Job Description Q46829 Confidence 98.49% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 115 Aligned Residues 284 % Identity 11% Template c2vrqB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:alpha-l-arabinofuranosidase; PDBTitle: structure of an inactive mutant of arabinofuranosidase from2 thermobacillus xylanilyticus in complex with a3 pentasaccharide Resolution 2.00 Å

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		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90																										.	.	.	.	.	.		.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Query Sequence		K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F	K	C	F	R	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	I	A	W	T	R	.	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.						.				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	D	V	L	E	A	L	K	Q	M	K	I	P	V	L	R	W	P	G	G	C	F	A	D	E	Y	H	W	K	D	G	V	G	P	R	E	K	R	K	R	M	V	N	T	H	W	G	G	V	I	E	N	N	H	.	F	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	E	F	M	M	L	C	E	L	L	G	C	E
Template Known Secondary structure												T							S		S	G	G	G	G	T			G	G	G	G	S	S	S	G	G	G							T	T	T	T	T							.	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.											T
Template Predicted Secondary structure																																																								.				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		54	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.		.	.	110										.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.												.	.	.	.	.	170					.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.
Query Sequence		P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	E	R	Y	K	H	.	.	.	.	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F
Query Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	Y	I	S	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	S	G	T	V	Q	E	M	S	E	W	V	E	Y	I	T	F	D	G	E	S	P	M	A	N	W	R	R	E	N	G	R	E	K	P	W	R	I	K	Y	W	G	V	G	N	Q	N	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S																	S											T	T			S											S		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		124	.	.	.	.	.																130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
		193	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.		.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
Predicted Secondary structure																																										.
Query SS confidence																																										.
Query Sequence		G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	.	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T
Query Conservation																																										.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.												.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	G	C	G	G	N	M	R	A	E	Y	Y	A	D	L	.	.	.	.	.	.	.	Y	R	Q	F	Q	T	Y	L	R	N	Y	G	D	N	K	L	H	K	I	A	C	G	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T											.	.	.	.	.	.	.							T					T	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.								.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	T	A	D	Y	H	W	T	E	V	L	M	K	Q	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	F	M	H	G	L	S	L	H	Y	Y	T	V	P	G	P	W	E	K	K	G	P	A	T	G	F	T	T	D	E	.	.	.	.	.	.	.	.	W	W	V	T	L	K	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	T	T													G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G		S										S	S		T	T	S				S	S	S						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
							217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.																.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.									.	.	.	.	.	.	.
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370					.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.
Query Sequence		Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	.	.	.	.	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C
Query Conservation																					.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	L	F	M	D	R	L	V	T	K	H	S	A	I	M	D	V	Y	D	P	D	K	R	I	D	L	I	V	D	E	W	G	T	W	Y	D	V	E	P	G	T	N	P	G	F	L	Y	Q	Q	N	S	I	R	D	A	L	V	A	G	A	T	L	H	I	F	H	R	H	C	D	R	V	R	M	A	N	I	A	Q	L
Template Known Secondary structure																					T	T			S														S	T	T	S		G	G	G						B																	T	T	T	T									S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
		428	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V	I	A	S	N	G	E	K	L
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	N	V	L	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	V	I	L	T	E	.	.	.	.	.	.	.	G	E	R	M	L	L	T	P	T	Y	H	V	F	N	M	F	K	V	H	Q	D	A	E	L
Template Known Secondary structure		B	S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S					.	.	.	.	.	.	.	T	T														G	G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		349	350	.	.	.											.	.	.	.	.	.								360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.