Job Description Q46829 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 444 % Identity 32% Template d1qoxa_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 2.7

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	L	P	K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F	K
Query Conservation
Alig confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	F	P	S	D	F	K	W	G	V	A	T	A	A	Y	Q	I	E	G	A	Y	N	E	D	G	R	G	M	S	I	W	D	T	F	A	H	T	P	G	K	V	K	N	G	D	N	G	N	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	C	D	S	Y	H	R	V	E	E	D	V	Q	L	L	K	D	L	G	V	K
Template Known Secondary structure					T	T																T	T	S	T	T				B								S	T	T	T	S	G	G	G			T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T		T	T	S													T		S
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.											.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E
Query Conservation
Alig confidence																	.																																											.
Template Conservation																	.																																											.
Template Sequence		V	Y	R	F	S	I	S	W	P	R	V	L	P	Q	G	.	T	G	E	V	N	R	A	G	L	D	Y	Y	H	R	L	V	D	E	L	L	A	N	G	I	E	P	F	C	T	L	Y	H	W	D	L	P	Q	A	L	Q	D	Q	.	G	G	W	G	S	R	I	T	I	D	A	F	A	E	Y	A	E	L	M	F	K
Template Known Secondary structure													S	T	T	S	.	S	S	S																			T	T									S	S			B					T	T	.	T	G	G	G	S	T
Template Predicted Secondary structure																	.																																											.
Template SS confidence
		75	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.		.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P
Query Conservation
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	L	G	G	K	I	K	Q	W	I	T	F	N	E	P	W	C	M	A	F	L	S	N	Y	L	G	V	H	A	.	.	.	.	.	.	.	P	G	N	K	D	L	Q	L	A	I	D	V	S	H	H	L	L	V	A	H	G	R	A	V	T	L	F	R	E	L	G	I	S	G	E	I	G	I	A	P	N	T	S	W
Template Known Secondary structure				T	T	T																			T	S		S	S	T	.	.	.	.	.	.	.	T																													T	T			S
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.								.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.		.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.
Query SS confidence																								.
Query Sequence		L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	.	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E
Query Conservation																								.
Alig confidence																								.																																						.
Template Conservation																																																														.
Template Sequence		A	V	P	Y	R	R	T	K	E	D	M	E	A	C	L	R	V	N	G	W	S	G	D	W	Y	L	D	P	I	Y	F	G	E	Y	P	K	F	M	L	D	W	Y	E	N	L	G	Y	K	P	P	I	V	D	G	D	M	E	L	I	H	.	Q	P	I	D	F	I	G	I	N	Y	Y	T	S	S	M	N	R	Y	N
Template Known Secondary structure					S	S	S														T	T	T									T	S	S													T							T	T							.				S							S
Template Predicted Secondary structure																																																														.
Template SS confidence
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.		.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.		.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.
Query SS confidence																																																	.
Query Sequence		G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	.	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H
Query Conservation																																																	.
Alig confidence											.	.																																					.
Template Conservation											.	.
Template Sequence		P	G	E	A	G	G	M	L	S	.	.	S	E	A	I	S	M	G	A	P	K	T	D	I	G	W	E	I	Y	A	E	G	L	Y	D	L	L	R	Y	T	A	D	K	Y	G	N	P	T	L	Y	I	T	E	N	G	A	C	Y	N	D	G	L	S	L	D	G	R	I	H	D	Q	R	R	I	D	Y	L	A	M	H
Template Known Secondary structure		S	S	G	G	G	T	T	T	T	.	.										B		T	T	S		B			T														T	T	S																		T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure											.	.
Template SS confidence
		305	.	.	.	.	310	.	.	.			.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V	I	A	S	N	G	E	K	L
Query Conservation
Alig confidence											.																							.														.	.	.	.	.
Template Conservation											.																							.														.	.	.	.	.
Template Sequence		L	I	Q	A	S	R	A	I	E	.	D	G	I	N	L	K	G	Y	M	E	W	S	L	M	D	N	F	E	W	A	E	G	.	Y	G	M	R	F	G	L	V	H	V	D	Y	D	.	.	.	.	.	T	L	V	R	T	P	K	D	S	F	Y	W	Y	K	G	V	I	S	R	G	W	L	D	L
Template Known Secondary structure											.	T	T											S	B					G	G	G	T	.	T	S	S				S					T	T	.	.	.	.	.	T	T																		S
Template Predicted Secondary structure											.																							.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		383	.	.	.	.	.	.	390	.		.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.		.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.						.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450