Job Description Q46829 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 451 % Identity 28% Template c2rgmA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:beta-glucosidase; PDBTitle: rice bglu1 beta-glucosidase, a plant exoglucanase/beta-glucosidase Resolution 1.55 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	K	K	L	T	L	P	K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E
Query Conservation
Alig confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	S	R	A	A	F	P	K	R	F	V	F	G	T	V	T	S	A	Y	Q	V	E	G	M	A	A	S	G	G	R	G	P	S	I	W	D	A	F	A	H	T	P	G	N	V	A	G	N	Q	N	G	D	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	T	D	Q	Y	H	R	Y	K	E	D	V	N	L	M	K	S
Template Known Secondary structure			S	G	G	G	S		T	T																T	T	S	T	T				B							T	S	T	T	S	S	G	G	G			S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.											.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	G	F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E
Query Conservation
Alig confidence																					.
Template Conservation																					.
Template Sequence		L	N	F	D	A	Y	R	F	S	I	S	W	S	R	I	F	P	D	G	.	E	G	R	V	N	Q	E	G	V	A	Y	Y	N	N	L	I	N	Y	L	L	Q	K	G	I	T	P	Y	V	N	L	Y	H	Y	D	L	P	L	A	L	E	K	K	Y	G	G	W	L	N	A	K	M	A	D	L	F	T	E	Y	A	D
Template Known Secondary structure		T	T														S	T	T	S	.	S	S																				T	T									S	S			B									G	G	G	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																					.
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.		.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.				.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																							.																																	.	.	.
Query SS confidence																																							.																																	.	.	.
Query Sequence		V	V	F	E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	.	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	.	.	.	I	N	P	E	M	K	V
Query Conservation																																							.																																	.	.	.
Alig confidence																																							.																																	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	C	F	K	T	F	G	N	R	V	K	H	W	F	T	F	N	E	P	R	I	V	A	L	L	G	Y	D	Q	G	T	N	P	P	K	R	C	T	K	C	A	A	G	G	N	S	A	T	E	P	Y	I	V	A	H	N	F	L	L	S	H	A	A	A	V	A	R	Y	R	T	K	Y	Q	A	A	Q	Q	G	K	V
Template Known Secondary structure								T	T	T																			T	S			S	T	T				T	T		T	T				T	T	T																								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.		.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.
Query SS confidence																														.
Query Sequence		G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	.	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y
Query Conservation																														.
Alig confidence																														.																									.	.	.
Template Conservation																																																							.	.	.
Template Sequence		G	I	V	L	D	F	N	W	Y	E	A	L	S	N	S	T	E	D	Q	A	A	A	Q	R	A	R	D	F	H	I	G	W	Y	L	D	P	L	I	N	G	H	Y	P	Q	I	M	Q	D	L	V	K	D	R	.	.	.	L	P	K	F	T	P	E	Q	A	R	L	V	K	G	S	A	D	Y	I	G	I	N	Q	Y
Template Known Secondary structure													S	S	S	S															T										S	S										G	G	G	.	.	.	S												T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.
Template SS confidence
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.				.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.											.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.		.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Query Sequence		M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	.	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template Conservation
Template Sequence		T	A	S	Y	M	K	G	Q	Q	L	M	Q	Q	T	P	T	S	Y	S	A	D	W	Q	V	T	Y	V	F	A	K	N	G	K	P	I	G	P	Q	A	N	S	N	W	L	Y	I	V	P	W	G	M	Y	G	C	V	N	Y	I	K	Q	K	Y	G	N	P	T	V	V	I	T	E	N	G	M	D	Q	P	A	N	L
Template Known Secondary structure																							T									T	T			S	S		B		S	S	T	T		B			T														T	T															S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N
Query Conservation
Alig confidence																													.																							.														.	.	.	.	.
Template Conservation																													.																							.														.	.	.	.	.
Template Sequence		S	R	D	Q	Y	L	R	D	T	T	R	V	H	F	Y	R	S	Y	L	T	Q	L	K	K	A	I	D	.	E	G	A	N	V	A	G	Y	F	A	W	S	L	L	D	N	F	E	W	L	S	G	.	Y	T	S	K	F	G	I	V	Y	V	D	F	N	.	.	.	.	.	T	L	E	R	H	P	K	A	S	A	Y
Template Known Secondary structure																													.	T	T											S	B					G	G	G	G	.	G	G					S					T	T	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																													.																							.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.		.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.		.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.						.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
		467	.	.	470	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	Y	K	E	V	I	A	S
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		W	F	R	D	M	L	K	H
Template Known Secondary structure							T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		469	470	.	.	.	.	.	.