.	.	.	.	.	.	.	.											T	T									S		T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						176	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.									.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	P	T	F	P	Q	W	E	A	T	V	L	D	Y	A	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Y	V	D	Y	I	S	L	H	Q	Y	Y	G	N	K	E	N	D	T	A	D	F	L	A	K	S	D	D	L	D	D	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	T	T	T	T											T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T													T	T								T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.																.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370					.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.
Query Sequence		D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	.	.	.	.	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F
Query Conservation																			.	.	.	.
Alig confidence		.																	.	.	.	.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	I	R	S	V	I	A	T	C	D	Y	I	K	A	K	K	R	S	K	K	D	I	Y	L	S	F	D	E	W	N	V
Template Known Secondary structure		.																T		S
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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