Job Description Q46829 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 24 Aligned Residues 452 % Identity 29% Template d1v02a_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 1.9

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.		.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure																																												.
Query SS confidence																																												.
Query Sequence		I	V	K	K	L	T	L	P	K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	.	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F
Query Conservation																																												.
Alig confidence																																												.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	P	R	R	D	W	F	P	P	S	F	L	F	G	A	A	T	S	A	Y	Q	I	E	G	A	W	N	E	D	G	K	G	P	S	T	W	D	H	F	C	H	N	F	P	E	W	I	V	D	R	S	N	G	D	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	D	S	Y	H	M	Y	A	E	D	V	R	L	L
Template Known Secondary structure		S			G	G	G	S		T	T																T	T	S	T	T				B										G	G	G	S	T	T	S			S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		19	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.											.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.		.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.
Query SS confidence																								.
Query Sequence		A	E	M	G	F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	.	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R
Query Conservation																								.
Alig confidence																								.
Template Conservation
Template Sequence		K	E	M	G	M	D	A	Y	R	F	S	I	S	W	P	R	I	L	P	K	G	T	L	A	G	G	I	N	E	K	R	V	E	Y	Y	N	K	L	I	D	L	L	L	E	N	G	I	E	P	Y	I	T	I	F	H	W	D	T	P	Q	A	L	V	D	A	Y	G	G	F	L	D	E	R	I	I	K	D	Y	T	D
Template Known Secondary structure				T	T		S												S	T	T	S	S	S	T	T																				T	T									S	S			B									G	G	G	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.						.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.
Query Sequence		F	A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	.	.	.	.	.	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P
Query Conservation																																							.	.	.	.	.
Alig confidence																																							.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	A	K	V	C	F	E	K	F	G	K	T	V	K	N	W	L	T	F	N	E	P	E	T	F	C	S	V	S	Y	G	T	G	V	L	A	P	G	R	C	S	P	G	V	S	C	A	V	P	T	G	N	S	L	S	E	P	Y	I	V	A	H	N	L	L	R	A	H	A	E	T	V	D	I	Y	N	K	Y	H	K
Template Known Secondary structure											T	T	T																			T	S			S	T	T		B			T	T	S		S	S	B		S	S		T	T	T																								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
				235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.		.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure		.	.																																	.
Query SS confidence		.	.																																	.
Query Sequence		.	.	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	.	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y
Query Conservation		.	.																																	.
Alig confidence		.	.																																	.																									.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.
Template Sequence		G	A	D	G	R	I	G	L	A	L	N	V	F	G	R	V	P	Y	T	N	T	F	L	D	Q	Q	A	Q	E	R	S	M	D	K	C	L	G	W	F	L	E	P	V	V	R	G	D	Y	P	F	S	M	R	V	S	A	R	D	R	.	.	.	V	P	Y	F	K	E	K	E	Q	E	K	L	V	G	S	Y	D	M
Template Known Secondary structure		T	T	T															S	S	S	S																									S	S										G	G	G	.	.	.	S												T	T			S
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.
Template SS confidence
		249	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.				.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.												.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.		.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.		370	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																			.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																			.
Query Sequence		L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	.	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	.	Q	R	P	L	F	I	V	E	N
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																			.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																			.
Template Conservation
Template Sequence		I	G	I	N	Y	Y	T	S	T	F	S	K	H	I	D	L	S	P	N	N	S	P	V	L	N	T	D	D	A	Y	A	S	Q	E	T	K	G	P	D	G	N	A	I	G	P	P	T	G	N	A	W	I	N	M	Y	P	K	G	L	H	D	I	L	M	T	M	K	N	K	Y	G	N	P	P	M	Y	I	T	E	N
Template Known Secondary structure																		S	T	T					S	G	G	G	G	G						S	B		T	T	S		B	S	S		B		S	S	S	S		B			T														S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
		379	380	.	.	.	.	.			.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.
Query SS confidence									.	.
Query Sequence		G	F	G	A	Y	D	K	.	.	V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D
Query Conservation									.	.
Alig confidence									.	.																													.																							.															.	.	.	.
Template Conservation																																							.																							.															.	.	.	.
Template Sequence		G	M	G	D	I	D	K	G	D	L	P	K	P	V	A	L	E	D	H	T	R	L	D	Y	I	Q	R	H	L	S	V	L	K	Q	S	I	D	.	L	G	A	D	V	R	G	Y	F	A	W	S	L	L	D	N	F	E	W	S	S	G	.	Y	T	E	R	F	G	I	V	Y	V	D	R	E	N	.	.	.	.	G
Template Known Secondary structure								S	S																														.	T	T											S	B					G	G	G	G	.	G	G					S					G	G	G	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																							.																							.															.	.	.	.
Template SS confidence
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.		.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.		.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.					.
		457	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		C	E	R	T	M	K	R	S	A	R	W	L	Q	E	F	N
Template Known Secondary structure		T															T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.