Job Description Q46829 Confidence 99.86% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 67 Aligned Residues 296 % Identity 15% Template c3pzqA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:mannan endo-1,4-beta-mannosidase. glycosyl hydrolase family PDBTitle: structure of the hyperthermostable endo-1,4-beta-d-mannanase from2 thermotoga petrophila rku-1 with maltose and glycerol Resolution 1.92 Å

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		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90											.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.							.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F	K	C	F	R	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	.	.	.	.	.	.	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	M	I	D	S	V	L	E	S	A	R	D	M	G	I	K	V	L	R	I	W	G	F	L	D	G	E	S	Y	C	R	D	K	N	T	Y	M	H	P	E	P	G	V	F	G	V	P	E	G	I	S	N	A	Q	N	G	F	E	R	L	D	Y	T	I	A	K	A	K	E	L	G	I	K	L	I	I	V	L	V	N
Template Known Secondary structure															T											B	S								T			S	B	S	B	T	T	B		S	S		T	T			S																			T									B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		53	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.
		135	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.											.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.											.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Template Sequence		N	W	D	D	F	G	G	M	N	Q	Y	V	R	W	F	G	G	T	H	H	D	D	F	Y	R	D	E	R	I	K	E	E	Y	K	K	Y	V	S	F	L	I	N	H	V	N	V	Y	T	G	V	P	Y	R	E	E	P	T	I	M	A	W	E	L	A	N	E	L	R	C	E	T	D	K	S	G	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	S	S	T	T	S									T	T		S	S	G	G	G	G	G	T																			B		T	T	T			B	G	G	G		T	T						S		B	T				T	T		T	T	S	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		133	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
		195	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	T	L	V	E	W	V	K	E	M	S	S	Y	I	K	S	L	D	P	N	H	L	V	A	V	G	D	E	G	F	F	S	N	Y	E	G	F	K	P	Y	G	G	E	A	E	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			S	S	S											B			T	T				G	G	G		S	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																							208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Y	N	G	W	S	G	V	D	W	K	K	L	L	S	I	E	T	V	D	F	G	T	F	H	L	Y	P	S	H	W	G	V	S	P	E	N	Y	A	Q	W	G	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	B	T	T	T	S								T		T	T			S							T	T	T	T	T			G	G	G								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																		254	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																													.	.	.	.	.
Query Sequence		P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	W	I	E	D	H	I	K	I	A	K	E	I	G	K	P	V	V	L	E	E	Y	G	I	P	K	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	V	N	R	T	A	I	Y	R	L	W	N	D	L	V	Y	D	L	.	.	.	.	.	.	G	G	D	G	A	M	F	W	M	L	A	G	I	G	E	G	S
Template Known Secondary structure		.	.	.													T												T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S																	.	.	.	.	.	.	T		S					S		B			B		B	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.										.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.							.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
				430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.
Query SS confidence		.	.
Query Sequence		.	.	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V	I	A
Query Conservation		.	.
Alig confidence		.	.								.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	R	D	E	R	G	Y	Y	P	.	D	Y	D	G	F	R	I	V	N	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	P	E	A	E	L	I	R	E	Y	A	K
Template Known Secondary structure		B			T	T	S	B			.		S	S	S			B		S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure											.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		360	.	.	.	.	.	.	.	.		.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.														380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.

No model constructed - rank, confidence too low