Job Description Q46829 Confidence 99.89% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 64 Aligned Residues 319 % Identity 14% Template d1us3a2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.85

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		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	P	K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F	K	C
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	P	S	D	F	P	I	G	V	A	V	S	N	T	D	S	A	T	Y	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	N	S	R	E	Q	A	V	V	K	K	H	F	N	H
Template Known Secondary structure			S	S	S								B		T	T		T	T	T	B	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T													S
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		255	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
		88	.	90			.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.					.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure					.	.																																																.	.	.	.
Query SS confidence					.	.																																																.	.	.	.
Query Sequence		F	R	T	.	.	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	.	.	.	.	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A
Query Conservation					.	.																																																.	.	.	.
Alig confidence					.	.										.	.												.	.	.																							.	.	.	.							.	.
Template Conservation																.	.												.	.	.																																	.	.
Template Sequence		L	T	A	G	N	I	M	K	M	S	Y	M	Q	P	.	.	T	E	G	N	F	N	F	T	N	A	D	.	.	.	A	F	V	D	W	A	T	E	N	N	M	T	V	H	G	H	A	L	V	W	H	S	D	Y	Q	V	P	N	F	M	K	N	.	.	W	A	G	S	A	E	D	F	L	A	A	L	D	T	H	I
Template Known Secondary structure					S	S	T	T	S						S	.	.	B	T	T	B								.	.	.									T	T													G	G	G	S						T	.	.			S
Template Predicted Secondary structure																.	.												.	.	.																																	.	.
Template SS confidence
		292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.			.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.				.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.			.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
		162	.	.	.	.	.	.			.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.
Query SS confidence									.	.
Query Sequence		E	V	V	F	E	R	Y	.	.	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G
Query Conservation									.	.
Alig confidence									.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	T	I	V	D	H	Y	E	A	K	G	N	L	V	S	W	D	V	V	N	E	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	N	S	P	A	N	F	R	T	T	D	S	A	F	Y	V	K	S	G	N	S	S	V	Y	I	E	R	A	F	Q	T	A	R	A	A	D	P	A	V	I	L	Y
Template Known Secondary structure																								B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	S	S			B			T	T							T	T	S		S															T	T	S
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.															.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	N	D	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	E	Q	N	N	A	K	T	T	K	M	V	D	M	V	K	D	F	Q	A	R	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	I	D	G	V	G	F	Q	M	H	V	C
Template Known Secondary structure					S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S		S																T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		431	.	.	.	.																										.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.																.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.										390
Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G
Query Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template Sequence		M	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	P	S	I	A	N	I	S	A	A	M	K	K	.	V	V	D	L	G	L	L	V	K	I	T	E	L	D	V	A	V	N	Q	P	H	C	D	A	Y	P	A	N	K	I	N	P	L	T
Template Known Secondary structure		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S												.			T	T	T												S	S		T	T	S	T	T	T	T	T	T				S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template SS confidence
		471	.																															.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.		.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.										.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R
Query Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.				.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.																																.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	A	A	Q	L	A	Q	K	K	R	Y	C	D	V	V	K	A	Y	L	D	T	V	.	.	P	V	N	Q	R	G	G	I	S	V	W	G	T	T	D	A	N	T	W	L	D	G	L	Y	R	E	Q	F	E	D	E	.	K	I	S	W	P	L	L	F	D	N	N	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D
Template Known Secondary structure																							S	.	.		G	G	G							S		S	B	G	G	G							T	T	T	T	T	T	T		.						S	S	B		T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure																								.	.																																.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.			.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.		.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.											.
		462	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V	I	A	S
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	P	A	L	R	G	F	A	D	A	L	I	G
Template Known Secondary structure														T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		587	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.