Job Description Q46829 Confidence 99.63% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 86 Aligned Residues 328 % Identity 16% Template c2w5fB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:endo-1,4-beta-xylanase y; PDBTitle: high resolution crystallographic structure of the2 clostridium thermocellum n-terminal endo-1,4-beta-d-3 xylanase 10b (xyn10b) cbm22-1-gh10 modules complexed with4 xylohexaose Resolution 1.90 Å

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		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	P	K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F	K	C
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Template Sequence		Y	A	N	Y	F	R	V	G	S	V	L	N	S	G	T	V	N	N	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	I	K	A	.	.	L	I	L	R	E	F	N	S	I	T
Template Known Secondary structure		T	T	T	T									T	T	T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.							S
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Template SS confidence
		199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	220	.			.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.							.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130		.	.		.	.	.	.	.	.	.	140	.						.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.																											.			.										.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.																											.			.										.	.	.	.	.
Query Sequence		F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	.	.	.	.	.	.	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	.	T	L	.	S	H	F	E	M	P	L	H	L	.	.	.	.	.	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.																											.			.										.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.				.	.	.	.	.	.									.	.	.																.			.										.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.																		.	.	.
Template Sequence		C	E	N	E	M	K	P	D	A	T	L	V	.	.	Q	S	G	S	T	N	T	N	I	R	V	S	L	N	R	A	A	.	.	.	S	I	L	N	F	C	A	Q	N	N	I	A	V	R	G	H	T	L	V	W	H	S	Q	T	P	Q	W	F	F	K	D	N	F	Q	D	N	G	N	W	V	S	Q	S	V	M	D
Template Known Secondary structure			S	S	T	T	S							.	.						T	T							T	T	T		.	.	.									T	T											S	S	S			G	G	G	G	B	T	T	S	S	T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure														.	.																		.	.	.
Template SS confidence
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.			.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260				.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.						.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.
Query Sequence		D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	K	.	.	.	.	.	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A
Query Conservation																			.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.																					.	.	.	.																								.
Template Conservation																																												.	.	.	.																								.
Template Sequence		Q	R	L	E	S	Y	I	K	N	M	F	A	E	I	Q	R	Q	Y	P	S	L	N	L	Y	A	Y	D	V	V	N	A	A	V	S	D	D	A	N	R	T	R	Y	.	.	.	.	Y	G	G	A	R	E	P	G	Y	G	N	G	R	S	P	W	V	Q	I	Y	G	D	N	.	K	F	I	E	K	A	F	T	Y	A
Template Known Secondary structure																				T	T	S										S		B		S								.	.	.	.	S	T	T	B			B	S	S	B	T	T	B	B							S	S	T	.	T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.																								.
Template SS confidence
		307	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.					.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.		.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
		230	.	.	.	.		.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.
Query SS confidence							.
Query Sequence		R	R	I	N	P	.	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T
Query Conservation							.
Alig confidence							.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	K	Y	A	P	A	N	C	K	L	Y	Y	N	D	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	E	Y	W	D	H	K	R	D	C	I	A	S	I	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	L	Y	N	K	G	L
Template Known Secondary structure					S		T	T								S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T	S												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.														.	.	.	.	.	.	.	.
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.																						.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.																						.
Template Sequence		L	D	G	V	G	M	Q	S	H	I	N	A	D	M	N	G	F	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	Q	N	Y	K	A	A	L	Q	K	Y	.	I	N	I	G	C	D	V	Q	I	T	E	L	D	I	S	T	E	N	G	K	F	.
Template Known Secondary structure													S		S	S	S	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.				S	S												T	T	T	T	S	.
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.																						.
Template SS confidence
		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.		450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.		.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.
Query SS confidence																																.
Query Sequence		D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	.	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W
Query Conservation																																.
Alig confidence		.	.	.	.																											.																			.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																														.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	S	L	Q	Q	Q	A	D	K	Y	K	A	V	F	Q	A	A	V	D	I	N	R	T	S	S	K	G	K	V	T	A	V	C	V	W	G	P	N	D	A	N	T	W	L	G	S	.	.	Q	N	A	P	L	L	F	N	A	N	N	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	P	A	Y	N	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.																									S	S								S	S	S	S	T	T	S		T	T		G	.	.	G	G			S	S	B		T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																														.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						471	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.			.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.											.	.	530	.	.	.	.
		468	.	470	.	.	.	.					.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.
Query Sequence		Y	K	E	V	I	A	S	.	.	.	.	N	G	E	K	L
Query Conservation									.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	A	S	I	I	P	Q	S	E	W	G	D	G	N	N	P
Template Known Secondary structure				T	S	S		G	G	G				T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		535	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550