Job Description Q46829 Confidence 99.96% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 52 Aligned Residues 287 % Identity 18% Template d1bg4a_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.75

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		10	.	.	.	.		.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.
Query SS confidence							.
Query Sequence		K	D	F	L	W	.	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F	K	C	F
Query Conservation							.
Alig confidence							.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template Sequence		H	G	K	K	Y	L	G	T	I	G	D	Q	Y	T	L	T	K	N	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	N	P	A	I	I	K	.	.	A	D	F	G	Q	L	T	P
Template Known Secondary structure		T	T		S													S		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.				S
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template SS confidence
		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.																																													.	.	.	.	.	.	.			.	40	.	.	.	.	.	.
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.			.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.
Query SS confidence																																										.	.
Query Sequence		R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	.	.	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E
Query Conservation																																										.	.
Alig confidence													.	.												.	.	.														.	.																	.			.	.
Template Conservation													.	.												.	.	.																																.			.	.
Template Sequence		E	N	S	M	K	W	D	A	T	E	P	.	.	N	R	G	Q	F	T	F	S	G	S	D	.	.	.	Y	L	V	N	F	A	Q	S	N	G	K	L	I	R	G	H	T	L	V	W	H	S	Q	L	P	G	W	V	S	S	I	.	T	D	.	.	K	N	T	L	I	S	V	L	K	N	H	I	T	T	V	M	T
Template Known Secondary structure		S	S	T	T	S						S	.	.	B	T	T	B								.	.	.									T	T											S	S	S							T		.			.	.
Template Predicted Secondary structure													.	.												.	.	.																																.			.	.
Template SS confidence
		47	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.			.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.				.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.		100	.			.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.																							.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.																							.
Template Sequence		R	Y	K	G	K	I	Y	A	W	D	V	L	N	E	I	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	E	D	G	S	L	R	N	S	V	F	Y	N	V	I	G	E	D	Y	V	R	.	.	.	I	A	F	E	T	A	R	S	V	D	P	N	A	K	L	Y	I	N	D	Y	N	L	.
Template Known Secondary structure			T	T	T	T		S							S		B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S	S	B									T		T					.	.	.											T	T	S							S			.
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.																							.
Template SS confidence
		119	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.				.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	S	A	G	Y	S	K	V	N	G	M	V	S	H	V	K	K	W	L	A	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	I	D	G	I	G	S	Q	T	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	T	T																	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																									178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.																200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	A	G	A	G	S	A	V	A	G	A	L	N	A	L	A	S	A	G	T	K	E	I	A	I	T	E	L	D	I	A	G	A	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	Y	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T		G	G	G										T	T			S										T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																									211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	250
		407	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V	I
Query Conservation
Alig confidence									.																								.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.																								.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	V	V	N	A	C	L	.	N	Q	A	K	C	V	G	I	T	V	W	G	V	A	D	P	D	S	W	R	S	S	S	.	.	.	S	P	L	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	N	Y	N	P	K	A	A	Y	N	A	I	A	N	A	L
Template Known Secondary structure									.	T		T	T							S		S	B	G	G	G		T	T	G	G	G	.	.	.			S	S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure									.																								.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		251	.	.	.	.	.	.		.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280				.	.	.	.	.											.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.