Job Description Q46829 Confidence 95.49% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 149 Aligned Residues 184 % Identity 17% Template c2vx6A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:cellvibrio japonicus mannanase cjman26c; PDBTitle: cellvibrio japonicus mannanase cjman26c gal1man4-bound form Resolution 1.57 Å

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		114	.	.	.	.	.	120	.	.				.	.	.	.	.	.	.	130	.	.		.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.												.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
Predicted Secondary structure											.	.	.											.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.											.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	D	D	M	F	D	E	L	L	.	.	.	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	.	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	K	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation											.	.	.											.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.				.	.						.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.																																																.
Template Sequence		F	E	K	M	Q	H	W	I	K	A	G	Y	S	R	G	.	.	G	V	I	T	I	S	W	H	V	F	N	P	V	S	G	G	N	S	W	D	K	T	P	A	V	H	E	L	I	P	G	G	A	R	H	A	T	L	K	A	Y	L	D	T	F	V	A	.	F	N	E	G	L	A	D	V	D	A	Q	G	N	K	H
Template Known Secondary structure															T	T	.	.												T	T	T	S			T	T										S	T	T	S	T	T														.				T	T					T	T	S
Template Predicted Secondary structure																	.	.																																																.
Template SS confidence
		134	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.			.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.		.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
			172	.		.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.			.
Query SS confidence		.			.
Query Sequence		.	V	K	.	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P
Query Conservation		.			.
Alig confidence		.			.										.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	P	P	I	I	F	R	P	W	H	E	H	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	W	F	W	W	G	K	G	H	A	S	E	Q	D	Y	I	A	L	W	R	F	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	H	Y	L	R	D	E	K	K	L	R	N	L	I	Y	A	Y	S	P	D	R	S	R	I
Template Known Secondary structure										S		S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S	S	T	T	S	B	T	T	B													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T	S				S								B	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.										.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.												.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270
		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	M	A	N	F	E	A	G	Y	L	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	Y	V	D	I	I	G	L	D	N	Y	W	D	V	G	H	E	A	N	T	A	S	A
Template Known Secondary structure			G	G	G						T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G		S								G	G	G	T		T	T			S
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.																		.	.	.																									.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	K	A	A	L	T	A	S	L	K	Q	L	V	Q	I	A	R	S	K	G	K	I	A	A	L	T	E	T	G	N
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		310	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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