Job Description Q46829 Confidence 99.62% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 87 Aligned Residues 277 % Identity 12% Template c2zunB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:458aa long hypothetical endo-1,4-beta-glucanase; PDBTitle: functional analysis of hyperthermophilic endocellulase from2 the archaeon pyrococcus horikoshii Resolution 2.00 Å

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		73	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.										.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.
Template Sequence		W	E	D	M	L	L	Q	I	K	S	L	G	F	N	A	I	R	L	P	F	C	T	E	S	V	K	P	G	T	Q	P	I	G	I	D	Y	S	K	N	P	D	L	R	G	L	D	S	L	Q	I	M	E	K	I	I	K	K	A	G	D	L	G	I	F	V	L	L	D	Y	H	R	I	G	C	T	H	.	.	.	I
Template Known Secondary structure												T	T										G	G	G	G	S	T	T					S			T	T	T	S	G	G	G	T	T																	T	T										S	S	S	S	S	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.				.
		144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.			.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
Predicted Secondary structure																																	.	.
Query SS confidence																																	.	.
Query Sequence		Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	.	.	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A
Query Conservation																																	.	.
Alig confidence																																	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	P	L	W	Y	T	E	D	F	S	E	E	D	F	I	N	T	W	I	E	V	A	K	R	F	G	K	Y	W	N	V	I	G	A	D	L	K	N	E	P	H	S	V	T	S	P	P	A	A	Y	T	D	G	T	G	A	T	W	G	M	G	N	P	A	T	D	W	N	L	A	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	S	S		B	T	T	B																	T	T	S	T	T							S	S					S	S		T	T	G	G	G	T	S	S	S	S		B	S	S	S	S		T	T	T	B							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	R	I	G	K	A	I	L	K	V	A	P	H	W	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	F	V	E	G	T	Q	F	T	N	P	K	T	D	S	S	Y	K	W	G	Y	N	A	W	W	G	G	N	L
Template Known Secondary structure		.	.											T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						B	S								T	T	S	T	T	G	G	G			T	T		B
Template Predicted Secondary structure		.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
		302	.	.	.	.	.	.	.	310							.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	V	L	R	E	G	T	C	D	.	.	.	.	.	.	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	L	F	I
Query Conservation											.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	A	V	K	D	Y	P	V	N	L	P	K	N	K	L	V	Y	S	P	H	V	Y	G	P	D	V	Y	N	Q	P	Y	F	G	P	A	K	G	F	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	L	P	D	I	W	Y	H	H	F	G	Y	V	K	L	E	L	G	Y	S	V	V	I
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	T	S				S		T	T	T						B				T	T	T				G	G	G	S	G	G	G	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T									T	T					T	T						B
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	E	F	G	G	K	Y	G	H	G	G	.	.	.	.	.	.	.	D	P	R	D	V	I	W	Q	N	K	L	V	D	W	M	I	E	N	.	.	.	.	.	.	K	F	C	D	F	F	Y	W	S	W
Template Known Secondary structure			B					T	T	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.		T																	.	.	.	.	.	.	T							S		S
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.								.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.							370	.	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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