Job Description Q46829 Confidence 99.96% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 51 Aligned Residues 302 % Identity 13% Template d1edga_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.60

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		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V
Query Conservation
Alig confidence																														.																																											.
Template Conservation																														.																																											.
Template Sequence		K	Q	M	I	D	A	I	K	Q	K	G	F	N	T	V	R	I	P	V	S	W	H	P	H	V	S	G	S	.	D	Y	K	I	S	D	V	W	M	N	R	V	Q	E	V	V	N	Y	C	I	D	N	K	M	Y	V	I	L	N	T	H	H	D	V	D	K	V	K	G	Y	F	P	.	S	S	Q	Y	M	A	S	S
Template Known Secondary structure												T											G	G	G			T	T	.	T	T																			T	T	T									S		B		T	T	T	S	B		S	.	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																														.																																											.
Template SS confidence
		64	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.		.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.		.	.	.	.	.	.	140	.
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.			.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure																									.	.
Query SS confidence																									.	.
Query Sequence		V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	.	.	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R
Query Conservation																									.	.
Alig confidence																									.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	K	Y	I	T	S	V	W	A	Q	I	A	A	R	F	A	N	Y	D	E	H	L	I	F	E	G	M	N	E	P	R	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	H	A	N	E	W	W	P	E	L	T	N	S	D	V	V	D	S	I	N	C	I	N	Q	L	N	Q	D	F	V	N	T	V	R	A
Template Known Secondary structure																T	T	T			T	T							S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	T	T	T	T	S			T	T
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.													.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		232	.				.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.
Query SS confidence				.	.	.
Query Sequence		I	N	.	.	.	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T
Query Conservation				.	.	.
Alig confidence				.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template Sequence		T	G	G	K	N	A	S	R	Y	L	M	C	P	G	Y	V	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	G	A	T	N	D	Y	F	R	M	P	N	D	I	S	G	N	.	.	.	.	.	N	N
Template Known Secondary structure		T		G	G	G	G	T	S							G	G	G		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	T	T								T	T		.	.	.	.	.		S
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.						.	.
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.				370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.
Query Sequence		C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	.	.	.	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K
Query Conservation																																																															.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.																.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.
Template Sequence		K	I	I	V	S	V	H	A	Y	C	P	W	N	F	A	G	L	A	M	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	G	T	N	A	W	N	I	N	D	S	K	D	Q	S	E	V	T	W	F	M	D	N	I	Y	N	K	Y	T	S	R	G	I	P	V	I	I	G	E	C	G	A	V	D	K	N	.
Template Known Secondary structure												S					T	S		G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T							T	T																			T	G	G	G	T													S	S	.
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.													.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
		386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.									.	.	.						.	.	.									.	.								.	.				.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.									.	.	.						.	.	.									.	.								.	.				.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	N	L	K	T	R	V	E	Y	M	S	Y	Y	V	.	.	.	.	A	Q	A	K	A	R	G	I	.	.	.	L	C	I	L	W	.	.	.	D	N	N	N	F	S	G	T	.	.	G	E	L	F	G	F	F	.	.	D	R	R	.	.	.	.	.	S	C	Q	F	K	F	P	E	I	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.						T	T		.	.	.						.	.	.						S	S	S	.	.	S							.	.		T	T	.	.	.	.	.	T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.									.	.	.						.	.	.									.	.								.	.				.	.	.	.	.
Template SS confidence
									315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.					.	.	330	.	.	.	.	.				.	.	.	.	340				.	.	.	.	.	.	.	.			.	350	.	.	.	.	.			.	.	.						.	360	.	.	.	.	.	.	.	.
		466	.	.	.	470
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	W	Y	K	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		D	G	M	V	K
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		369	370	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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