Job Description Q46829 Confidence 99.93% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 57 Aligned Residues 288 % Identity 15% Template d1hjqa_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 2.55

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		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.				.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.																		.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.																		.	.
Query Sequence		I	K	L	F	A	E	M	G	F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	.	.	.	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	.	.
Query Conservation																																																												.	.	.																		.	.
Alig confidence																		.		.	.				.	.							.	.	.																									.	.	.											.							.	.
Template Conservation																		.		.	.				.	.							.	.	.																																						.
Template Sequence		E	Y	I	L	A	E	N	G	V	N	M	V	R	Q	R	V	.	W	.	.	V	N	P	.	.	W	D	G	N	Y	N	.	.	.	L	D	Y	N	I	Q	L	A	R	R	A	K	A	A	G	L	G	L	Y	I	N	F	H	Y	S	D	T	W	A	D	P	A	H	Q	T	T	P	.	A	G	W	P	S	D	I	N
Template Known Secondary structure								T	T									.		.	.	S	S		.	.	T	T		T	T	S	.	.	.														T	T										S	S	S			B	T	T	B		B			.	T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure																		.		.	.				.	.							.	.	.																																						.
Template SS confidence
		33	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.		.			50	.	.			.	.	.	.	.	.				.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.		.	.	.	.	100	.	.	.
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.				.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.
Query Sequence		K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R	Y	.	.	.	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A
Query Conservation																			.	.	.
Alig confidence																			.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	L	A	W	K	L	Y	N	Y	T	L	D	S	M	N	R	F	A	D	A	G	I	Q	V	D	I	V	S	I	G	N	E	I	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	L	L	W	P	L	G	K	T	N	N	W	Y	N	I	A	R	L	L	H	.	.	.	.	.	.	S	A	A	W	G
Template Known Secondary structure																						T									S	S	S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	B	S	S	B	T	T	T	B	T	T											.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		104	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.															.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.							.	160	.	.	.
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	K	D	S	R	L	N	P	K	P	K	I	M	V	H	L	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	W	N	W	D	T	Q	N	W	W	Y	T	N	V	L	S	Q	G	P	F	E	M	S	D	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	S	S		S	S									S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T																S	S	S		G	G	G		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E
Query Conservation
Alig confidence		.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	D	M	M	G	V	S	F	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	F	Y	S	A	S	A	T	L	D	S	L	R	R	S	L	N	N	M	V	S	R	W	G	K	E	V	A	V	V	E	T	N	W	P	T	S	C	P	Y	P	R
Template Known Secondary structure		.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T		T	T																														S	B		S	S		S
Template Predicted Secondary structure		.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			207	.	.	210	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
		389	390	.	.	.	.	.	.	.					.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.
Query Sequence		D	G	S	I	N	D	D	Y	R	.	.	.	.	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S
Query Conservation											.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.																	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	Q	F	P	A	D	V	R	N	V	P	F	S	A	A	G	Q	T	Q	Y	I	Q	S	V	A	N	V	V	S	.	S	V	S	K	G	V	G	L	F	Y	W	E	P	A	W	I	H	N	A	N	L	G	S	S	C	A	D	N	T	M	F	T	P	S	G	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	S	S
Template Known Secondary structure		S				G	G	G	T	T	S		S	S																	.		S	T	T									T	T		G	G	G	T	T	T	T	S	S	S	S	B			S	B		T	T	S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B		G	G
Template Predicted Secondary structure																															.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.		.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.											.	.	.	.
		465	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	N	W	Y	K	E	V
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	S	V	F	H	R	I
Template Known Secondary structure		G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		326	.	.	.	330	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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