Job Description Q46829 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 25 Aligned Residues 442 % Identity 28% Template d1wcga1 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 1.10

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.		.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.
Query SS confidence																																								.
Query Sequence		L	T	L	P	K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	.	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G
Query Conservation																																								.
Alig confidence																																								.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	K	F	P	K	D	F	M	F	G	T	S	T	A	S	Y	Q	I	E	G	G	W	N	E	D	G	K	G	E	N	I	W	D	R	L	V	H	T	S	P	E	V	I	K	D	G	T	N	G	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	C	D	S	Y	H	K	Y	K	E	D	V	A	I	I	K	D	L	N
Template Known Secondary structure						T	T																T	T	S	T	T				B										G	G	G	S	T	T	S			S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T																	T
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.											.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V
Query Conservation
Alig confidence																																																														.
Template Conservation																																																														.
Template Sequence		L	K	F	Y	R	F	S	I	S	W	A	R	I	A	P	S	G	V	M	N	S	L	E	P	K	G	I	A	Y	Y	N	N	L	I	N	E	L	I	K	N	D	I	I	P	L	V	T	M	Y	H	W	D	L	P	Q	Y	L	Q	D	L	.	G	G	W	V	N	P	I	M	S	D	Y	F	K	E	Y	A	R	V	L
Template Known Secondary structure			S												S	T	T	S		T	T	S																			T	T									S	S			B						T	.	T	G	G	G	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																														.
Template SS confidence
		73	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.		.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.				.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.
Query SS confidence																																																																								.	.	.
Query Sequence		F	E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	.	.	.	E	M	K	V	G	C	M
Query Conservation																																																																								.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	T	Y	F	G	D	R	V	K	W	W	I	T	F	N	E	P	I	A	V	C	K	G	Y	S	I	.	.	.	.	.	.	.	K	A	Y	A	P	N	L	N	L	K	T	T	G	H	Y	L	A	G	H	T	Q	L	I	A	H	G	K	A	Y	R	L	Y	E	E	M	F	K	P	T	Q	N	G	K	I	S	I	S
Template Known Secondary structure						T	T	T																			S	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S	T	T																															T
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.								.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.		.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.		.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.								.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.
Predicted Secondary structure													.															.																											.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.															.																											.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	.	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	.	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	.	.	.	.	.	.	.	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L
Query Conservation													.															.																											.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.															.																											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	S	G	V	F	F	M	P	K	N	A	E	S	D	D	D	I	E	T	A	E	R	A	N	Q	F	E	R	G	W	F	G	H	P	V	Y	K	G	D	Y	P	P	I	M	K	K	W	V	D	Q	K	S	K	E	E	G	L	P	W	S	K	L	P	K	F	T	K	D	E	I	K	L	L	K	G	T	A	D	F	Y
Template Known Secondary structure										S	S	T	T																T									T	S	S	S															T	T		S	S		S	S												T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
		313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.				330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.		.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.		.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.																							.																						.
Query SS confidence																			.	.	.																							.																						.
Query Sequence		G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	.	.	.	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	.	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	.	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E
Query Conservation																			.	.	.																							.																						.
Alig confidence																			.	.	.																							.																						.										.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	L	N	H	Y	S	S	R	L	V	T	F	G	S	D	P	N	P	N	F	N	P	D	A	S	Y	V	T	S	V	D	E	A	W	L	K	P	N	E	T	P	Y	I	I	P	V	P	E	G	L	R	K	L	L	I	W	L	K	N	E	Y	G	N	P	Q	L	L	I	T	E	N	G	Y	G	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														S			S	S	T	T	S		G	G	G								G	G	G			S	S				S	S																			T	S												.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W
Query Conservation
Alig confidence																																																			.																.	.	.
Template Conservation																																																			.																.	.	.
Template Sequence		D	D	G	Q	L	D	D	F	E	K	I	S	Y	L	K	N	Y	L	N	A	T	L	Q	A	M	Y	E	D	K	C	N	V	I	G	Y	T	V	W	S	L	L	D	N	F	E	W	F	Y	G	.	Y	S	I	H	F	G	L	V	K	I	D	F	N	D	P	.	.	.	Q	R	T	R	T	K	R	E	S	Y	T	Y
Template Known Secondary structure		B	S			S	S																																		S	B					G	G	G	G	.	G	G	S	B			S					T	T	S	T	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																																			.																.	.	.
Template SS confidence
		379	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.		.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.				.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
		468	.	470	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	K	E	V	I	A	S	N
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		F	K	N	V	V	S	T	G
Template Known Secondary structure									S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		455	.	.	.	.	460	.	.