Job Description Q46829 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 453 % Identity 25% Template d1e4mm_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 1.2

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	V	K	K	L	T	L	P	K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	L	N	S	S	S	F	S	S	D	F	I	F	G	V	A	S	S	A	Y	Q	I	E	G	T	I	.	.	.	G	R	G	L	N	I	W	D	G	F	T	H	R	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	P	N	K	S	G	P	D	H	G	N	G	D	T	T	C	D	S	F	S	Y	W	Q	K	D	I	D	V	L	D
Template Known Secondary structure		T	S		G	G	G	S		T	T													S		S	T	.	.	.	T	S			B									S	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T				S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		19	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.				.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.									.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.		.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure																							.
Query SS confidence																							.
Query Sequence		E	M	G	F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	.	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F
Query Conservation																							.
Alig confidence																							.
Template Conservation
Template Sequence		E	L	N	A	T	G	Y	R	F	S	I	A	W	S	R	I	I	P	R	G	K	R	S	R	G	V	N	E	K	G	I	D	Y	Y	H	G	L	I	S	G	L	I	K	K	G	I	T	P	F	V	T	L	F	H	W	D	L	P	Q	T	L	Q	D	E	Y	E	G	F	L	D	P	Q	I	I	D	D	F	K	D	Y
Template Known Secondary structure				T		S													T	T	S	S	G	G	G																				T	T									S	S			B									G	G	G	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200						.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.			.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.																																.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.																																.	.
Query Sequence		A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	.	.	.	.	.	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	.	.	I	N
Query Conservation																																										.	.	.	.	.																																.	.
Alig confidence																																										.	.	.	.	.																																.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	D	L	C	F	E	E	F	G	D	S	V	K	Y	W	L	T	I	N	Q	L	Y	S	V	P	T	R	G	Y	G	S	A	L	D	A	P	G	R	C	S	P	T	V	D	P	S	C	Y	A	G	N	S	S	T	E	P	Y	I	V	A	H	H	Q	L	L	A	H	A	K	V	V	D	L	Y	R	K	N	Y	T	H
Template Known Secondary structure										T	T	T								S		T	T								T	S		S	S	T	T					T	T	T		T	T		S	S			T	T	T																								S	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
		234	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.		.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.		.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure																					.															.
Query SS confidence																					.															.
Query Sequence		P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	.	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	.	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y
Query Conservation																					.															.
Alig confidence																					.															.																									.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.
Template Sequence		Q	G	G	K	I	G	P	T	M	I	T	R	W	F	L	P	Y	N	D	T	D	R	H	S	I	A	A	T	E	R	M	K	E	F	F	L	G	W	F	M	G	P	L	T	N	G	T	Y	P	Q	I	M	I	D	T	V	G	E	R	.	.	.	L	P	S	F	S	P	E	E	S	N	L	V	K	G	S	Y	D	F
Template Known Secondary structure		G																S	S	T	T																T										S	S										G	G	G	.	.	.	S												T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.				.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.
Query Sequence		L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	.
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.
Template Conservation
Template Sequence		L	G	L	N	Y	Y	F	T	Q	Y	A	Q	P	S	P	N	P	V	N	S	T	N	H	T	A	M	M	D	A	G	A	K	L	T	Y	I	N	A	S	G	H	Y	I	G	P	L	F	E	K	D	K	A	D	S	T	D	N	I	Y	Y	Y	P	K	G	I	Y	S	V	M	D	Y	F	K	N	K	Y	Y	N	P	L
Template Known Secondary structure																			T	T	S	T	T			G	G	G	G	G						S	B		T	T	S		B		S	S						S	S		G	G	G						T														T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
		373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D
Query Conservation
Alig confidence																																																																		.															.
Template Conservation																																																																		.															.
Template Sequence		I	Y	V	T	E	N	G	I	S	T	P	G	D	E	N	R	N	Q	S	M	L	D	Y	T	R	I	D	Y	L	C	S	H	L	C	F	L	N	K	V	I	K	E	K	D	V	N	V	K	G	Y	L	A	W	A	L	G	D	N	Y	E	F	N	K	G	.	F	T	V	R	F	G	L	S	Y	I	D	W	N	N	.
Template Known Secondary structure													T	T	S																																									S	B				B	T	T	T	B	.	T	S					S					T	T		.
Template Predicted Secondary structure																																																																		.															.
Template SS confidence
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.		.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
		453	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V	I	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.
Template Conservation		.	.	.
Template Sequence		.	.	.	V	T	D	R	D	L	K	K	S	G	Q	W	Y	Q	S	F	I	S
Template Known Secondary structure		.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.
Template SS confidence
					483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500