Job Description Q46829 Confidence 99.34% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 104 Aligned Residues 253 % Identity 12% Template d1g01a_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.90

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		74	.	.	.	.	.	80	.		.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure										.
Query SS confidence										.
Query Sequence		K	E	D	I	K	L	F	A	.	E	M	G	F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K
Query Conservation										.
Alig confidence										.													.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	N	A	F	V	A	L	S	N	D	W	G	S	N	M	I	R	L	A	M	Y	.	.	.	.	.	I	G	E	N	G	Y	A	T	N	P	E	V	K	D	L	V	Y	E	G	I	E	L	A	F	E	H	D	M	Y	V	I	V	D	W	H	V	H	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	D	P	R	A	D
Template Known Secondary structure										T	T	S			S								.	.	.	.	.	S	S	S	S	S	T	T	T		T	T															T	T											S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S		T	T	S	G
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		276	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.						.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.										.	.	.	.	.	340	.
		153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170					.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.
Query Sequence		V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	.	.	.	.	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A
Query Conservation																				.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	Y	S	G	A	Y	D	F	F	E	E	I	A	D	H	Y	K	D	H	P	K	N	H	Y	I	I	W	E	L	A	N	E	P	S	P	N	N	N	G	G	P	G	L	T	N	D	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	W	E	A	V	K	E	Y	A	E	P	I	V	E	M
Template Known Secondary structure		G	G	T	T													T	T		T	T	G	G	G							S				S			T	T	S					S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		342	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T
Query Conservation
Alig confidence									.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	R	E	K	G	D	N	.	.	M	I	L	V	G	N	P	N	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Q	R	P	D	L	S	A	D	N	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	A	E
Template Known Secondary structure									.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T								S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	S
Template Predicted Secondary structure									.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		405	.	.	.	.	410	.			.	.	.	.	.	.	.	.	420																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.																		.	.	.	.
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.
Template Sequence		N	I	M	Y	S	V	H	F	Y	T	G	S	H	G	A	S	H	I	G	Y	P	E	G	T	P	S	S	E	R	S	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	M	A	N	V	R	Y	A	.	L	D	N	G	V	A	V	F	A	T	E	W	G	T	S	Q	A	N	G	D	G	G
Template Known Secondary structure		S									T	T	T	S									T	T			G	G	G				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.			T	T										S	S	B	T	T	T	B	S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.
Template SS confidence
		436	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	470	.	.	.	.		.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.																.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.																.
Template Sequence		P	Y	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	A	D	V	W	L	N	F	L	N	K	H	N	I	S	.	.	.	W	A	N	W	S	L	T	N	K	N	E	I	S	G	A	.	F	T	P
Template Known Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													T	T			.	.	.									S	S	S	T	T		S	.	B
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.																.
Template SS confidence
		497	.	.												500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.				.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530		.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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