Job Description Q46829 Confidence 99.80% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 75 Aligned Residues 296 % Identity 17% Template c3icgD_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: D: PDB Molecule:endoglucanase d; PDBTitle: crystal structure of the catalytic and carbohydrate binding domain of2 endoglucanase d from clostridium cellulovorans Resolution 2.10 Å

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		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F	K	C	F	R
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	G	W	N	L	G	N	T	M	D	A	I	G	G	E	T	N	W	G	N	P	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	H	A	M	I	N	K	I	K	E	A	G	F	N	T	L	R
Template Known Secondary structure		S					T	T	S	T	T	S	T	T	S	T	T	T	T	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		24	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R	Y	K
Query Conservation
Alig confidence																																															.	.								.	.
Template Conservation																																															.	.								.	.
Template Sequence		L	P	V	T	W	D	G	H	M	G	A	A	P	E	Y	T	I	D	Q	T	W	M	K	R	V	E	E	I	A	N	Y	A	F	D	N	D	M	Y	V	I	I	N	L	H	H	.	.	E	N	E	W	L	K	P	.	.	F	Y	A	N	E	A	Q	V	K	A	Q	L	T	K	V	W	T	Q	I	A	N	N	F	K
Template Known Secondary structure							T	T	S	B			T	T	T			B																	T	T	T									S	.	.		T	T	T				.	.	S																						T	T
Template Predicted Secondary structure																																															.	.								.	.
Template SS confidence
		64	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.			.	110	.	.	.	.	.			.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		170	.			.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.
Query SS confidence				.	.
Query Sequence		H	K	.	.	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L
Query Conservation				.	.
Alig confidence				.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.
Template Sequence		K	Y	G	D	H	L	I	F	E	T	M	N	E	P	R	P	V	G	A	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	W	T	G	G	S	Y	E	N	R	E	V	V	N	R	Y	N	L	T	A	V	N	A	I	R	A	T	G	G	N	N	A	T	R	Y	I	M	V	P	T	L	A	.	.	.
Template Known Secondary structure		T			T	T					S		S	S				S		G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S																								T		G	G	G	G	T	S							G	G	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.
Template SS confidence
		140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160															.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	A	M	S	T	T	I	N	D	L	V	I	P	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	D	S	K	V	I	V	S	L	H	M	Y	S	P	Y	F	F	A	M	D	I	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G			S										G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G		T	T										S					T		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																															203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.															.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.				370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.
Query Sequence		T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	.	.	.	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H
Query Conservation																																												.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	T	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	G	S	D	Y	D	K	S	S	L	D	S	E	F	D	A	V	Y	N	K	F	V	K	N	G	R	A	V	V	I	G	E	M	G	S	I	N	K	N	.	.	.	.	.	.	.	.	N	T	A	A	R	V	T	H	A	E	Y	Y
Template Known Secondary structure		S		S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S																		T	G	G	G	T													S	S	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		240	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.									.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.									.	.	.								.	.								.	.
Template Conservation			.	.	.	.									.	.	.								.	.								.	.
Template Sequence		A	.	.	.	.	K	S	A	K	A	R	G	L	.	.	.	T	P	I	W	W	D	N	.	.	G	Y	S	V	A	G	K	.	.	A	E	T	F	G	I	F
Template Known Secondary structure			.	.	.	.					T	T	T		.	.	.								.	.	S				T	T	S	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.									.	.	.								.	.								.	.
Template SS confidence
		295					.	.	.	.	300	.	.	.				.	.	.	.	.	.	310			.	.	.	.	.	.	.			.	.	320	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low