Job Description Q46829 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 452 % Identity 29% Template c3ptkB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:beta-glucosidase os4bglu12; PDBTitle: the crystal structure of rice (oryza sativa l.) os4bglu12 Resolution 2.49 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.		.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure																																											.
Query SS confidence																																											.
Query Sequence		V	K	K	L	T	L	P	K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	.	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A
Query Conservation																																											.
Alig confidence																																											.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	S	R	R	S	F	P	K	G	F	I	F	G	T	A	S	S	S	Y	Q	Y	E	G	G	A	A	E	G	G	R	G	P	S	I	W	D	T	F	T	H	Q	H	P	E	K	I	A	D	R	S	N	G	D	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	D	S	Y	H	L	Y	K	E	D	V	R	L	M	K
Template Known Secondary structure				G	G	G	S		T	T																T	T	S	T	T				B										G	G	G	S	T	T	S			S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.											.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.		.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure																							.
Query SS confidence																							.
Query Sequence		E	M	G	F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	.	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F
Query Conservation																							.
Alig confidence																							.
Template Conservation
Template Sequence		D	M	G	M	D	A	Y	R	F	S	I	S	W	T	R	I	L	P	N	G	S	L	R	G	G	V	N	K	E	G	I	K	Y	Y	N	N	L	I	N	E	L	L	S	K	G	V	Q	P	F	I	T	L	F	H	W	D	S	P	Q	A	L	E	D	K	Y	N	G	F	L	S	P	N	I	I	N	D	F	K	D	Y
Template Known Secondary structure				T		S												S	T	T	S	S	S	T	T																			T	T	T									S	S			B									G	G	G	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.						200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.																																		.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.																																		.	.	.
Query Sequence		A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	.	.	.	.	.	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	.	.	.
Query Conservation																																									.	.	.	.	.																																		.	.	.
Alig confidence																																									.	.	.	.	.																																		.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	E	I	C	F	K	E	F	G	D	R	V	K	N	W	I	T	F	N	E	P	W	T	F	C	S	N	G	Y	A	T	G	L	F	A	P	G	R	C	S	P	W	E	K	G	N	C	S	V	G	D	S	G	R	E	P	Y	T	A	C	H	H	Q	L	L	A	H	A	E	T	V	R	L	Y	K	A	K	Y	Q	A
Template Known Secondary structure										T	T	T																			T	B			S	T	T			B		T	T	S	T	T			S	S			T	T	T																								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.		.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure																																				.
Query SS confidence																																				.
Query Sequence		N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	.	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y
Query Conservation																																				.
Alig confidence																																				.																									.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.
Template Sequence		L	Q	K	G	K	I	G	I	T	L	V	S	H	W	F	V	P	F	S	R	S	K	S	N	N	D	A	A	K	R	A	I	D	F	M	F	G	W	F	M	D	P	L	I	R	G	D	Y	P	L	S	M	R	G	L	V	G	N	R	.	.	.	L	P	Q	F	T	K	E	Q	S	K	L	V	K	G	A	F	D	F
Template Known Secondary structure																			S	S	S	S															T										S	S										G	G	G	.	.	.	S												T	T			S
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.
Template SS confidence
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.				.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.											.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.		.	.	.	.	.	.	.	380
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Query Sequence		L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	.	L	F	I	V	E	N	G	F
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Template Conservation
Template Sequence		I	G	L	N	Y	Y	T	A	N	Y	A	D	N	L	P	P	S	N	G	L	N	N	S	Y	T	T	D	S	R	A	N	L	T	G	V	R	N	G	I	P	I	G	P	Q	A	A	S	P	W	L	Y	V	Y	P	Q	G	F	R	D	L	L	L	Y	V	K	E	N	Y	G	N	P	T	V	Y	I	T	E	N	G	V
Template Known Secondary structure																				S	S	S							T						S			T	T			S	S		B		S	S	T	T		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
		381	.	.	.	.			.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.
Query SS confidence							.	.
Query Sequence		G	A	Y	D	K	.	.	V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S
Query Conservation							.	.
Alig confidence							.	.																													.																							.															.	.	.	.
Template Conservation																																					.																							.															.	.	.	.
Template Sequence		D	E	F	N	N	K	T	L	P	L	Q	E	A	L	K	D	D	A	R	I	E	Y	Y	H	K	H	L	L	S	L	L	S	A	I	R	.	D	G	A	N	V	K	G	Y	F	A	W	S	L	L	D	N	F	E	W	S	N	G	.	Y	T	V	R	F	G	I	N	F	V	D	Y	N	D	.	.	.	.	G	R	K
Template Known Secondary structure							T	T	S						T																						.	T	T											S	B					G	G	G	T	.	T	S					S					T	T	T	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																					.																							.															.	.	.	.
Template SS confidence
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.		.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.		.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.					.	.	470
		459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V	I	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	Y	P	K	N	S	A	H	W	F	K	K	F	L	L
Template Known Secondary structure															T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		471	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.