Job Description Q46829 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 36 Aligned Residues 316 % Identity 17% Template d1ur1a_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.43

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	L	T	L	P	K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G
Query Conservation
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.
Template Sequence		K	S	A	Y	K	D	N	F	L	I	G	A	A	L	N	A	T	I	A	S	G	A	D	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	L	N	T	L	I	.	.	A	K	E	F	N
Template Known Secondary structure					T	T	T	T													T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.					S
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.
Template SS confidence
		28	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.																																												.	.	.	.	.	.			.	.	60	.	.
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.			.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.			.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure																																													.	.																.	.
Query SS confidence																																													.	.																.	.
Query Sequence		F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	.	.	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	.	.	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F
Query Conservation																																													.	.																.	.
Alig confidence																	.	.									.	.	.																.	.																.	.
Template Conservation																	.	.									.	.	.
Template Sequence		S	I	T	P	E	N	C	M	K	W	G	V	L	R	D	.	.	A	Q	G	Q	W	N	W	K	.	.	.	D	A	D	A	F	V	A	F	G	T	K	H	N	L	H	M	V	G	H	T	L	V	W	H	S	Q	I	H	D	E	V	F	K	N	A	D	G	S	Y	I	S	K	A	A	L	Q	K	K	M	E	E	H
Template Known Secondary structure						S	S	T	T	S					B		.	.	T	T			B				.	.	.												T	T											S	S	S	S		G	G	G	T	B		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure																	.	.									.	.	.
Template SS confidence
		63	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.			.	.	80	.	.	.	.	.				.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	T	T	L	A	G	R	Y	K	G	K	L	A	A	W	D	V	V	N	E	A	V	G	D	D	L	K	M	R	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	W	Y	K	I	M	G	D	D	F	I	Y	N	A	F	T	L	A	N	E	V	D	P	K	A	H	L	M	Y
Template Known Secondary structure									T	T	T	T		S									B		T	T	S	S	B				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T															T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	D	Y	N	I	E	.	.	.	.	.	.	R	T	G	K	R	E	A	T	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	I	E	R	L	Q	K	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	P	I	H	G	L	G	I	Q	G	H	L	G	I
Template Known Secondary structure				S	S	T	T	.	.	.	.	.	.	S	T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		198	.	200	.	.	.							.	.	.	.	.	.	210	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	220	.	.																.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Sequence		D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	P	P	I	A	E	I	E	K	S	I	I	A	F	.	A	K	L	G	L	R	V	H	F	T	S	L	D	V	D	V	L	P	S	V	W	E	E	V	S	T	R	F	E	Y	K	P	E	R
Template Known Secondary structure		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S													.		T	T	T													S							T	T	T	T	T	S			G	G	G
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template SS confidence
		237																															.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.		.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
					390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.						.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																																													.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																																													.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	.	.	.	.	.	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R
Query Conservation		.	.	.																																													.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																																													.	.	.	.	.				.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	P	Y	T	K	G	L	P	Q	E	M	Q	D	K	L	A	K	R	Y	E	D	L	F	K	L	F	I	K	H	S	D	K	I	D	R	A	T	F	W	G	V	S	D	D	A	S	W	L	N	G	F	P	I	P	G	.	R	T	N	Y	P	L	L	F	D	R	K	L	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P
Template Known Secondary structure			T	T	T	T																								T	T	T	T							S		S	B	G	G	G		G	G	G	T	S	S	S	T	T	.						S	S	B		T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure																																																									.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.		.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.											.
		462	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V	I	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	D	A	Y	F	R	L	L	D	L	K	R
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370