Job Description Q46829 Confidence 99.93% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 56 Aligned Residues 291 % Identity 14% Template d1hjsa_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.87

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		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.				.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.
Query Sequence		K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	.	.	.	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N
Query Conservation																																																															.	.	.
Alig confidence																					.		.	.				.	.							.	.	.																									.	.	.											.
Template Conservation																					.		.	.				.	.							.	.	.																																						.
Template Sequence		Q	P	L	E	N	I	L	A	A	N	G	V	N	T	V	R	Q	R	V	.	W	.	.	V	N	P	.	.	A	D	G	N	Y	N	.	.	.	L	D	Y	N	I	A	I	A	K	R	A	K	A	A	G	L	G	V	Y	I	D	F	H	Y	S	D	T	W	A	D	P	A	H	Q	T	M	P	.	A	G	W	P	S
Template Known Secondary structure											T	T									.		.	.	S	S		.	.	T	T		T	T	S	.	.	.														T	T										S	S	S			B	T	T	B		B			.	T	T
Template Predicted Secondary structure																					.		.	.				.	.							.	.	.																																						.
Template SS confidence
		30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.		.			50	.	.			.	.	.	.	.	.				.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.		.	.	.	.	100
				151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.				.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																			.	.	.
Query SS confidence		.	.																			.	.	.
Query Sequence		.	.	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R	Y	.	.	.	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A
Query Conservation		.	.																			.	.	.
Alig confidence		.	.																			.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	I	D	N	L	S	W	K	L	Y	N	Y	T	L	D	A	A	N	K	L	Q	N	A	G	I	Q	P	T	I	V	S	I	G	N	E	I	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	L	L	W	P	T	G	R	T	E	N	W	A	N	.	.	.	.	.	.	I	A	R	L	L	H	S	A
Template Known Secondary structure		S																						T	T				S					S	S	S	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G			T	B	T	T			T	T					.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		101	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.															.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.							.	.	.	.	.	.	.	160
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.
Template Sequence		A	W	G	I	K	D	S	S	L	S	P	K	P	K	I	M	I	H	L	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	W	D	W	G	T	Q	N	W	W	Y	T	N	V	L	K	Q	G	T	L	E	L	S	D	F	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							T	S			S	S									S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T														T	T	S	S	S		G	G	G		.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
		306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	D	M	M	G	V	S	F	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	F	Y	S	S	S	A	T	L	S	A	L	K	S	S	L	D	N	M	A	K	T	W	N	K	E	I	A	V	V	E	T	N	W	P	I	S	C	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S		T	T																														S	B		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						207	.	.	210	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.
		386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.					.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.
Query Sequence		V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	.	.	.	.	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R
Query Conservation															.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.																.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	P	R	Y	S	F	P	S	D	V	K	N	I	P	F	S	P	E	G	Q	T	T	F	I	T	N	V	A	N	I	V	S	.	S	V	S	R	G	V	G	L	F	Y	W	E	P	A	W	I	H	N	A	N	L	G	S	S	C	A	D	N	T	M	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Q	S	G	Q	A
Template Known Secondary structure		S		S	S				G	G	G	T	T	S		S	S																	.	T	S	T	T									T	T		G	G	G	T	T	T	T	S	S	S	S	B			S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S	B	B
Template Predicted Secondary structure																																		.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		254	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.		.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.											.	.	.	320	.	.
		462	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	S	S	L	S	V	F	Q	R	I
Template Known Secondary structure			G	G	G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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