Job Description Q46829 Confidence 99.92% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 59 Aligned Residues 272 % Identity 19% Template d1ta3b_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.70

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		72	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130			.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.	.
Query SS confidence																																																													.	.
Query Sequence		H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	.	.	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T
Query Conservation																																																													.	.
Alig confidence								.	.																					.	.												.	.	.																.	.												.	.	.
Template Conservation								.	.																					.	.												.	.	.																													.	.	.
Template Sequence		Q	N	E	A	I	V	.	.	A	S	Q	F	G	V	I	T	P	E	N	S	M	K	W	D	A	L	E	P	.	.	S	Q	G	N	F	G	W	S	G	A	D	.	.	.	Y	L	V	D	Y	A	T	Q	H	N	K	K	V	R	G	H	T	L	V	W	H	S	Q	L	P	S	W	V	.	.	.	S	S	I	G	D
Template Known Secondary structure								.	.					S					S	S	T	T	S						S	.	.	B	T	T	B								.	.	.									T	T											S	S	S						.	.	.		T
Template Predicted Secondary structure								.	.																					.	.												.	.	.																													.	.	.
Template SS confidence
		28	.	30	.	.	.			.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.			.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.				.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.				.	.	.	.	.
		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.
Template Sequence		A	N	T	L	R	S	V	M	T	N	H	I	N	E	V	V	G	R	Y	K	G	K	I	M	H	W	D	V	V	N	E	I	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	E	D	G	T	F	R	N	S	V	F	Y	N	L	L	G	E	D	F	V	R	I	.	.	.	A	F	E	T	A
Template Known Secondary structure																				T	T	T	S		S							S		B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S	S	B										T	T						.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.
Template SS confidence
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.				.	.	.	.	.
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C
Query Conservation
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	A	A	D	P	D	A	K	L	Y	I	N	D	Y	N	L	D	S	A	S	Y	A	K	T	Q	A	M	A	S	Y	V	K	K	W	L	A	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	I
Template Known Secondary structure						T	T	S							S					T	T	S																T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.																																								.	.	.
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.
Template Sequence		D	G	I	G	S	Q	A	H	Y	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	W	S	S	T	E	A	A	G	A	L	S	S	L	A	N	T	G	V	S	E	V	A	I	T	E	L	D	I	A	G	A	A	S	.	.	.	.
Template Known Secondary structure												T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				G	G	G										T	T			S										T	T				.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.
Template SS confidence
		199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.																								.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.																								.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	D	Y	L	N	L	L	N	A	C	L	.	N	E	Q	K	C	V	G	I	T	V	W	G	V	S	D	K	D	S	W	R	A	S	D	.	.	.	S	P	L	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	N	Y	Q	P	K	D	A	Y	N	A	I	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	T		T	T							S		S	B	G	G	G	S	T	T	G	G	G	.	.	.			S	S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.																								.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.		.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.				.	280	.	.	.											.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
		470	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	V	I	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		N	A	L	S
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		298	.	300	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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