Job Description Q46829 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 40 Aligned Residues 309 % Identity 15% Template c3emzA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:endo-1,4-beta-xylanase; PDBTitle: crystal structure of xylanase xynb from paenibacillus2 barcinonensis complexed with a conduramine derivative Resolution 2.08 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	L	T	L	P	K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Template Sequence		S	A	S	Y	A	N	S	F	K	I	G	A	A	V	H	T	R	M	L	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	E	G	E	.	.	F	I	A	K	H	Y	N
Template Known Secondary structure		T	G	G	G	T	T	T														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.							S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	30	.	.			.	.	.	.	.	.	.
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.			130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.			.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure																																															.	.																.	.
Query SS confidence																																															.	.																.	.
Query Sequence		F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	.	.	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	.	.	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F
Query Conservation																																															.	.																.	.
Alig confidence																	.	.									.	.	.																		.	.																.	.
Template Conservation																	.	.									.	.	.
Template Sequence		S	V	T	A	E	N	Q	M	K	F	E	E	V	H	P	.	.	R	E	H	E	Y	T	F	E	.	.	.	A	A	D	E	I	V	D	F	A	V	A	R	G	I	G	V	R	G	H	T	L	V	W	H	N	Q	T	P	A	W	M	F	E	D	A	S	G	G	T	A	S	R	E	M	M	L	S	R	L	K	Q	H
Template Known Secondary structure						S	S	T	T	S						S	.	.	B	T	T	B					.	.	.											T	T	T								S	B		S	S	S			G	G	G	G	B		T	T	S	S	B
Template Predicted Secondary structure																	.	.									.	.	.
Template SS confidence
		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.			.	.	.	.	.	60	.	.				.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C
Query Conservation
Alig confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	D	T	V	V	G	R	Y	K	D	Q	I	Y	A	W	D	V	V	N	E	A	I	E	D	K	T	D	L	I	M	R	D	T	K	W	L	R	L	L	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Y	L	V	Q	A	F	N	M	A	H	E	A	D	P	N	A	L	L	F	Y
Template Known Secondary structure									T	T	T	T		S									B		S	S	T	T			B									T		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T														T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	D	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	D	P	V	K	R	E	K	I	Y	N	L	V	R	S	L	L	D	Q	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	V	H	G	I	G	M	Q	G	H	W	N	I
Template Known Secondary structure				S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S																		T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													T
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		177	.	.	180																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.			.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.
Query SS confidence																																																																											.	.
Query Sequence		A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S	I	N	.	.	D	D	Y	R	I
Query Conservation																																																																											.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.																												.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Sequence		H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	S	M	D	E	I	R	Q	A	I	E	R	Y	.	A	S	L	D	V	Q	L	H	V	T	E	L	D	L	S	V	F	R	H	E	D	Q	R	T	D	L	T	E	P	T	A	E	M	A
Template Known Secondary structure		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	S													.		T	T	S												S	S		T	T							S	S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template SS confidence
		216																															.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230		.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.						.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.
Query Sequence		D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	.	.	.	.	.	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y
Query Conservation																																										.	.	.	.	.
Alig confidence																																								.		.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	L	Q	Q	K	R	Y	E	D	I	F	G	L	F	R	E	Y	R	S	N	I	T	S	V	T	F	W	G	V	A	D	N	Y	T	W	L	D	N	.	F	P	V	R	G	R	K	N	W	P	F	V	F	D	T	E	L	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	D	S	F	W	R	I
Template Known Secondary structure																		T	T	T	T							S	S	S	S	T	T			G	G	G	S	.	S	S	S	T	T						S	S	B		T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure																																								.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.		.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320											.	.	.	.	.	.	.	.