Job Description Q46829 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 438 % Identity 34% Template c3ahxC_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: C: PDB Molecule:beta-glucosidase a; PDBTitle: crystal structure of beta-glucosidase a from bacterium clostridium2 cellulovorans Resolution 1.90 Å

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	T	L	P	K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F
Query Conservation
Alig confidence																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	R	F	P	K	D	F	I	F	G	T	A	T	A	A	Y	Q	I	E	G	A	Y	K	E	D	E	K	G	E	S	I	W	D	R	F	S	H	I	P	G	N	V	A	K	M	H	N	G	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	C	D	H	Y	H	R	Y	K	E	D	V	Q	L	L	K	S	L	G	I
Template Known Secondary structure						T	T																T	T	G	G	G				B							T	S	T	T	S	S	G	G	G			T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T																T	T
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.											.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F
Query Conservation
Alig confidence																		.																																								.
Template Conservation																		.																																								.
Template Sequence		K	S	Y	R	F	S	I	A	W	P	R	I	F	P	K	G	.	F	G	E	I	N	Q	K	G	I	Q	F	Y	R	D	L	I	D	E	L	I	K	N	D	I	E	P	A	I	T	I	Y	H	W	D	L	P	Q	K	L	.	Q	D	I	G	G	W	A	N	P	Q	V	A	D	Y	Y	V	D	Y	A	N	L	L	F
Template Known Secondary structure															T	T	S	.	S	S	S																			T	T									S	S			B				.		T	T	T	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																		.																																								.
Template SS confidence
		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.		.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	E	F	G	D	R	V	K	T	W	I	T	H	N	E	P	W	V	A	S	Y	L	G	Y	A	L	G	.	.	.	.	.	.	.	V	H	A	P	G	I	K	D	M	K	M	A	L	L	A	A	H	N	I	L	L	S	H	F	K	A	V	K	A	Y	R	E	L	E	Q	D	G	Q	I	G	I	T	L	N	L	S
Template Known Secondary structure					T	T	T																			T	S		.	.	.	.	.	.	.	S	S	T	T																													T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.								.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.		.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.
Query SS confidence																							.
Query Sequence		P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	.	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A
Query Conservation																							.
Alig confidence																							.																																							.
Template Conservation																																																														.
Template Sequence		T	C	Y	S	N	S	A	D	E	E	D	I	A	A	A	H	R	S	D	G	W	N	N	R	W	F	L	D	A	A	L	K	G	T	Y	P	E	D	M	I	K	I	F	S	D	T	N	I	M	P	E	L	P	K	E	L	F	T	E	V	.	F	E	T	S	D	F	L	G	I	N	Y	Y	T	R	Q	V	V	K	N
Template Known Secondary structure						S	S	S																T										S	S												T	T							T	T	T	T	T	T	T	.					S
Template Predicted Secondary structure																																																														.
Template SS confidence
		225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.		.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.
Query SS confidence																																															.
Query Sequence		E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	.	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A
Query Conservation																																															.
Alig confidence									.	.	.	.	.																																		.
Template Conservation									.	.	.	.	.
Template Sequence		N	S	E	A	F	I	G	.	.	.	.	.	A	E	S	V	A	M	D	N	P	K	T	E	M	G	W	E	I	Y	P	Q	G	L	Y	D	L	L	T	R	I	H	R	D	Y	G	N	I	D	L	Y	I	T	E	N	G	A	A	F	N	D	M	V	N	R	D	G	K	V	E	D	E	N	R	L	D	Y	L	Y	T
Template Known Secondary structure			T	T	S	G	G	G	.	.	.	.	.								S		B		T	T			B			T														S																				T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		304	.	.	.	.	.	310						.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
		404	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V	I	A	S	N
Query Conservation
Alig confidence												.																							.														.	.	.	.	.
Template Conservation												.																							.														.	.	.	.	.
Template Sequence		H	F	A	A	A	L	S	A	I	E	.	A	G	V	P	L	K	G	Y	Y	I	W	S	F	M	D	N	F	E	W	A	E	G	.	Y	E	K	R	F	G	I	V	H	V	N	Y	K	.	.	.	.	.	T	Q	E	R	T	I	K	K	S	A	Y	W	Y	K	E	L	I	E	R	S
Template Known Secondary structure												.	T	T											S	B					G	G	G	G	.	G	G	S				S					T	T	.	.	.	.	.	T						B													T
Template Predicted Secondary structure												.																							.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		379	380	.	.	.	.	.	.	.	.		.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410		.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.						.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.