Job Description Q46829 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 17 Aligned Residues 444 % Identity 35% Template d1pbga_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 2.30

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	K	K	L	T	L	P	K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E
Query Conservation
Alig confidence					.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	T	K	.	T	L	P	K	D	F	I	F	G	G	A	T	A	A	Y	Q	A	E	G	A	T	H	T	D	G	K	G	P	V	A	W	D	K	Y	L	E	D	N	Y	W	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	E	P	A	S	D	F	Y	H	K	Y	P	V	D	L	E	L	A	E	E
Template Known Secondary structure					.				T	T																T	T	S	T	T				B								T	T		S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure					.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.		.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.															.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	G	F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E
Query Conservation
Alig confidence																					.																																											.
Template Conservation																					.																																											.
Template Sequence		Y	G	V	N	G	I	R	I	S	I	A	W	S	R	I	F	P	T	G	.	Y	G	E	V	N	E	K	G	V	E	F	Y	H	K	L	F	A	E	C	H	K	R	H	V	E	P	F	V	T	L	H	H	F	D	T	P	E	A	L	H	S	N	.	G	D	F	L	N	R	E	N	I	E	H	F	I	D	Y	A	A
Template Known Secondary structure		T	T														S	T	T	S	.	S	S	S																				T									S	S			B						T	.	T	G	G	G	S	T
Template Predicted Secondary structure																					.																																											.
Template SS confidence
		66	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.		.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.		.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	V	F	E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L
Query Conservation
Alig confidence										.																					.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.																					.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	C	F	E	E	F	P	E	.	V	N	Y	W	T	T	F	N	E	I	G	P	I	G	D	G	Q	Y	L	V	.	.	.	.	.	.	G	K	F	P	P	G	I	K	Y	D	L	A	K	V	F	Q	S	H	H	N	M	M	V	S	H	A	R	A	V	K	L	Y	K	D	K	G	Y	K	G	E	I	G	V	V	H
Template Known Secondary structure								T	T	.								S											T	S	.	.	.	.	.	.			S	T	T				S																										T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure										.																					.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		144	.	.	.	.	.	150	.		.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.							.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.		.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.		.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.					.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.			.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.																.																				.	.	.	.																				.	.
Query SS confidence											.																.																				.	.	.	.																				.	.
Query Sequence		A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	.	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	.	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	.	.	.	.	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	.	.	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F
Query Conservation											.																.																				.	.	.	.																				.	.
Alig confidence											.																.																				.	.	.	.																				.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	L	P	T	K	Y	P	Y	D	P	E	N	P	A	D	V	R	A	A	E	L	E	D	I	I	H	N	K	F	I	L	D	A	T	Y	L	G	H	Y	S	D	K	T	M	E	G	V	N	H	I	L	A	E	N	G	G	E	L	D	L	R	D	E	D	F	Q	A	L	D	A	A	K	D	L	N	D	F	L	G	I
Template Known Secondary structure									S	S	T	T																T									T	S	S																																		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370			.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.
Query SS confidence																																																										.	.
Query Sequence		S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	.	.	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S	I
Query Conservation																																																										.	.
Alig confidence																																																										.	.																	.
Template Conservation																																																																												.
Template Sequence		N	Y	Y	M	S	D	W	M	Q	A	F	D	G	E	T	E	I	I	K	Y	Q	I	K	G	V	G	R	R	V	A	P	D	Y	V	P	R	W	I	I	Y	P	E	G	L	Y	D	Q	I	M	R	V	K	N	D	Y	P	N	Y	K	K	I	Y	I	T	E	N	G	L	G	Y	K	D	E	F	.	V	D	N	T	V
Template Known Secondary structure				S													B		.					T	T	T							T	T			.					T															T	T													B					.		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																												.
Template SS confidence
		297	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370		.	.	.	.	.
		393	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V	I
Query Conservation
Alig confidence																							.																							.														.	.	.	.	.
Template Conservation																							.																							.														.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	D	D	G	R	I	D	Y	V	K	Q	H	L	E	V	L	S	D	A	I	A	.	D	G	A	N	V	K	G	Y	F	I	W	S	L	M	D	V	F	S	W	S	N	G	.	Y	E	K	R	Y	G	L	F	Y	V	D	F	D	.	.	.	.	.	T	Q	E	R	Y	P	K	K	S	A	H	W	Y	K	K	L	A
Template Known Secondary structure																							.	T	T											S	B				B	T	T	T	B	.	T	T	S	B			S					T	T	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																							.																							.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410		.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.		.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.						.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
		473	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	S	N	G	E	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		E	T	Q	V	I	E
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		463	.	.	.	.	.