Job Description Q46829 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 29 Aligned Residues 427 % Identity 25% Template d1qvba_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 2.40

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	T	L	P	K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F
Query Conservation
Alig confidence																																																				.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	K	F	P	K	D	F	M	I	G	Y	S	S	S	P	F	Q	F	E	A	G	I	P	G	S	E	D	P	N	S	D	W	W	V	W	V	H	D	P	E	N	T	A	A	G	L	V	S	G	D	.	.	.	.	.	.	F	P	E	N	G	P	G	Y	W	N	L	N	Q	N	D	H	D	L	A	E	K	L	G	V
Template Known Secondary structure			B			T	T													S			S	T	T				T	T	B															T	S	S		S		.	.	.	.	.	.		G	G	G	S																	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50							.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	T	I	R	V	G	V	E	W	S	R	I	F	P	K	P	T	F	N	V	K	V	P	V	E	R	D	E	N	G	S	I	V	H	V	D	V	D	D	K	A	V	E	R	L	D	E	L	A	N	K	E	A	V	N	H	Y	V	E	M	Y	K	D	W	V	E	R	G	R	K	L	I	L	N	L	Y	H	W	P	L
Template Known Secondary structure															S	S			T	T	S								T	T	S																			S																	T	T	T							S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		75	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.
		138	.	140	.	.	.	.	.												.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	L	H	L	V	Q	Q	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																						.	.	.	.	.
Template Sequence		P	L	W	L	H	N	P	I	M	V	R	R	M	G	P	D	R	A	P	S	G	W	L	N	E	E	S	V	V	E	F	A	K	Y	A	A	Y	I	A	W	K	M	G	E	L	P	V	M	W	S	T	M	N	E	P	N	V	V	Y	E	Q	G	Y	M	F	V	K	G	.	.	.	.	.	G	F	P	P	G	Y	L
Template Known Secondary structure		B	T	T	T	B										G	G	G	S		B	G	G	G	S	T																		T	T	S		S																	T		G	G	G	.	.	.	.	.			T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.	.	.
Template SS confidence
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.						.	.	.	.	.	.	.
		207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E
Query Conservation
Alig confidence																													.																																	.	.													.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.																																	.	.													.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	L	E	A	A	D	K	A	R	R	N	M	I	Q	A	H	A	R	A	Y	D	N	I	K	R	F	S	.	K	K	P	V	G	L	I	Y	A	F	Q	W	F	E	L	L	E	G	P	A	E	V	F	D	K	F	K	S	S	K	L	Y	.	.	Y	F	T	D	I	V	S	K	G	S	S	I	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																													.		S														S	S	S			S										T	S	.	.	T	T	T	T					S			S	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																													.																																	.	.													.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.		.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.			.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.						.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.
Query Sequence		W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	.	.	.	.	.	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	N	V	E	Y	R	R	D	L	A	N	R	L	D	W	L	G	V	N	Y	Y	S	R	L	V	Y	K	I	V	D	D	K	P	I	I	L	H	G	Y	G	F	L	C	T	P	G	G	I	S	P	A	E	N	P	C	S	D	F	G	W	E	V	Y	P	E	G	L	Y	L	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S						T	T	T	S	S			S																T	T						T	T	S	G	G	G	S		T	T		B		T	T	S		B	B		T	T			B			T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.																							.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.																							.
Template Sequence		L	K	E	L	Y	N	R	Y	G	V	D	L	I	V	T	E	N	G	V	S	D	S	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	L	R	P	A	Y	L	V	S	H	V	Y	S	V	W	K	A	A	N	.	E	G	I	P	V	K	G	Y	L	H	W	S	L	T	D	N	Y	E	W	A	Q	G	.	F	R	Q	K
Template Known Secondary structure																							T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S																		.	T	T											S	B					G	G	G	T	.	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.																							.
Template SS confidence
		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.										.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.		.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.		.	.	.	.
		442	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V	I	A	S	N	G	E	K
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.
Template Sequence		F	G	L	V	M	V	D	F	K	.	.	.	.	.	T	K	K	R	Y	L	R	P	S	A	L	V	F	R	E	I	A	T	H	N	G	I	P
Template Known Secondary structure				S					T	T	.	.	.	.	.	T	T																		T	B
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.
Template SS confidence
		440	.	.	.	.	.	.	.	.						.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.