Job Description Q46829 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 23 Aligned Residues 452 % Identity 27% Template d1cbga_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 2.15

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.		.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure																																											.
Query SS confidence																																											.
Query Sequence		V	K	K	L	T	L	P	K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	.	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A
Query Conservation																																											.
Alig confidence																																											.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	N	R	S	C	F	A	P	G	F	V	F	G	T	A	S	S	A	F	Q	Y	E	G	A	A	F	E	D	G	K	G	P	S	I	W	D	T	F	T	H	K	Y	P	E	K	I	K	D	R	T	N	G	D	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	I	D	E	Y	H	R	Y	K	E	D	I	G	I	M	K
Template Known Secondary structure		S	S	G	G	G	S		T	T																S	S	S	T	T				B										G	G	G	S	T	T				S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		14	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.											.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.		.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure																							.
Query SS confidence																							.
Query Sequence		E	M	G	F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	.	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F
Query Conservation																							.
Alig confidence																							.
Template Conservation
Template Sequence		D	M	N	L	D	A	Y	R	F	S	I	S	W	P	R	V	L	P	K	G	K	L	S	G	G	V	N	R	E	G	I	N	Y	Y	N	N	L	I	N	E	V	L	A	N	G	M	Q	P	Y	V	T	L	F	H	W	D	V	P	Q	A	L	E	D	E	Y	R	G	F	L	G	R	N	I	V	D	D	F	R	D	Y
Template Known Secondary structure			T	T														S	T	T	S	S	G	G	G																				T	T									S	S			B									G	G	G	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.						.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.																															.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.																															.	.	.
Query Sequence		A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	.	.	.	.	.	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	.	.	.
Query Conservation																																												.	.	.	.	.																															.	.	.
Alig confidence																																												.	.	.	.	.																															.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	E	L	C	F	K	E	F	G	D	R	V	K	H	W	I	T	L	N	E	P	W	G	V	S	M	N	A	Y	A	Y	G	T	F	A	P	G	R	C	S	D	W	L	K	L	N	C	T	G	G	D	S	G	R	E	P	Y	L	A	A	H	Y	Q	L	L	A	H	A	A	A	A	R	L	Y	K	T	K	Y	Q	A
Template Known Secondary structure										T	T	T																			T	S			S	T	T					G	G	G		S			S	S			T	T	T																								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.		.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure																																				.
Query SS confidence																																				.
Query Sequence		N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	.	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y
Query Conservation																																				.
Alig confidence																																				.																									.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.
Template Sequence		S	Q	N	G	I	I	G	I	T	L	V	S	H	W	F	E	P	A	S	K	E	K	A	D	V	D	A	A	K	R	G	L	D	F	M	L	G	W	F	M	H	P	L	T	K	G	R	Y	P	E	S	M	R	Y	L	V	R	K	R	.	.	.	L	P	K	F	S	T	E	E	S	K	E	L	T	G	S	F	D	F
Template Known Secondary structure																			S	S	S	S															T										S	S										G	G	G	.	.	.	S												T	T			S
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.
Template SS confidence
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.				.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.										.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.		.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.		.	.	.	.	.	.	.	380
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																						.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																						.
Query Sequence		L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	.	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	.	L	F	I	V	E	N	G	F
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																						.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																						.
Template Conservation
Template Sequence		L	G	L	N	Y	Y	S	S	Y	Y	A	A	K	A	P	R	I	P	N	A	R	P	A	I	Q	T	D	S	L	I	N	A	T	F	E	H	N	G	K	P	L	G	P	M	A	A	S	S	W	L	C	I	Y	P	Q	G	I	R	K	L	L	L	Y	V	K	N	H	Y	N	N	P	V	I	Y	I	T	E	N	G	R
Template Known Secondary structure																			T	T									T						S			T	T			S	S		B		S	S	T	T		B			T														T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
		381	.	.	.			.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.
Query SS confidence						.	.
Query Sequence		G	A	Y	D	.	.	K	V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S
Query Conservation						.	.
Alig confidence						.	.																														.																							.															.	.	.	.
Template Conservation																																					.																							.															.	.	.	.
Template Sequence		N	E	F	N	D	P	T	L	S	L	Q	E	S	L	L	D	T	P	R	I	D	Y	Y	Y	R	H	L	Y	Y	V	L	T	A	I	G	.	D	G	V	N	V	K	G	Y	F	A	W	S	L	F	D	N	M	E	W	D	S	G	.	Y	T	V	R	F	G	L	V	F	V	D	F	K	N	.	.	.	.	N	L	K
Template Known Secondary structure							T	T	S																												.	T	T									S		S	B					G	G	G	T	.	T	S					S					T	T	T	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																					.																							.															.	.	.	.
Template SS confidence
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.		.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.		.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.					.	.	.
		459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V	I	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	H	P	K	L	S	A	H	W	F	K	S	F	L	K
Template Known Secondary structure															T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		475	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.