Job Description Q46829 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 32 Aligned Residues 407 % Identity 28% Template d1vffa1 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 2.50

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	L	T	L	P	K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	L	K	F	P	E	M	F	L	F	G	T	A	T	S	S	H	Q	I	E	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	N	R	W	N	D	W	W	Y	Y	E	Q	I	G	K	L	P	Y	R	S	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	C	N	H	W	E	L	Y	R	D	D	I	Q	L	M	T	S	L	G
Template Known Secondary structure							T	T									S	T	T	T	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	B								T	T	S	S			S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T																	T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.									.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.											.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V
Query Conservation
Alig confidence																			.	.																																										.
Template Conservation																			.	.																																										.
Template Sequence		Y	N	A	Y	R	F	S	I	E	W	S	R	L	F	P	E	E	.	.	N	K	F	N	E	D	A	F	M	K	Y	R	E	I	I	D	L	L	L	T	R	G	I	T	P	L	V	T	L	H	H	F	T	S	P	L	W	F	M	K	K	.	G	G	F	L	R	E	E	N	L	K	H	W	E	K	Y	I	E	K	V
Template Known Secondary structure																S	B	T	.	.	T	B																			T	T									S	S			B						T	.	T	G	G	G	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																			.	.																																										.
Template SS confidence
		64	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80			.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.		.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M
Query Conservation
Alig confidence			.																											.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.
Template Conservation			.																											.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.
Template Sequence		A	.	E	L	L	E	K	V	K	L	V	A	T	F	N	E	P	M	V	Y	V	M	M	G	Y	L	T	A	.	.	.	.	.	.	.	Y	W	P	P	F	I	R	S	P	F	K	A	F	K	V	A	A	N	L	L	K	A	H	A	I	A	Y	E	L	L	H	.	.	.	G	K	F	K	V	G	I	V	K	N	I
Template Known Secondary structure			.			T	T	T																			T	S		.	.	.	.	.	.	.	S	S	T	T																											T	.	.	.	T	T	S
Template Predicted Secondary structure			.																											.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.
Template SS confidence
		141		.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.								.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.				.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.		.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.
Query SS confidence																								.
Query Sequence		V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	.	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K
Query Conservation																								.
Alig confidence																								.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	I	I	L	P	A	S	D	K	E	R	D	R	K	A	A	E	K	A	D	N	L	F	N	W	H	F	L	D	A	I	W	S	G	K	Y	R	G	V	F	K	T	Y	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	Q	S	D	A	D	F	I	G	V	N	Y	Y	T	A	S	E	V	R
Template Known Secondary structure							S	S	S	S															T															S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A
Query Conservation
Alig confidence													.	.																														.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.																														.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	T	W	N	P	L	K	F	F	F	E	.	.	V	K	L	A	D	I	S	E	R	K	T	Q	M	G	W	S	V	Y	P	K	G	I	Y	M	A	L	K	K	A	.	S	R	Y	G	R	P	L	Y	I	T	E	N	G	I	A	T	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	W	R	V	E	F	I	I	Q
Template Known Secondary structure				S		G	G	G	T	T			.	.							S	S	S			T	T						T											.	G	G	G		S												S		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure													.	.																														.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.			.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.		.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.										.	.	.	.	.	.	.	.	340	.
		404	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V	I	A	S	N	G	E	K
Query Conservation
Alig confidence												.																							.														.	.	.	.	.
Template Conservation												.																							.														.	.	.	.	.
Template Sequence		H	L	Q	Y	V	H	K	A	I	E	.	D	G	L	D	V	R	G	Y	F	Y	W	S	F	M	D	N	Y	E	W	K	E	G	.	F	G	P	R	F	G	L	V	E	V	D	Y	Q	.	.	.	.	.	T	F	E	R	R	P	R	K	S	A	Y	V	Y	G	E	I	A	R	S	K	E	I	K
Template Known Secondary structure												.	T	T											S	B					G	G	G	T	.	T						S					T	T	.	.	.	.	.	T																			T
Template Predicted Secondary structure												.																							.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		342	.	.	.	.	.	.	.	350	.		.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.		.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.						.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.