Job Description Q46829 Confidence 99.43% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 98 Aligned Residues 295 % Identity 14% Template d1tg7a5 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Glycosyl hydrolases family 35 catalytic domain Resolution 1.90

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		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.									.	.	140	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	H	L	V
Query Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.
Template Sequence		S	L	Y	I	D	I	F	E	K	V	K	A	L	G	F	N	C	V	S	F	Y	V	D	W	A	L	L	E	G	.	.	N	P	G	H	Y	S	A	E	G	I	F	D	L	Q	P	F	F	D	A	A	K	E	A	G	I	Y	L	L	A	R	P	G	P	Y	I	N	A	E	V	S	G	G	G	F	P	G	W	L	Q
Template Known Secondary structure		G	G										T	T	T															S	.	.	B	T	T	B					G	G	G		S											T									S				T	T	B	G	G	G	G			G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																															.	.
Template SS confidence
		76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.			.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
		143	.	.	.	.	.			.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.								.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.																								.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.																								.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	Q	Y	G	S	W	.	.	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	K	.	.	.	.	.	.	.	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q
Query Conservation								.	.																								.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.																								.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	V	D	G	I	L	R	T	S	D	E	A	Y	L	K	A	T	D	N	Y	A	S	N	I	A	A	T	I	A	K	A	Q	I	T	N	G	G	P	I	I	L	Y	Q	P	E	N	E	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	A	C	C	G	Y	N	G	F	P	D	G	S	Y	M
Template Known Secondary structure		G		S	S		T	T	S	S																						T	B	G	G	G	T	S	S							S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T					S
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
		214	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	I	E	D	H	A	R	D	A	G	I	V	V	P	F	I	S	N	D	A	W	A	A	G	H	N	A	P	G	T	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T			S		B	B			B	S	S	S	S		T	T		T	T	S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		218										.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.		.
Predicted Secondary structure																																																																																.
Query SS confidence																																																																																.
Query Sequence		I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	.	P
Query Conservation																																																																																.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	V	D	I	Y	G	H	D	S	Y	P	L	G	F	D	C	A	N	P	S	T	W	P	S	G	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	T	Y	F	H	T	S	H	E	Q	Q	S	P	S	T	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T			S	B							T	T		S			S		T	T				T	T		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
		373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D
Query Conservation
Alig confidence																																								.			.																							.						.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.			.																							.						.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	S	L	V	E	F	Q	G	G	A	F	D	P	W	G	G	V	G	F	A	K	C	A	A	L	L	N	H	E	F	E	R	V	F	Y	K	N	D	.	F	S	.	F	G	V	A	F	L	N	L	Y	M	I	F	G	G	T	N	W	G	N	L	G	H	.	P	G	G	Y	T	.	.	.	.	.	S	Y	D	Y	G
Template Known Secondary structure									S	S					T	T											T	S												.		T	.	T	T		S							S	B			B			T	T		B		.	T	T	S		S	.	.	.	.	.	B			T	T
Template Predicted Secondary structure																																								.			.																							.						.	.	.	.	.
Template SS confidence
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.		.	.		.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.		.	.	.	360	.						.	.	.	.	.
		453	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V	I	A	S
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	A	I	S	E	S	R	N	I	T	R	E	K	Y	S	E	L	K	L	L	G	N
Template Known Secondary structure			S	B		T	T					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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